Apolipoproteína CI

Gen codificador de proteínas en la especie Homo sapiens

La apolipoproteína CI es un componente proteico de las lipoproteínas que en los humanos está codificado por el gen APOC1 . ^{[5] [6]}

Función

La proteína codificada por este gen es miembro de la familia de la apolipoproteína C. Este gen se expresa principalmente en el hígado y se activa cuando los monocitos se diferencian en macrófagos . Se han encontrado variantes de transcripción empalmadas alternativamente para este gen, pero no se ha determinado la validez biológica de algunas variantes. ^[7]

La apolipoproteína CI tiene una longitud de 57 aminoácidos que se encuentra normalmente en el plasma y es responsable de la activación del colesterol lecitina esterificado con un papel importante en el intercambio de colesterol esterificado entre lipoproteínas y en la eliminación del colesterol de los tejidos. Su función principal es la inhibición de la proteína de transferencia de ésteres de colesterol (CETP), probablemente alterando la carga eléctrica de las moléculas de HDL .

Durante el ayuno (al igual que otras apolipoproteínas C), se encuentra principalmente dentro de las HDL , mientras que después de una comida se encuentra en la superficie de otras lipoproteínas. Cuando se descomponen las proteínas ricas en triglicéridos como los quilomicrones y las VLDL, esta apoproteína se transfiere nuevamente a las HDL. Es una de las proteínas con mayor carga positiva del cuerpo humano.

Pseudogen

Un pseudogén de este gen se encuentra a 4 kb aguas abajo del gen apoC-I en la misma orientación en el cromosoma 19, donde ambos residen dentro de un grupo de genes de apolipoproteína. Este pseudogén, que también se informó que estaba presente en los denisovanos y los neandertales , se originó a partir de dos eventos separados. Después de la divergencia de los monos del Nuevo Mundo del linaje humano, el gen apoC-I se duplicó. Se ha demostrado que los monos del Viejo Mundo y los grandes simios distintos de los humanos tienen dos genes activos. Uno de los duplicados codifica una proteína básica designada apoC-IB que es ortóloga de la apolipoproteína humana CI. El otro codifica una proteína ácida, apoC-IA, que es ortóloga de la proteína virtual codificada por el pseudogén. El evento de pseudogenización ocurrió en algún momento entre la divergencia de los bonobos y los chimpancés del linaje humano y la llegada de los denisovanos y los neandertales. El pseudogén se debe a un cambio en un solo nucleótido en el codón del penúltimo aminoácido, es decir, la glutamina, en la secuencia señal, lo que da como resultado un codón de terminación. ^{[8] [9] [10]}

Mapa interactivo de rutas

Haga clic en los genes, proteínas y metabolitos que aparecen a continuación para acceder a los artículos correspondientes. ^{[§ 1]}

