Los identificadores de ciencias biológicas [1] [2] son una forma de nombrar y localizar información en la web. Básicamente, un LSID es un identificador único para algunos datos y el protocolo LSID especifica una forma estándar de localizar los datos (así como una forma estándar de describir esos datos). Se parecen un poco a los DOI que utilizan muchos editores.
Un LSID se representa como un nombre de recurso uniforme (URN) con el siguiente formato:
urn:lsid:⟨Authority⟩:⟨Namespace⟩:⟨ObjectID⟩[:⟨Version⟩]El espacio de nombres lsid:, sin embargo, no está registrado con la Autoridad de Números Asignados de Internet (IANA), por lo que no son estrictamente URN o URI. [3]
Los LSID se pueden resolver en URL, por ejemplo, http://zoobank.org/urn:lsid:zoobank.org:pub:CDC8D258-8F57-41DC-B560-247E17D3DC8C
Ha habido mucho interés en los LSID tanto en la comunidad de bioinformática como en la de biodiversidad , y esta última continúa utilizándolos como una forma de identificar especies en catálogos globales. [4] Sin embargo, más recientemente, a medida que ha aumentado la comprensión de cómo los URI HTTP pueden realizar una tarea de denominación similar, [5] [6] el uso de LSID como identificadores ha sido criticado [7] por violar las buenas prácticas de reutilización de la arquitectura web. esquemas URI existentes. [8] Sin embargo, la separación explícita entre datos y metadatos; especificación de un método para descubrir múltiples ubicaciones para la recuperación de datos; y la capacidad de descubrir múltiples fuentes independientes de metadatos para cualquier elemento identificado fueron partes cruciales del LSID y su especificación de resolución que no han sido imitadas con éxito mediante un enfoque solo HTTP.
La World Wide Web proporciona un marco de comunicación distribuido globalmente que es esencial para casi toda colaboración científica, incluida la bioinformática. Sin embargo, se pensaba que existían varios límites e insuficiencias, uno de los cuales era la incapacidad de identificar mediante programación objetos con nombres locales que pudieran estar ampliamente distribuidos en la red. Esta deficiencia percibida habría limitado nuestra capacidad para integrar múltiples bases de conocimiento, cada una de las cuales proporciona información parcial de un dominio compartido, como se ve comúnmente en bioinformática. El Identificador de Ciencias de la Vida (LSID) y el Sistema de Resolución LSID (LSRS) fueron diseñados para proporcionar soluciones simples y elegantes a este problema, consistentes con la Web Semántica y la red semántica de próxima generación , basadas en la extensión de las tecnologías de Internet existentes. Sin embargo, más recientemente se ha señalado que algunas de estas deficiencias percibidas no son intrínsecas a los URI HTTP, y gran parte (aunque no toda) de la funcionalidad que proporcionan los LSID se puede obtener utilizando URI HTTP correctamente diseñados. [5]
Se han propuesto identificadores alternativos para organismos, por ejemplo, el sistema DOI . NamesforLife (N4L), una empresa privada, creó un sistema para aplicar DOI a organismos. Por ejemplo, doi:10.1601/nm.3093 es el DOI de Escherichia coli y doi:10.1601/tx.3093 es el taxón correspondiente. [9]