stringtranslate.com

Pío

"El dominio piwi de una proteína argonauta con ARNip unido , componentes del complejo silenciador inducido por ARN que media el silenciamiento de genes mediante interferencia de ARN" .
Todas las proteínas Piwi y argonautas humanas tienen los mismos dominios de unión a ARN, PAZ y Piwi. [2]
Interacciones piwi-piRNA: dentro del núcleo, esta vía está involucrada en la metilación del ADN (A), la metilación de histonas de H3K9 a través de interacciones con la proteína heterocromatina 1 (HP1) y la histona metiltransferasa H3K9 (B). La vía Piwi-piRNA también interactúa con el iniciador de traducción elF (C). [3]

Los genes Piwi (o PIWI ) se identificaron como proteínas reguladoras responsables de la diferenciación de células madre y germinales . [4] Piwi es una abreviatura de testículo WI mpy inducido por elemento P [ a] en Drosophila . [6] Las proteínas Piwi son proteínas de unión a ARN altamente conservadas y están presentes tanto en plantas como en animales. [7] Las proteínas Piwi pertenecen a la familia Argonaute/Piwi y han sido clasificadas como proteínas nucleares. Los estudios sobre Drosophila también han indicado que las proteínas Piwi no tienen actividad cortadora conferida por la presencia del dominio Piwi. [8] Además, Piwi se asocia con la proteína heterocromatina 1 , un modificador epigenético y secuencias complementarias de ARNpi. Estos son indicios del papel que desempeña Piwi en la regulación epigenética. También se cree que las proteínas Piwi controlan la biogénesis del piRNA, ya que muchas proteínas similares a Piwi contienen actividad de corte que permitiría a las proteínas Piwi procesar el piRNA precursor en piRNA maduro.

Estructura y función de las proteínas.

Se ha resuelto la estructura de varias proteínas Piwi y Argonaute (Ago). Las proteínas Piwi son proteínas de unión a ARN con 2 o 3 dominios : el dominio PAZ N-terminal se une al extremo 3' del ARN guía; el dominio MID medio se une al 5'-fosfato del ARN; y el dominio PIWI C-terminal actúa como una endonucleasa RNasa H que puede escindir el ARN. [9] [10] Los pequeños ARN asociados de las proteínas Ago son microARN (miARN). Las proteínas Ago utilizan miARN para silenciar genes postranscripcionalmente o utilizan ARN de pequeña interferencia (ARNip) en los mecanismos de silenciamiento tanto de transcripción como postranscripción. Las proteínas Piwi interactúan con piRNA (28 a 33 nucleótidos) que son más largos que los miRNA y siRNA (~20 nucleótidos), lo que sugiere que sus funciones son distintas de las de las proteínas Ago. [9]

Proteínas del pío humano

Actualmente hay cuatro proteínas humanas Piwi conocidas: proteína similar a PIWI 1, proteína similar a PIWI 2, proteína similar a PIWI 3 y proteína similar a PIWI 4. Todas las proteínas humanas Piwi contienen dos dominios de unión a ARN, PAZ y Piwi. Las cuatro proteínas similares a PIWI tienen un sitio de unión espacioso dentro del dominio PAZ que les permite unirse al voluminoso 2'-OCH3 en el extremo 3' del ARN que interactúa con piwi . [11]

Uno de los principales homólogos humanos , cuya regulación positiva está implicada en la formación de tumores como los seminomas , se llama hiwi ( para humano p iwi ). [12]

Las proteínas homólogas en ratones han sido llamadas miwi (para ratón piwi ) . [13]

Papel en las células de la línea germinal.

