El virus Playa de Oro ( OROV ) es una especie probable de ortohantavirus que se encuentra en los roedores Oryzomys couesi y Sigmodon mascotensis en el estado mexicano de Colima . Se cree que el primero es el huésped principal . Se han determinado las secuencias de partes del genoma basado en ARN del virus ; difieren en un 7-10% en la composición de aminoácidos y en un 22-24% en la composición de nucleótidos de los virus estrechamente relacionados.
El virus Playa de Oro fue identificado como una nueva especie en 2008 y está más estrechamente relacionado con el virus Bayou , el virus Catacamas , el virus Muleshoe y el virus Black Creek Canal , que se encuentran en otras especies de Oryzomys y Sigmodon . El virus Catacamas se encuentra en una población diferente de Oryzomys couesi , y la presencia de diferentes virus en estas dos especies se ha utilizado como argumento para clasificar las dos poblaciones del huésped como especies separadas.
El virus Playa de Oro fue identificado por primera vez en roedores recolectados en 2004 como parte de un estudio de mamíferos salvajes en Playa de Oro en Manzanillo , Colima , oeste de México. El descubrimiento fue publicado en 2008 por Yong-Kyu Chu y colegas. [1] Entre 600 mamíferos pequeños, se encontraron anticuerpos contra el virus hantavirus Sin Nombre en 23 individuos (de 358 estudiados) de Oryzomys couesi , una rata arrocera que fue la especie más común encontrada, seis (de 87) de la rata del algodón Sigmodon mascotensis y uno (de 77) del ratón pigmeo Baiomys musculus . Además, doce O. couesi y un S. mascotensis produjeron ARN de hantavirus . Los virus se encontraron en machos con más frecuencia que en hembras. [2] Debido a que las secuencias de aminoácidos en las partes secuenciadas del genoma del virus diferían entre un 7 y un 10 % de las de otros hantavirus estrechamente relacionados, Chu y sus colegas identificaron el virus encontrado en Playa de Oro como una nueva especie, llamada virus Playa de Oro u OROV. Aunque los autores no pudieron demostrar que el virus cumpliera con todos los criterios para identificar una nueva especie de virus, argumentaron que era probable que sí cumpliera con esos criterios. [3] Actualmente se lo trata como una especie probable del género Hantavirus . [4]
Los hantavirus tienen un genoma que consta de tres segmentos de ARN monocatenario de sentido negativo (ver Virus ARN: Replicación ), llamados segmentos grande (L), mediano (M) y pequeño (S). [2] Se ha secuenciado todo el segmento S y un fragmento del segmento M. [5]
El segmento S consta de 1953 bases, de las cuales 1287 (a partir de la posición 43) codifican la proteína de la nucleocápside . Además, un segundo marco de lectura abierto de 192 bases se produce en el medio de esta secuencia (a partir de la posición 122), como en varios otros hantavirus. Entre tres especímenes de O. couesi , la secuencia en este segmento difería solo en un 1%, y todos los cambios fueron mutaciones silenciosas . Los aminoácidos del segmento S difieren entre un 7 y un 10% de los de los hantavirus relacionados Bayou virus (BAYV; de la rata del arroz de los pantanos , Oryzomys palustris ), Catacamas virus (CATV; de una población hondureña de Oryzomys couesi ) y Black Creek Canal virus (BCCV; de la rata algodonera híspida , Sigmodon hispidus ). La secuencia de nucleótidos difiere en un 24% de esos virus. [5]
Entre los fragmentos de 1537 bases de la secuencia del segmento M se observaron varios sitios variables, incluidas algunas mutaciones no silenciosas. La secuencia difiere entre un 8 y un 10 % de la de BAYV, CATV y BCCV en términos de aminoácidos y en un 22 % en términos de nucleótidos. [5]
Debido a que el OROV se presenta con frecuencia en Oryzomys couesi , Chu y sus colegas sugirieron que es el huésped primario del virus y que las infecciones en Sigmodon mascotensis son el resultado de un contagio entre estas dos especies de roedores, que se presentan en estrecha relación. [6] El síndrome pulmonar por hantavirus , la enfermedad causada por hantavirus como el virus Sin Nombre, nunca se ha reportado en México, pero se han encontrado anticuerpos contra hantavirus en muestras de sangre humana en Yucatán y se sabe que varios roedores salvajes son reservorios de especies de hantavirus. [7] Por lo tanto, existe un riesgo potencial de infección por OROV en humanos. [8] Antes del descubrimiento de OROV, se había identificado una especie de hantavirus en México: el virus El Moro Canyon del pequeño roedor Reithrodontomys megalotis . [9]
Según los análisis filogenéticos basados en las secuencias de los segmentos S y M, OROV está más estrechamente relacionado con el clado formado por BAYV, CATV, BCCV y el virus Muleshoe (MUL; de la rata algodonera híspida). [10] En 2009, Piet Maes y colegas propusieron que los estrechamente relacionados BAYV, BCCV y MUL se unieran en una sola especie. [11] Chu y colegas se sorprendieron al encontrar que la misma especie, Oryzomys couesi , albergaba diferentes virus (OROV y CATV), aunque notaron que las subespecies infectadas por los dos virus eran diferentes. [12] En 2010, Delton Hanson y colegas sugirieron sobre la base de varias líneas de evidencia, incluida la presencia de diferentes hantavirus, que las poblaciones occidentales mexicanas de Oryzomys couesi representan una especie diferente, Oryzomys mexicanus . [13]