La introducción del cristianismo en Tolemaida , como se conocía a Acre en la antigüedad, se remonta a los tiempos apostólicos . El apóstol Pablo , de regreso de su viaje a Macedonia , en Acaya y Asia , desembarcó en Tiro , y desde allí viajó a Tolemaida, donde permaneció algunos días con la comunidad cristiana local (Hechos 21.7).
El primer obispo conocido es Clarus, que en 190 asistió a un Concilio en el que se reunieron algunos obispos de Fenicia y Palestina para tratar la cuestión de la fecha de la fiesta pascual . Pero hay que remontarse al siglo IV para encontrar al siguiente obispo, Eneas, que participó en el Primer Concilio de Nicea en 325 y en el Sínodo celebrado en Antioquía en 341. Nectabo fue uno de los padres del primer Concilio Ecuménico de Constantinopla en 381. Entre los siglos IV y V vivió el obispo Antíoco, oponente de Juan Crisóstomo . Heladio participó en el primer Concilio de Éfeso en 431. Pablo participó en el Concilio celebrado en Antioquía de 445 para juzgar la obra de Atanasio de Perre y en el Concilio de Calcedonia de 451. En 518 el obispo Juan firmó una carta sinodal contra Severo de Antioquía y el partido monofisita. Finalmente, el último obispo conocido es Jorge, que asistió al segundo Concilio de Constantinopla en 553.
Con la conquista de los cruzados en el siglo XII, la ciudad, llamada San Juan de Acre, pasó a formar parte del Reino de Jerusalén y fue una diócesis de la Iglesia latina , con sede en la Catedral de la Santa Cruz. En contra de la práctica oriental y la tradición eclesiástica, los cruzados separaron la diócesis, junto con el resto del sur de Fenicia, del Patriarcado de Antioquía y la convirtieron en sufragánea de Jerusalén.
Tras la caída de Jerusalén en 1187, la sede del patriarca se trasladó a Tiro y luego a San Juan de Acre en 1191; el patriarca regresó a Jerusalén en 1229, cuando la ciudad fue devuelta a los cruzados, luego de nuevo a San Juan de Acre en 1244. San Juan de Acre tuvo su propio obispo hasta 1263, cuando los patriarcas de Jerusalén la administraron hasta la caída de la ciudad en manos de los musulmanes en 1291. El obispo más famoso de San Juan de Acre fue el cronista Jacques de Vitry .
Ptolomeo en Fenicia sobrevive hoy en día como sede titular; hasta mediados del siglo XIX tenía el nombre de Aconensis o Acconensis.
