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Escaleras de ADN

La secuenciación de ADN (izquierda) se visualizó en un gel de agarosa mediante tinción con bromuro de etidio . Se incluyen un marcador de 1 kb (centro) y ADN de control (derecha).

La formación de escaleras en el ADN es una característica que se puede observar cuando los fragmentos de ADN resultantes de la fragmentación del ADN por apoptosis se visualizan después de su separación por electroforesis en gel, descrita por primera vez en 1980 por Andrew Wyllie en la facultad de medicina de la Universidad de Edimburgo [1]. Los fragmentos de ADN también se pueden detectar en células que sufrieron necrosis, pero cuando estos fragmentos de ADN después de la separación se someten a electroforesis en gel, no se observa un patrón claro de "escalera". [1]

Degradación del ADN

La formación de escaleras en el ADN es una característica distintiva del ADN degradado por la DNasa activada por caspasa (CAD), que es un evento clave durante la apoptosis . La CAD escinde el ADN genómico en las regiones de enlace internucleosómicas , lo que da como resultado fragmentos de ADN que son múltiplos de 180-185 pares de bases de longitud. [2] La separación de los fragmentos mediante electroforesis en gel de agarosa y posterior visualización, por ejemplo mediante tinción con bromuro de etidio , da como resultado un patrón de "escalera" característico. Un método simple de extracción selectiva de ADN fragmentado de células apoptóticas sin la presencia de secciones de ADN de alto peso molecular, generando el patrón de formación de escaleras, utiliza el pretratamiento de las células en etanol . [3]

Apoptosis y necrosis

Si bien la mayoría de las características morfológicas de las células apoptóticas son de corta duración, el encadenamiento de ADN se puede utilizar como método de lectura del estado final y, por lo tanto, se ha convertido en un método confiable para distinguir la apoptosis de la necrosis . [4] El encadenamiento de ADN también se puede utilizar para ver si las células experimentaron apoptosis en presencia de un virus. [5] Esto es útil porque puede ayudar a determinar los efectos que tiene un virus en una célula.

El encadenamiento de ADN solo se puede utilizar para detectar la apoptosis durante las últimas etapas de la apoptosis. Esto se debe a que la fragmentación del ADN tiene lugar en una etapa posterior del proceso de apoptosis. [2] El encadenamiento de ADN se utiliza para probar la apoptosis de muchas células, y no es preciso para probar solo unas pocas células que cometieron apoptosis. [2] Para mejorar la precisión en las pruebas de apoptosis, se utilizan otros ensayos junto con el encadenamiento de ADN, como TEM y TUNEL. [2] Con las recientes mejoras en el encadenamiento de ADN, el encadenamiento de ADN se ha convertido en una técnica más confiable y razonable para usar al detectar la apoptosis. [6] También es importante tener en cuenta que el encadenamiento de ADN se produce de manera diferente según el tipo de célula, por lo que puede haber ligeros cambios en el proceso de encadenamiento de ADN según la célula que se esté investigando. [7]

Véase también

Referencias

  1. ^ ab Kressel, Michael; Groscurth, Peter (1 de noviembre de 1994). "Distinción de muerte celular apoptótica y necrótica mediante el marcaje in situ de ADN fragmentado". Investigación celular y tisular . 278 (3): 549–556. doi :10.1007/s004410050244. ISSN  0302-766X. PMID  7850865.
  2. ^ abcd Elmore, Susan (junio de 2007). "Apoptosis: una revisión de la muerte celular programada". Patología toxicológica . 35 (4): 495–516. doi :10.1080/01926230701320337. ISSN  0192-6233. PMC 2117903 . PMID  17562483. 
  3. ^ Gong, JP; Traganos, F.; Darzynkiewicz, Z. (mayo de 1994). "Un procedimiento selectivo para la extracción de ADN de células apoptóticas aplicable a la electroforesis en gel y la citometría de flujo". Analytical Biochemistry . 218 (2): 314–319. doi :10.1006/abio.1994.1184. PMID  8074286.
  4. ^ Iwata, M; Myerson, D; Torok-Storb, B; Zager, RA (diciembre de 1994). "Una evaluación de la formación de escalones de ADN tubular renal en respuesta a la privación de oxígeno y la lesión oxidativa". Revista de la Sociedad Americana de Nefrología . 5 (6): 1307–1313. doi : 10.1681/ASN.V561307 . ISSN  1046-6673. PMID  7893995.
  5. ^ Srivastava, V; Rawall, S; Vijayan, VK; Khanna, M (mayo de 2009). "Apoptosis inducida por el virus de la influenza A: inhibición de la actividad de la caspasa-3 y del encadenamiento del ADN mediante la suplementación con zinc en células HeLa cultivadas". Revista India de Investigación Médica . 129 (5): 579–86. ISSN  0971-5916. PMID  19675388.
  6. ^ Rahbar Saadat, Yalda; Saeidi, Nazli; Zununi Vahed, Sepideh; Barzegari, Abolfazl; Barar, Jaleh (1 de enero de 2015). "Una actualización del ensayo de escalera de ADN para la detección de apoptosis". BioImpactos . 5 (1): 25–28. doi :10.15171/bi.2015.01. ISSN  2228-5652. PMC 4401164 . PMID  25901294. 
  7. ^ Jiang, Ai-Liang; Cheng, Yanwei; Li, Jianyou; Zhang, Wei (31 de julio de 2008). "Una endonucleasa nuclear dependiente de zinc es responsable de la formación de escalones en el ADN durante la muerte celular programada inducida por sal en las células de la punta de la raíz del arroz". Journal of Plant Physiology . 165 (11): 1134–1141. doi :10.1016/j.jplph.2007.12.008. ISSN  1618-1328. PMID  18295371.