stringtranslate.com

gelatinasa

Las gelatinasas son enzimas capaces de degradar la gelatina mediante hidrólisis , desempeñando un papel importante en la degradación de la matriz extracelular y la remodelación de los tejidos . Las gelatinasas son un tipo de metaloproteinasas de matriz (MMP), una familia de enzimas que dependen del zinc como cofactor y pueden descomponer partes de la matriz extracelular . [1] Las MMP tienen múltiples subgrupos, incluidas la gelatinasa A ( MMP-2 ) y la gelatinasa B  ( MMP-9 ). A las gelatinasas se les asigna una variedad de números de la Comisión de Enzimas : la gelatinasa A usa 3.4.24.24 y la gelatinasa B usa 3.4.24.35, en la que los primeros tres números son iguales. El primer dígito, 3, es la clase. Las enzimas de clase 3 son las hidrolasas , enzimas que catalizan reacciones de hidrólisis, es decir, rompen enlaces en presencia de agua. El siguiente dígito representa la subclase 4, o proteasas , que son enzimas que hidrolizan los enlaces peptídicos en las proteínas. El siguiente número es la subsubclase de 24, que consta de metaloendopeptidasas que contienen iones metálicos en sus sitios activos, en este caso zinc, que ayudan a romper los enlaces peptídicos. La última parte del número EC es el número de serie, que identifica enzimas específicas dentro de una subsubclase. 24 representa la gelatinasa A, que es una metaloproteinasa que descompone la gelatina y el colágeno, mientras que 35 representa la gelatinasa B, que hidroliza los enlaces peptídicos. [2]

Aplicación de gelatinasa en especies.

Las enzimas gelatinasas se pueden encontrar en varios eucariotas , incluidos mamíferos y aves; bacterias , incluidas Pseudomonas aeruginosa y Serratia marcescens ), y hongos , pero pueden tener variaciones entre especies según la identificación y función del tipo de gelatinasa. En humanos, las gelatinasas expresadas son metaloproteinasas de matriz MMP2 y MMP9 . [3] Además, se ha demostrado que las gelatinasas A (MMP2) y B (MMP9) ayudan a desarrollar nuevos vasos sanguíneos en las córneas de ratas y conejos cuando experimentan daño corneal. Las heridas corneales en estos roedores pueden producir una mayor expresión y actividad de la enzima. La gelatinasa ayuda a remodelar la matriz extracelular (EMC) dañada eliminando las proteínas de la matriz dañadas (mediante MMP-9), lo que produce una respuesta angiogénica o la formación de nuevos vasos sanguíneos. Esto indica que hay remodelación de colágeno en el tejido de reparación del estroma corneal con gelatinasas. [4]

Vía enzimática

Estas proteasas específicas utilizan la hidrólisis para descomponer la gelatina mediante dos pasos secuenciales. El primero produce productos polipeptídicos, seguidos de aminoácidos (típicamente alfa aminoácidos). [5] El sustrato en este caso es la gelatina y los productos son los polipéptidos formados. La gelatinasa se une al sustrato, la gelatina, debido a la especificidad de las interacciones de unión en la superficie celular. La catálisis, asociada con un ion zinc y residuos de aminoácidos, rompe los enlaces peptídicos en polipéptidos mediante escisión. Los polipéptidos se convierten además en aminoácidos, el segundo paso secuencial y producto de la reacción. Proteínas adicionales, como TIMP-2 y otras TIMP , funcionan como inhibidores para regular y controlar la vía enzimática uniéndose al sitio activo de la gelatinasa, lo que previene la degradación del sustrato. [6]

Asociación de superficie celular

Las gelatinasas pueden regular la activación y actividad enzimática mediante interacciones en la superficie celular. Las proteínas de superficie regulan funciones como la localización, la inhibición y la internalización. La unión de la enzima a la superficie la acerca a ciertos sustratos en el espacio pericelular para regular la función de las MMP. La localización les permite degradar elementos específicos de la EMC mediante una estrecha asociación con la superficie celular. [7]

Estructuras cristalinas

Las gelatinasas contienen un dominio catalítico (ubicado en la región C-terminal), que es esencial para la actividad enzimática y la hidrólisis de enlaces peptídicos en moléculas de sustrato. Este dominio contiene cinco cadenas beta en una hoja beta retorcida unidas por tres hélices alfa . El sitio activo está ubicado entre una cadena beta y una hélice alfa, que contiene residuos de histidina , con otra hélice que contiene un residuo de histidina, creando bucles. Estas histidinas están en relación con un ion de zinc catalítico, desempeñando un papel importante en la catalización de la hidrólisis de los enlaces peptídicos en las proteínas. Además, en la región C terminal, hay un dominio similar a la hemopexina, que interactúa con una parte de la membrana celular. [8] Contribuyendo a la especificidad, afinidad y localización de las enzimas, está formado por cuatro láminas con láminas beta con cadenas beta antiparalelas. [9] Además, existe la fibronectina tipo II (FNII), importante para el reconocimiento, el plegamiento y la mediación de las interacciones de la gelatina debido a la participación de las interacciones proteína-proteína, y son cruciales para la especificidad del sustrato. FNII consta de dos láminas beta antiparalelas de doble hebra. Las estructuras primarias de las MMP individuales pueden tener diferentes composiciones de dominios, y la disposición de los dominios y estructuras ayuda con el plegamiento y la estabilidad de la enzima, ya que el plegamiento es lo que promueve la actividad enzimática.

