El RI tiene un contenido de cisteína sorprendentemente alto (~6,5 %, cf. 1,7 % en proteínas típicas) y es sensible a la oxidación. El RI también es rico en leucina (21,5 %, en comparación con el 9 % en proteínas típicas) y proporcionalmente más bajo en otros residuos hidrófobos, esp. valina , isoleucina , metionina , tirosina y fenilalanina .
Estructura
La RI es la clásica proteína repetida rica en leucina, que consta de hélices α y cadenas β alternadas a lo largo de su estructura principal. Estos elementos de estructura secundaria se envuelven en un solenoide curvado y dextrógiro que se asemeja a una herradura . Las cadenas β y las hélices α paralelas forman la pared interna y externa de la herradura, respectivamente. La estructura parece estar estabilizada por asparaginas enterradas en la base de cada vuelta, a medida que pasa de la hélice α a la cadena β. Las repeticiones αβ alternan entre 28 y 29 residuos de longitud, formando efectivamente una unidad de 57 residuos que corresponde a su estructura genética (cada exón codifica una unidad de 57 residuos).
Unión a ribonucleasas
La afinidad de RI por las ribonucleasas es una de las más altas para cualquier interacción proteína-proteína ; la constante de disociación del complejo RI - RNasa A está en el rango femtomolar (fM) en condiciones fisiológicas. A pesar de esta alta afinidad, RI es capaz de unirse a una amplia variedad de RNasas A a pesar de su identidad de secuencia relativamente baja . Tanto los estudios bioquímicos como las estructuras cristalográficas de los complejos RI-RNasa A sugieren que la interacción está gobernada en gran medida por interacciones electrostáticas , pero también involucra un área de superficie enterrada sustancial . [3] [4] La afinidad de RI por las ribonucleasas es importante, ya que muchas ribonucleasas tienen efectos citotóxicos y citostáticos que se correlacionan bien con la capacidad de unirse a RI. [5]
Las RI de mamíferos no pueden unirse a ciertos miembros de la familia de ribonucleasas pancreáticas de otras especies. En particular, las ARNasas de anfibios , como la ranpirnasa y la anfinasa de la rana leopardo del norte , escapan a las RI de mamíferos y se ha observado que tienen una citotoxicidad diferencial contra las células cancerosas . [6]
^ ab PDB : 2BNH ; Kobe B, Deisenhofer J (1993). "Estructura cristalina del inhibidor de la ribonucleasa porcina, una proteína con repeticiones ricas en leucina". Nature . 366 (6457): 751–6. Bibcode :1993Natur.366..751K. doi :10.1038/366751a0. PMID 8264799. S2CID 34579479.
^ Shapiro R (2001). "Inhibidor de la ribonucleasa citoplasmática". Ribonucleasas - Parte A. Métodos en enzimología. Vol. 341. págs. 611–28. doi :10.1016/S0076-6879(01)41180-3. ISBN9780121822422. Número de identificación personal 11582809.
^ Lee FS, Shapiro R, Vallee BL (enero de 1989). "Inhibición de la unión estrecha de la angiogenina y la ribonucleasa A por el inhibidor de la ribonucleasa placentaria". Bioquímica . 28 (1): 225–30. doi :10.1021/bi00427a031. PMID 2706246.
^ Papageorgiou AC, Shapiro R, Acharya KR (septiembre de 1997). "Reconocimiento molecular de la angiogenina humana por el inhibidor de la ribonucleasa placentaria: un estudio cristalográfico de rayos X con una resolución de 2,0 A". The EMBO Journal . 16 (17): 5162–77. doi :10.1093/emboj/16.17.5162. PMC 1170149 . PMID 9311977.
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^ Ardelt W, Shogen K, Darzynkiewicz Z (junio de 2008). "Onconasa y anfinasa, las ribonucleasas antitumorales de los ovocitos de Rana pipiens". Current Pharmaceutical Biotechnology . 9 (3): 215–25. doi :10.2174/138920108784567245. PMC 2586917 . PMID 18673287.
Lectura adicional
Kobe B, Deisenhofer J (marzo de 1995). "Una base estructural de las interacciones entre repeticiones ricas en leucina y ligandos proteicos". Nature . 374 (6518): 183–6. Bibcode :1995Natur.374..183K. doi :10.1038/374183a0. PMID 7877692. S2CID 4364436.
Kobe B, Deisenhofer J (diciembre de 1996). "Mecanismo de inhibición de la ribonucleasa por la proteína inhibidora de la ribonucleasa basado en la estructura cristalina de su complejo con la ribonucleasa A". Journal of Molecular Biology . 264 (5): 1028–43. doi :10.1006/jmbi.1996.0694. PMID 9000628.
Papageorgiou AC, Shapiro R, Acharya KR (septiembre de 1997). "Reconocimiento molecular de la angiogenina humana por un inhibidor de la ribonucleasa placentaria: un estudio cristalográfico de rayos X con una resolución de 2,0 A". The EMBO Journal . 16 (17): 5162–77. doi :10.1093/emboj/16.17.5162. PMC 1170149 . PMID 9311977.
Suzuki M, Saxena SK, Boix E, Prill RJ, Vasandani VM, Ladner JE, Sung C, Youle RJ (marzo de 1999). "Ingeniería de la citotoxicidad mediada por receptores en ribonucleasas humanas mediante bloqueo estérico de la interacción con inhibidores". Nature Biotechnology . 17 (3): 265–70. doi :10.1038/7010. PMID 10096294. S2CID 23140257.
Shapiro R, Ruiz-Gutierrez M, Chen CZ (septiembre de 2000). "Análisis de las interacciones del inhibidor de la ribonucleasa humana con la angiogenina y la ribonucleasa A mediante mutagénesis: importancia de los residuos del inhibidor dentro y fuera del "punto caliente" C-terminal"". Revista de Biología Molecular . 302 (2): 497–519. doi :10.1006/jmbi.2000.4075. PMID 10970748.
Bretscher LE, Abel RL, Raines RT (abril de 2000). "Una variante de la ribonucleasa A con baja actividad catalítica pero alta citotoxicidad". The Journal of Biological Chemistry . 275 (14): 9893–6. doi : 10.1074/jbc.275.14.9893 . PMID 10744660.
Yakovlev GI, Mitkevich VA, Makarov AA (2006). "Inhibidores de la ribonucleasa". Biología molecular . 40 (6): 867–874. doi :10.1134/S0026893306060045. S2CID 31887913.