Apolipoproteína CI

Gen codificador de proteínas en la especie Homo sapiens.

La apolipoproteína CI es un componente proteico de las lipoproteínas que en humanos está codificado por el gen APOC1 . ^{[5] [6]}

Función

La proteína codificada por este gen es miembro de la familia de las apolipoproteínas C. Este gen se expresa principalmente en el hígado y se activa cuando los monocitos se diferencian en macrófagos . Se han encontrado variantes de transcripción empalmadas alternativamente para este gen, pero no se ha determinado la validez biológica de algunas variantes. ^[7]

La apolipoproteína CI tiene una longitud de 57 aminoácidos que normalmente se encuentran en el plasma y son responsables de la activación del colesterol lecitina esterificado con un papel importante en el intercambio de colesterol esterificado entre lipoproteínas y en la eliminación del colesterol de los tejidos. Su función principal es la inhibición de la proteína de transferencia de ésteres de colesterol (CETP), probablemente alterando la carga eléctrica de las moléculas de HDL .

Durante el ayuno (como otras apolipoproteínas C), se encuentra principalmente dentro del HDL , mientras que después de una comida se encuentra en la superficie de otras lipoproteínas. Cuando las proteínas ricas en triglicéridos como los quilomicrones y las VLDL se descomponen, esta apoproteína se transfiere nuevamente a las HDL. Es una de las proteínas con mayor carga positiva del cuerpo humano.

pseudogen

Un pseudogen de este gen se encuentra 4 kb aguas abajo del gen apoC-I en la misma orientación en el cromosoma 19, donde ambos residen dentro de un grupo de genes de apolipoproteína. Este pseudogen, que también se informó que estuvo presente en los denisovanos y los neandertales , se originó a partir de dos eventos separados. Tras la divergencia entre los monos del Nuevo Mundo y el linaje humano, se duplicó el gen apoC-I. Se ha demostrado que los monos del Viejo Mundo y los grandes simios distintos de los humanos tienen dos genes activos. Uno de los duplicados codifica una proteína básica denominada apoC-IB que es ortóloga a la apolipoproteína CI humana. El otro codifica una proteína ácida, apoC-IA, que es ortóloga a la proteína virtual codificada por el pseudogén. El evento de pseudogenización ocurrió en algún momento entre la divergencia de bonobos y chimpancés del linaje humano y la llegada de los denisovanos y los neandertales. El pseudogén se debe a un cambio en un único nucleótido en el codón del penúltimo aminoácido, es decir, la glutamina, en la secuencia señal, lo que da como resultado un codón de parada. ^{[8] [9] [10]}

Mapa de ruta interactivo

Haga clic en genes, proteínas y metabolitos a continuación para vincular a los artículos respectivos. ^{[§ 1]}

1. El mapa de ruta interactivo se puede editar en WikiPathways: "Statin_Pathway_WP430".

Referencias

1. GRCh38: Ensembl lanzamiento 89: ENSG00000130208 - Ensembl , mayo de 2017
2. GRCm38: Ensembl lanzamiento 89: ENSMUSG00000040564 - Ensembl , mayo de 2017
3. "Referencia humana de PubMed:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
4. "Referencia de PubMed del ratón:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
5. Tata F, Henry I, Markham AF, Wallis SC, Weil D, Grzeschik KH y col. (1985). "Aislamiento y caracterización de un clon de ADNc de la apolipoproteína CI humana y asignación del gen al cromosoma 19". Genética Humana . 69 (4): 345–9. doi :10.1007/BF00291654. PMID  2985493. S2CID  32767041.
6. Smit M, van der Kooij-Meijs E, Frants RR, Havekes L, Klasen EC (enero de 1988). "Grupo de genes de apolipoproteína en el cromosoma 19. Localización definitiva del gen APOC2 y el sitio polimórfico Hpa I asociado con la hiperlipoproteinemia tipo III". Genética Humana . 78 (1): 90–3. doi :10.1007/BF00291243. PMID  2892779. S2CID  22711986.
7. "Entrez Gene: APOC1 apolipoproteína CI".
8. Puppione DL, Ryan CM, Bassilian S, Souda P, Xiao X, Ryder OA, Whitelegge JP (marzo de 2010). "Detección de dos formas distintas de apoC-I en grandes simios". Bioquímica y Fisiología Comparada. Parte D, Genómica y proteómica . 5 (1): 73–9. doi :10.1016/j.cbd.2009.12.003. PMC 2830554 . PMID  20209111. 
9. Puppione D, Whitelegge JP (octubre de 2013). "Revisión proteogenómica de los cambios en la apoC-I de primates durante la evolución". Fronteras en biología . 8 (5): 533–548. doi :10.1007/s11515-013-1278-7. PMC 5528196 . PMID  28757862. 
10. Puppione DL (septiembre de 2014). "Los primates superiores, pero no los monos del Nuevo Mundo, tienen un conjunto duplicado de potenciadores que flanquean sus genes apoC-I". Bioquímica y Fisiología Comparada. Parte D, Genómica y proteómica . 11 : 45–8. doi :10.1016/j.cbd.2014.08.001. PMID  25160599.

Otras lecturas

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• Lauer SJ, Walker D, Elshourbagy NA, Reardon CA, Levy-Wilson B, Taylor JM (mayo de 1988). "Dos copias del gen de la apolipoproteína CI humana están estrechamente vinculadas al gen de la apolipoproteína E". La Revista de Química Biológica . 263 (15): 7277–86. doi : 10.1016/S0021-9258(18)68638-7 . PMID  2835369.
• Smit M, van der Kooij-Meijs E, Woudt LP, Havekes LM, Frants RR (mayo de 1988). "Localización exacta del sitio de restricción HpaI asociado a disbetalipoproteinemia familiar en la región promotora del gen APOC1". Comunicaciones de investigación bioquímica y biofísica . 152 (3): 1282–8. doi :10.1016/S0006-291X(88)80424-8. PMID  2897845.
• Davison PJ, Norton P, Wallis SC, Gill L, Cook M, Williamson R, Humphries SE (mayo de 1986). "Hay dos secuencias genéticas para la apolipoproteína CI humana (apo CI) en el cromosoma 19, una de las cuales está a 4 kb del gen de la apo E". Comunicaciones de investigación bioquímica y biofísica . 136 (3): 876–84. doi :10.1016/0006-291X(86)90414-6. PMID  3013172.
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• Freitas EM, Zhang WJ, Lalonde JP, Tay GK, Gaudieri S, Ashworth LK, et al. (1999). "La secuenciación de 42 kb del grupo de genes APO E-C2 revela un nuevo gen: PEREC1". Secuencia de ADN . 9 (2): 89-100. doi :10.3109/10425179809086433. PMID  10520737.
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enlaces externos

• Ubicación del genoma humano APOC1 y página de detalles del gen APOC1 en el navegador del genoma de UCSC .
• PDBe-KB proporciona una descripción general de toda la información estructural disponible en el PDB para la apolipoproteína CI humana