Las proteínas PIWI desempeñan un papel crucial en la fertilidad y el desarrollo de la línea germinal en animales y ciliados. Identificadas recientemente como un componente de los gránulos polares, las proteínas PIWI parecen controlar la formación de células germinales hasta tal punto que, en ausencia de proteínas PIWI, hay una disminución significativa en la formación de células germinales. Se hicieron observaciones similares con los homólogos de ratón de PIWI, MILI, MIWI y MIWI2. Se sabe que estos homólogos están presentes en la espermatogénesis. Miwi se expresa en varias etapas de formación de espermatocitos y elongación de espermátidas donde Miwi2 se expresa en células de Sertoli . Los ratones con deficiencia de Mili o Miwi-2 experimentaron una detención de las células madre espermatogénicas y los que carecían de Miwi-2 sufrieron una degradación de las espermatogonias. [14] Los efectos de las proteínas piwi en líneas germinales humanas y de ratón parecen derivarse de su participación en el control de la traducción, ya que se sabe que Piwi y el pequeño ARN no codificante, el ARN que interactúa con piwi (piRNA), cofraccionan polisomas. La vía piwi-piRNA también induce la formación de heterocromatina en los centrómeros , [15] afectando así la transcripción. La vía piwi-piRNA también parece proteger el genoma. Observadas por primera vez en Drosophila, las vías mutantes piwi-piRNA condujeron a un aumento directo de las roturas del dsDNA en las células germinales del ovario. El papel de la vía piwi-piRNA en el silenciamiento de transposones puede ser responsable de la reducción de las roturas del dsDNA en las células germinales.

Papel en la interferencia del ARN

El dominio piwi [16] es un dominio proteico que se encuentra en las proteínas piwi y en una gran cantidad de proteínas de unión a ácidos nucleicos relacionadas , especialmente aquellas que se unen y escinden el ARN . La función del dominio es la hidrólisis guiada por ARN bicatenario de ARN monocatenario que se ha determinado en la familia argonauta de proteínas relacionadas. [1] Los argonautas, la familia mejor estudiada de proteínas de unión a ácidos nucleicos, son enzimas similares a la RNasa H que llevan a cabo las funciones catalíticas del complejo silenciador inducido por ARN (RISC). En el conocido proceso celular de interferencia de ARN , la proteína argonauta del complejo RISC puede unirse tanto a pequeños ARN de interferencia (ARNip) generados a partir de ARN bicatenario exógeno como a microARN (miARN) generados a partir de ARN endógeno no codificante , ambos producidos por la ribonucleasa Dicer , para formar un complejo ARN-RISC. Este complejo se une y escinde el ARN mensajero de emparejamiento de bases complementarias , destruyéndolo e impidiendo su traducción en proteína. Los dominios piwi cristalizados tienen un sitio de unión básico conservado para el extremo 5' del ARN unido; en el caso de proteínas argonautas que se unen a cadenas de ARNip, la última base nucleotídica desapareada del ARNip también se estabiliza mediante interacciones de apilamiento de bases entre la base y los residuos de tirosina vecinos . [17]

La evidencia reciente sugiere que el papel funcional de las proteínas piwi en la determinación de la línea germinal se debe a su capacidad para interactuar con los miARN. Los componentes de la vía de los miARN parecen estar presentes en el polo plasma y desempeñar un papel clave en el desarrollo temprano y la morfogénesis de los embriones de Drosophila melanogaster , en los que se ha estudiado ampliamente el mantenimiento de la línea germinal. [18]

piRNA y silenciamiento de transposones

Se ha definido en células de mamíferos una nueva clase de miARN más largos que el promedio, conocidos como ARN que interactúan con Piwi (piARN), de aproximadamente 26 a 31 nucleótidos de largo en comparación con los miARN o siARN más típicos de aproximadamente 21 nucleótidos. Estos piRNA se expresan principalmente en células espermatogénicas de los testículos de los mamíferos. [19] Pero los estudios han informado que la expresión de ARNpi se puede encontrar en las células somáticas de los ovarios y en las células neuronales de los invertebrados, así como en muchas otras células somáticas de los mamíferos. Se han identificado piARN en los genomas de ratones , ratas y humanos , con una organización genómica "agrupada" inusual [20] que puede originarse a partir de regiones repetitivas del genoma como retrotransposones o regiones normalmente organizadas en heterocromatina , y que normalmente se derivan exclusivamente de la cadena antisentido de ARN bicatenario. [21] Por lo tanto, los piRNA se han clasificado como pequeños ARN de interferencia asociados a repeticiones ( rasiRNA ). [22]

Aunque su biogénesis aún no se comprende bien, se cree que los ARNpi y las proteínas Piwi forman un sistema endógeno para silenciar la expresión de elementos genéticos egoístas como los retrotransposones y así evitar que los productos genéticos de tales secuencias interfieran con la formación de células germinales. [21] [23]

