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Concatenador

Un concatémero es una molécula de ADN continua y larga que contiene múltiples copias de la misma secuencia de ADN unidas en serie. Estas moléculas poliméricas suelen ser copias de un genoma completo unidas de extremo a extremo y separadas por sitios cos (una secuencia de nucleótidos de unión a proteínas que aparece una vez en cada copia del genoma). Los concatémeros son con frecuencia el resultado de la replicación en círculo rodante y pueden verse en la etapa tardía de la infección de bacterias por fagos . Como ejemplo, si los genes en el ADN del fago están ordenados ABC, entonces en un concatémero los genes serían ABCABCABCABC y así sucesivamente (asumiendo que la síntesis se inició entre los genes C y A). Además, se dividen por ribozimas . [1]

Se ha demostrado que, durante la infección activa, algunas especies de virus replican su material genético mediante la formación de concatémeros. [2] En el caso del virus del herpes humano tipo 6 , su genoma completo se construye una y otra vez en una sola hebra. Estos largos concatémeros son escindidos posteriormente entre las regiones pac-1 y pac-2 por las ribozimas cuando el genoma se empaqueta en viriones individuales.

El ADN replicante del bacteriófago T4 se marcó con timidina tritiada y se examinó mediante autorradiografía . [3] Los intermediarios de replicación de ADN observados incluyeron estructuras concateméricas circulares y circulares ramificadas que probablemente surgieron por replicación de círculo rodante .

Al ensamblar concatémeros a partir de oligonucleótidos sintéticos, se descubrió que aumentar la concentración de sal a 200 mM era un factor de optimización importante debido a su capacidad para mejorar la fuerza iónica, lo que aceleró la formación de concatémeros. [4]

Referencias

  1. ^ Borenstein, Ronen; Frenkel, Niza (2009). "Clonación del genoma del virus del herpes humano 6A en cromosomas artificiales bacterianos y estudio de intermediarios de replicación del ADN". Actas de la Academia Nacional de Ciencias . 106 (45): 19138–19143. Bibcode :2009PNAS..10619138B. doi : 10.1073/pnas.0908504106 . PMC  2767366 . PMID  19858479.
  2. ^ Arbuckle, Jesse (2011). "La biología molecular de la latencia del herpesvirus humano-6 y la integración de los telómeros". Microbes and Infection . 13 (8–9): 731–741. doi :10.1016/j.micinf.2011.03.006. PMC 3130849 . PMID  21458587. 
  3. ^ Bernstein H, Bernstein C (julio de 1973). "Concatenaciones circulares y ramificadas como posibles intermediarios en la replicación del ADN del bacteriófago T4". J. Mol. Biol . 77 (3): 355–61. doi :10.1016/0022-2836(73)90443-9. PMID  4580243.
  4. ^ Sun, Lu; Åkerman, Björn (agosto de 2014). "Caracterización de concatémeros de ADN autoensamblados a partir de oligonucleótidos sintéticos". Revista de biotecnología estructural y computacional . 11 (18): 66–72. doi :10.1016/j.csbj.2014.08.011. PMC 4212282 . PMID  25379145. 

Bibliografía