Gen para comprobar si la secuencia de ácido nucleico se insertó con éxito en el ADN de un organismo
En biología , un gen marcador puede tener varios significados. En biología nuclear y biología molecular, un gen marcador es un gen utilizado para determinar si una secuencia de ácido nucleico se ha insertado con éxito en el ADN de un organismo . En particular, existen dos subtipos de estos genes marcadores: un marcador seleccionable y un marcador para cribado . En metagenómica y filogenética , un gen marcador es un grupo de genes ortólogos que puede usarse para delimitar entre linajes taxonómicos. [1]
Marcador seleccionable
Un marcador seleccionable protege al organismo de un agente selectivo que normalmente lo mataría o impediría su crecimiento. En una reacción de transformación, dependiendo de la eficiencia de la transformación , sólo una entre varios millones o miles de millones de células puede absorber ADN. En lugar de comprobar cada célula, los científicos utilizan un agente selectivo para matar todas las células que no contienen ADN extraño, dejando sólo las deseadas.
Los antibióticos son los agentes selectivos más comunes. En las bacterias se utilizan casi exclusivamente antibióticos. En las plantas también se utilizan a menudo antibióticos que matan el cloroplasto , aunque la tolerancia a las sales y a las hormonas inhibidoras del crecimiento se está volviendo más popular. En los mamíferos, la resistencia a los antibióticos que matarían las mitocondrias se utiliza como marcador de selección.
Marcador seleccionable
Un marcador detectable hará que las células que contienen el gen luzcan diferentes. Hay tres tipos de detección comúnmente utilizados:
- La proteína verde fluorescente hace que las células brillen de color verde bajo la luz ultravioleta. Se requiere un microscopio especializado para ver células individuales. También están disponibles versiones amarillas y rojas, para que los científicos puedan observar varios genes a la vez. Se utiliza comúnmente para medir la expresión genética . [2]
- El ensayo GUS (que utiliza β-glucuronidasa ) es un método excelente para detectar una sola célula teñiéndola de azul sin utilizar ningún equipo complicado. El inconveniente es que las células mueren en el proceso. Es particularmente común en la ciencia de las plantas.
- La pantalla azul blanca se utiliza tanto en bacterias como en células eucariotas. El gen bacteriano lacZ codifica una enzima beta-galactosidasa . Cuando los medios contienen ciertos galactósidos (por ejemplo, X-gal ), las células que expresan la enzima convierten el X-gal en un producto azul y se puede ver a simple vista. Por tanto, la estrategia es integrar el inserto de ADN dentro del gen lacZ y seleccionar las colonias de color blanco , siempre que hayan integrado correctamente el inserto. Por otro lado, las colonias azules podrán convertir el X-gal y dar lugar al precipitado azul porque el inserto de ADN no se integró en absoluto o no se integró en la ubicación correcta dentro del plásmido .
Ver también
Referencias
- ^ Ren R, Sun Y, Zhao Y, Geiser D, Ma H, Zhou X (2016). "Resolución filogenética de relaciones fúngicas y eucarióticas profundas utilizando genes nucleares de baja copia altamente conservados". Genoma Biol Evol . 8 (9): 2683–701. doi : 10.1093/gbe/evw196. PMC 5631032 . PMID 27604879.
- ^ Chalfie, Martín y col. "Proteína verde fluorescente como marcador de expresión genética". Ciencia 263.5148 (1994): 802-805.