Notas a pie de página

  1. ^ La palabra Wimpy en sí proviene del color blanco de ojos e impotencia [o infertilidad profunda]. Se añade Y como sufijo para formar una palabra más pronunciable y coherente. [5]

Referencias

  1. ^ ab Rivas FV, ​​Tolia NH, Song JJ, et al. (Abril de 2005). "Argonaute2 purificado y un ARNip forman RISC humano recombinante". Nat. Estructura. Mol. Biol . 12 (4): 340–9. doi :10.1038/nsmb918. PMID  15800637. S2CID  2021813.
  2. ^ "Uniprot: la base de datos de conocimiento universal". Investigación de ácidos nucleicos . 45 (D1): D158-D169. 2017. doi : 10.1093/nar/gkw1099. PMC 5210571 . PMID  27899622. 
  3. ^ Lindse K (2013). "Piwi-RNA, los defensores del genoma". {{cite journal}}: Citar diario requiere |journal=( ayuda )
  4. ^ Cox DN, Chao A, Lin H (2000). "piwi codifica un factor nucleoplásmico cuya actividad modula el número y la tasa de división de las células madre de la línea germinal". Desarrollo . 127 (3): 503–14. doi :10.1242/dev.127.3.503. PMID  10631171.
  5. ^ Ross RJ, Weiner MM, Lin H (2014). "Proteínas PIWI y ARN que interactúan con PIWI en el soma". Naturaleza . 505 (7483): 353–359. Código Bib :2014Natur.505..353R. doi : 10.1038/naturaleza12987 . PMC 4265809 . PMID  24429634. 
  6. ^ Lin H, Spradling AC (1997). "Un nuevo grupo de mutaciones de pumilio afecta la división asimétrica de las células madre de la línea germinal en el ovario de Drosophila". Desarrollo . 124 (12): 2463–2476. doi :10.1242/dev.124.12.2463. PMID  9199372.
  7. ^ Cox DN, Chao A, Baker J, Chang L, Qiao D, Lin H (1998). "Una nueva clase de genes conservados evolutivamente definidos por piwi es esencial para la autorrenovación de las células madre". Desarrollo de genes . 12 (23): 3715–27. doi :10.1101/gad.12.23.3715. PMC 317255 . PMID  9851978. 
  8. ^ Darricarrere N, Liu N, Watanabe T, Lin H (2013). "La función de Piwi, una proteína nuclear Piwi/Argonaute, es independiente de su actividad cortadora". Proc Natl Acad Sci Estados Unidos . 110 (6): 1297-1302. Código Bib : 2013PNAS..110.1297D. doi : 10.1073/pnas.1213283110 . PMC 3557079 . PMID  23297219. 
  9. ^ ab Zeng, Lei; Zhang, Qiang; Yan, Kelley; Zhou, Ming-Ming (1 de junio de 2011). "Conocimientos estructurales sobre el reconocimiento de piRNA por parte del dominio 1 PAZ similar a PIWI humano". Proteínas: estructura, función y bioinformática . 79 (6): 2004-2009. doi :10.1002/prot.23003. ISSN  1097-0134. PMC 3092821 . PMID  21465557. 
  10. ^ Wei, Kai-Fa; Wu, Ling-Juan; Chen, Juan; Chen, Yan-feng; Xie, Dao-Xin (agosto de 2012). "Análisis de evolución estructural y diversificación funcional de la proteína argonauta". Revista de bioquímica celular . 113 (8): 2576–2585. doi :10.1002/jcb.24133. ISSN  1097-4644. PMID  22415963. S2CID  25990631.
  11. ^ Tian Y, Simanshu D, Ma J, Patel D (2010). "Base estructural para el reconocimiento del extremo 3' 2'-O-metilado de piRNA por los dominios Piwi PAZ (Piwi/Argonaute/Zwille)". Proc. Nacional. Acad. Ciencia. EE.UU . 108 (3): 903–910. doi : 10.1073/pnas.1017762108 . PMC 3024652 . PMID  21193640. 