1. El mapa interactivo de la ruta se puede editar en WikiPathways: "Statin_Pathway_WP430".

Referencias

1. GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000130208 – Ensembl , mayo de 2017
2. GRCm38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSMUSG00000040564 – Ensembl , mayo de 2017
3. "Referencia de PubMed humana:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
4. "Referencia PubMed de ratón:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU . .
5. Tata F, Henry I, Markham AF, Wallis SC, Weil D, Grzeschik KH, et al. (1985). "Aislamiento y caracterización de un clon de ADNc para la apolipoproteína humana CI y asignación del gen al cromosoma 19". Genética humana . 69 (4): 345–9. doi :10.1007/BF00291654. PMID  2985493. S2CID  32767041.
6. Smit M, van der Kooij-Meijs E, Frants RR, Havekes L, Klasen EC (enero de 1988). "Grupo de genes de apolipoproteína en el cromosoma 19. Localización definitiva del gen APOC2 y el sitio polimórfico Hpa I asociado con la hiperlipoproteinemia tipo III". Genética Humana . 78 (1): 90–3. doi :10.1007/BF00291243. PMID  2892779. S2CID  22711986.
7. "Gen Entrez: APOC1 apolipoproteína CI".
8. Puppione DL, Ryan CM, Bassilian S, Souda P, Xiao X, Ryder OA, Whitelegge JP (marzo de 2010). "Detección de dos formas distintas de apoC-I en grandes simios". Comparative Biochemistry and Physiology. Parte D, Genomics & Proteomics . 5 (1): 73–9. doi :10.1016/j.cbd.2009.12.003. PMC 2830554. PMID 20209111  . 
9. Puppione D, Whitelegge JP (octubre de 2013). "Revisión proteogenómica de los cambios en apoC-I de primates durante la evolución". Frontiers in Biology . 8 (5): 533–548. doi :10.1007/s11515-013-1278-7. PMC 5528196 . PMID  28757862. 
10. Puppione DL (septiembre de 2014). "Los primates superiores, pero no los monos del Nuevo Mundo, tienen un conjunto duplicado de potenciadores que flanquean sus genes apoC-I". Comparative Biochemistry and Physiology. Parte D, Genomics & Proteomics . 11 : 45–8. doi :10.1016/j.cbd.2014.08.001. PMID  25160599.