Sitios activos

Algunas de las gelatinasas son proteinasas que dependen del zinc. Los sitios activos conocidos de estas proteínas están ubicados en los dominios catalíticos y normalmente contienen un átomo de zinc en un sitio conocido, que es importante para la catálisis. Los sitios activos también contienen residuos de histidina y glutamato , lo que establece la región del sitio activo catalítico de unión al zinc. [10] Estos residuos están en coordinación con el ion zinc para la estabilización y conformación. Este sitio activo ayuda a la hidrólisis de enlaces peptídicos en sustratos, como gelatina y colágeno, debido a la coordinación de iones de zinc y residuos de aminoácidos . También influyen en la catálisis de la gelatinasa y la unión de sustratos. [11]

Referencias

  1. ^ Gerlach, Raquel F.; Meschiari, César A.; Marcaccini, Andrea M.; Palei, Ana CT; Sandrim, Valeria C.; Cavalli, Ricardo C.; Tanus-Santos, José E. (1 de julio de 2009). "Correlaciones positivas entre los niveles de metaloproteinasa de la matriz plasmática (MMP) -2 o MMP-9 en suero y plasma en condiciones de enfermedad". Química Clínica y Medicina de Laboratorio . 47 (7): 888–891. doi :10.1515/CCLM.2009.203. ISSN  1437-4331.
  2. ^ Blanco, John S.; Blanco, Dorothy C. (10 de julio de 1997). Libro de consulta de enzimas. Prensa CRC. ISBN 978-0-8493-9470-6.
  3. ^ "Gelatinasa". Diccionario médico . Farlex y socios. 2009 . Consultado el 4 de agosto de 2023 , a través de The Free Dictionary.
  4. ^ Fini, M. Elizabeth; Girard, Marie T.; Matsubara, Masao (28 de mayo de 2009). "Enzimas colagenolíticas/gelatinolíticas en la cicatrización de heridas corneales". Acta Oftalmológica . 70 (S202): 26–33. doi :10.1111/j.1755-3768.1992.tb02165.x.
  5. ^ Ekpenyong M, Asitok A, Odey A, Antai S (2016). "Cinética de producción y actividad de gelatinasa por Serratia sp.SLO3". Revista nigeriana de biopesticidas . 1 (1): 70–82 . Consultado el 18 de abril de 2024 a través de ResearchGate.
  6. ^ Murphy, Gillian; Docherty, Andrew JP (1992). "Las metaloproteinasas de matriz y sus inhibidores". Revista Estadounidense de Biología Molecular y Celular Respiratoria . 7 (2): 120–125. doi :10.1165/ajrcmb/7.2.120.
  7. ^ Fridman, Rafael; Toth, Marta; Chvyrkova, Irina; Meroueh, Samy O.; Mobashery, Shahriar (1 de junio de 2003). "Asociación de superficie celular de metaloproteinasa-9 de matriz (gelatinasa B)". Reseñas de cáncer y metástasis . 22 (2): 153–166. doi :10.1023/A:1023091214123. ISSN  1573-7233.
  8. ^ Tordai, Eduvig; Patthy, László (enero de 1999). "El sitio de unión a gelatina del segundo dominio de tipo II de la gelatinasa A/MMP-2". Revista europea de bioquímica . 259 (1–2): 513–518. doi :10.1046/j.1432-1327.1999.00070.x. ISSN  0014-2956.
  9. ^ Libson, Andrew M.; Gittis, Apostolos G.; Collier, Iván E.; Marmer, Barry L.; Goldberg, Gregorio I.; Lattman, Eaton E. (noviembre de 1995). "Estructura cristalina del dominio C-terminal similar a hemopexina de la gelatinasa A". Biología estructural de la naturaleza . 2 (11): 938–942. doi :10.1038/nsb1195-938. ISSN  1545-9985.
  10. ^ Fridman, Rafael; Toth, Marta; Chvyrkova, Irina; Meroueh, Samy O.; Mobashery, Shahriar (1 de junio de 2003). "Asociación de superficie celular de metaloproteinasa-9 de matriz (gelatinasa B)". Reseñas de cáncer y metástasis . 22 (2): 153–166. doi :10.1023/A:1023091214123. ISSN  1573-7233.
  11. ^ Kleifeld O, Van den Steen PE, Frenkel A, Cheng F, Jiang HL, Opdenakker G, Sagi I (noviembre de 2000). "Caracterización estructural del sitio activo catalítico en la gelatinasa B natural latente y activa de neutrófilos humanos". Revista de Química Biológica . 275 (44): 34335–34343. doi : 10.1074/jbc.M005714200 . PMID  10938090.