  12. ^ Qiao D, Zeeman AM, Deng W, Looijenga LH, Lin H (2002). "Caracterización molecular de hiwi, un miembro humano de la familia de genes piwi cuya sobreexpresión se correlaciona con los seminomas". Oncogén . 21 (25): 3988–99. doi : 10.1038/sj.onc.1205505 . PMID  12037681.
  13. ^ Deng W, Lin H (2002). "miwi, un homólogo murino de piwi, codifica una proteína citoplasmática esencial para la espermatogénesis". Célula de desarrollo . 2 (6): 819–30. doi : 10.1016/s1534-5807(02)00165-x . PMID  12062093.
  14. ^ Mani S, Juliano C (2013). "Desenredando la Web: las diversas funciones de la vía PIWI/piRNA". Mol. Reproducción. Desarrollo . 80 (8): 632–664. doi :10.1002/mrd.22195. PMC 4234069 . PMID  23712694. 
  15. ^ Thomson T, LinH (2009). "La biogénesis y función de las proteínas PIWI y los piRNA: avances y perspectivas". Año. Rev. Desarrollo celular. Biol . 25 : 355–376. doi : 10.1146/annurev.cellbio.24.110707.175327. PMC 2780330 . PMID  19575643. 
  16. ^ Cerutti L, Mian N, Bateman A (octubre de 2000). "Dominios en proteínas de silenciamiento génico y diferenciación celular: el nuevo dominio PAZ y redefinición del dominio Piwi". Tendencias Bioquímica. Ciencia . 25 (10): 481–2. doi :10.1016/S0968-0004(00)01641-8. PMID  11050429.
  17. ^ Ma J, Yuan Y, Meister G, Pei Y, Tuschl T, Patel D (2005). "Base estructural para el reconocimiento específico del extremo 5' del ARN guía por parte de la proteína A. fulgidus Piwi". Naturaleza . 434 (7033): 666–70. Código Bib :2005Natur.434..666M. doi : 10.1038/naturaleza03514. PMC 4694588 . PMID  15800629. 
  18. ^ Megosh HB, Cox DN, Campbell C, Lin H (2006). "El papel de PIWI y la maquinaria de miARN en la determinación de la línea germinal de Drosophila". Curr Biol . 16 (19): 1884–94. Código bibliográfico : 2006CBio...16.1884M. doi : 10.1016/j.cub.2006.08.051 . PMID  16949822. S2CID  6397874.
  19. ^ Kim VN (2006). "Los ARN pequeños simplemente se hicieron más grandes: ARN que interactúan con Piwi (piRNA) en testículos de mamíferos". Desarrollo de genes . 20 (15): 1993–7. doi : 10.1101/gad.1456106 . PMID  16882976.
  20. ^ Girard A, Sachidanandam R, Hannon GJ, Carmell MA (2006). "Una clase de ARN pequeños específica de la línea germinal se une a las proteínas Piwi de los mamíferos". Naturaleza . 442 (7099): 199–202. Código Bib :2006Natur.442..199G. doi : 10.1038/naturaleza04917. PMID  16751776. S2CID  3185036.
  21. ^ ab Vagin VV, Sigova A, Li C, Seitz H, Gvozdev V, Zamore PD (2006). "Una pequeña vía de ARN distinta silencia los elementos genéticos egoístas en la línea germinal". Ciencia . 313 (5785): 320–4. Código Bib : 2006 Ciencia... 313.. 320V. doi : 10.1126/ciencia.1129333. PMID  16809489. S2CID  40471466.
  22. ^ Saito K, Nishida KM, Mori T, Kawamura Y, Miyoshi K, Nagami T, Siomi H, Siomi MC (2006). "Asociación específica de Piwi con rasiRNA derivados de retrotransposones y regiones heterocromáticas en el genoma de Drosophila". Desarrollo de genes . 20 (16): 2214–22. doi :10.1101/gad.1454806. PMC 1553205 . PMID  16882972. 
  23. ^ Ozata DM, Gainetdinov I, Zoch A, Phillip D, Zamore PD (2019). "ARN que interactúan con PIWI: ARN pequeños con grandes funciones" (PDF) . Naturaleza Reseñas Genética . 20 (2): 89-108. doi :10.1038/s41576-018-0073-3. PMID  30446728. S2CID  53565676.

enlaces externos