Lectura adicional

• Shulman RS, Herbert PN, Wehrly K, Fredrickson DS (enero de 1975). "La secuencia completa de aminoácidos de CI (apoLp-Ser), una apolipoproteína de lipoproteínas de muy baja densidad humanas". The Journal of Biological Chemistry . 250 (1): 182–90. doi : 10.1016/S0021-9258(19)41998-4 . PMID  166984.
• Lauer SJ, Walker D, Elshourbagy NA, Reardon CA, Levy-Wilson B, Taylor JM (mayo de 1988). "Dos copias del gen de la apolipoproteína CI humana están estrechamente vinculadas al gen de la apolipoproteína E". The Journal of Biological Chemistry . 263 (15): 7277–86. doi : 10.1016/S0021-9258(18)68638-7 . PMID  2835369.
• Smit M, van der Kooij-Meijs E, Woudt LP, Havekes LM, Frants RR (mayo de 1988). "Localización exacta del sitio de restricción HpaI asociado a la disbetalipoproteinemia familiar en la región promotora del gen APOC1". Biochemical and Biophysical Research Communications . 152 (3): 1282–8. doi :10.1016/S0006-291X(88)80424-8. PMID  2897845.
• Davison PJ, Norton P, Wallis SC, Gill L, Cook M, Williamson R, Humphries SE (mayo de 1986). "Existen dos secuencias de genes para la apolipoproteína humana CI (apo CI) en el cromosoma 19, una de las cuales está a 4 kb del gen para la apo E". Biochemical and Biophysical Research Communications . 136 (3): 876–84. doi :10.1016/0006-291X(86)90414-6. PMID  3013172.
• Myklebost O, Rogne S (agosto de 1986). "El gen de la apolipoproteína CI humana se encuentra a 4,3 kilobases del gen de la apolipoproteína E en el cromosoma 19". Genética humana . 73 (4): 286–9. doi :10.1007/BF00279087. PMID  3017837. S2CID  11662593.
• Jackson RL, Sparrow JT, Baker HN, Morrisett JD, Taunton OD, Gotto AM (agosto de 1974). "La estructura primaria de la apolopoproteína-serina". The Journal of Biological Chemistry . 249 (16): 5308–13. doi : 10.1016/S0021-9258(19)42365-X . PMID  4369340.
• Knott TJ, Robertson ME, Priestley LM, Urdea M, Wallis S, Scott J (mayo de 1984). "Caracterización de los ARNm que codifican el precursor de la apolipoproteína humana CI". Nucleic Acids Research . 12 (9): 3909–15. doi :10.1093/nar/12.9.3909. PMC  318798 . PMID  6328444.
• Servillo L, Brewer HB, Osborne JC (febrero de 1981). "Evaluación de la interacción mixta entre las apolipoproteínas A-II y la sedimentación en equilibrio de CI". Química biofísica . 13 (1): 29–38. doi :10.1016/0301-4622(81)80022-1. PMID  6789904.
• Curry MD, McConathy WJ, Fesmire JD, Alaupovic P (abril de 1981). "Determinación cuantitativa de las apolipoproteínas CI y C-II en plasma humano mediante electroinmunoensayos separados". Química clínica . 27 (4): 543–8. doi : 10.1093/clinchem/27.4.543 . PMID  7471419.
• Rozek A, Buchko GW, Cushley RJ (junio de 1995). "Conformación de dos péptidos correspondientes a los residuos 7-24 y 35-53 de la apolipoproteína CI humana en presencia de dodecil sulfato de sodio mediante espectroscopia de CD y RMN". Biochemistry . 34 (22): 7401–8. doi :10.1021/bi00022a013. PMID  7779782.
• Maruyama K, Sugano S (enero de 1994). "Oligo-capping: un método simple para reemplazar la estructura de capuchón de los ARNm eucariotas con oligorribonucleótidos". Gene . 138 (1–2): 171–4. doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Trask B, Fertitta A, Christensen M, Youngblom J, Bergmann A, Copeland A, et al. (enero de 1993). "Mapeo de hibridación in situ con fluorescencia del cromosoma humano 19: ubicación de la banda citogenética de 540 cósmidos y 70 genes o marcadores de ADN". Genomics . 15 (1): 133–45. doi :10.1006/geno.1993.1021. PMID  8432525.
• Kamino K, Yoshiiwa A, Nishiwaki Y, Nagano K, Yamamoto H, Kobayashi T, et al. (1996). "Estudio de asociación genética entre la demencia senil de tipo Alzheimer y el grupo de genes APOE/C1/C2". Gerontología . 42 (Supl 1): 12–9. doi :10.1159/000213820. PMID  8804993.
• Rozek A, Buchko GW, Kanda P, Cushley RJ (septiembre de 1997). "Estudios conformacionales del dominio de asociación de lípidos N-terminal de la apolipoproteína humana CI mediante espectroscopia de RMN de CD y 1H". Protein Science . 6 (9): 1858–68. doi :10.1002/pro.5560060906. PMC  2143781 . PMID  9300485.
• Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (octubre de 1997). "Construcción y caracterización de una biblioteca de ADNc enriquecida en longitud completa y enriquecida en el extremo 5'". Gene . 200 (1–2): 149–56. doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID  9373149.
• Halushka MK, Fan JB, Bentley K, Hsie L, Shen N, Weder A, et al. (julio de 1999). "Patrones de polimorfismos de un solo nucleótido en genes candidatos para la homeostasis de la presión arterial". Nature Genetics . 22 (3): 239–47. doi :10.1038/10297. PMID  10391210. S2CID  4636523.
• Freitas EM, Zhang WJ, Lalonde JP, Tay GK, Gaudieri S, Ashworth LK, et al. (1999). "La secuenciación de 42 kb del grupo de genes APO E-C2 revela un nuevo gen: PEREC1". Secuencia de ADN . 9 (2): 89–100. doi :10.3109/10425179809086433. PMID  10520737.
• Gautier T, Masson D, de Barros JP, Athias A, Gambert P, Aunis D, et al. (diciembre de 2000). "La apolipoproteína humana CI explica la capacidad de las lipoproteínas de alta densidad plasmáticas para inhibir la actividad de la proteína de transferencia de ésteres de colesterol". The Journal of Biological Chemistry . 275 (48): 37504–9. doi : 10.1074/jbc.M007210200 . PMID  10978346.
• Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (noviembre de 2000). "Clonación de ADN mediante recombinación específica de sitio in vitro". Genome Research . 10 (11): 1788–95. doi :10.1101/gr.143000. PMC  310948 . PMID  11076863.

Enlaces externos

• Página de detalles del gen APOC1 y ubicación del genoma humano en el navegador de genoma de la UCSC .
• PDBe-KB proporciona una descripción general de toda la información de estructura disponible en el PDB para la apolipoproteína CI humana