stringtranslate.com

Actinomicetos

Los Actinomycetota (o Actinobacteria ) son un filo diverso de bacterias Gram-positivas con alto contenido de GC . [4] Pueden ser terrestres o acuáticos . [5] Son de gran importancia para la flora terrestre debido a sus contribuciones a los sistemas del suelo . En el suelo ayudan a descomponer la materia orgánica de los organismos muertos para que las moléculas puedan ser absorbidas nuevamente por las plantas . Si bien esta función también la desempeñan los hongos , los Actinomycetota son mucho más pequeños y probablemente no ocupan el mismo nicho ecológico . En esta función, las colonias a menudo desarrollan micelios extensos , como lo hacen los hongos, y el nombre de un orden importante del filo, Actinomycetales (los actinomicetos), refleja que durante mucho tiempo se creyó que eran hongos. Algunos actinomicetos del suelo (como Frankia ) viven simbióticamente con las plantas cuyas raíces impregnan el suelo, fijando nitrógeno para las plantas a cambio del acceso a algunos de los sacáridos de la planta . Otras especies, como muchos miembros del género Mycobacterium , son patógenos importantes .

Más allá del gran interés que despiertan los actinomicetos por su papel en el suelo, todavía queda mucho por aprender sobre ellos. Aunque actualmente se los entiende principalmente como bacterias del suelo, podrían ser más abundantes en aguas dulces. [6] Los actinomicetos son uno de los filos bacterianos dominantes y contienen uno de los géneros bacterianos más grandes, Streptomyces . [7] Los Streptomyces y otros actinomicetos son importantes contribuyentes a la amortiguación biológica de los suelos. [8] También son la fuente de muchos antibióticos . [9] [10]

El género Actinomycetota Bifidobacterium es la bacteria más común en el microbioma de los bebés humanos. [11] Aunque los adultos tienen menos bifidobacterias, las bifidobacterias intestinales ayudan a mantener la barrera mucosa y reducen el lipopolisacárido en el intestino. [12]

Aunque algunas de las células bacterianas más grandes y complejas pertenecen a Actinomycetota, se ha descrito al grupo de Actinomarinales marinos como el que posee las células procariotas de vida libre más pequeñas . [13]

Se dice que algunos Actinomycetota siberianos o antárticos son los organismos vivos más antiguos de la Tierra, congelados en el permafrost hace alrededor de medio millón de años. [14] [15] Los síntomas de vida se detectaron por la liberación de CO2 de muestras de permafrost de 640 kya o menos. [16]

General

La mayoría de los Actinomycetota de importancia médica o económica pertenecen a la clase Actinomycetia y al orden Actinomycetales . Si bien muchos de ellos causan enfermedades en los seres humanos, Streptomyces es notable como fuente de antibióticos . [10]

De los Actinomycetota que no están incluidos en Actinomycetales, Gardnerella es uno de los más investigados. La clasificación de Gardnerella es controvertida y MeSH la cataloga como organismo tanto grampositivo como gramnegativo . [17]

Los actinomicetos, especialmente Streptomyces spp., son reconocidos como productores de muchos metabolitos bioactivos que son útiles para los humanos en medicina, como antibacterianos, [18] antifúngicos, [19] antivirales, antitrombóticos, inmunomodificadores, fármacos antitumorales e inhibidores de enzimas; y en la agricultura, incluidos insecticidas, herbicidas, fungicidas y sustancias promotoras del crecimiento de plantas y animales. [20] Los antibióticos derivados de actinomicetos que son importantes en medicina incluyen aminoglucósidos, antraciclinas, cloranfenicol, macrólidos, tetraciclinas, etc. [ cita requerida ]

Los Actinomycetota tienen un alto contenido de guanina y citosina en su ADN . [21] El contenido de G+C de los Actinomycetota puede ser tan alto como 70%, aunque algunos pueden tener un bajo contenido de G+C. [22]

Se ha sugerido el análisis de la secuencia de la glutamina sintetasa para el análisis filogenético de Actinomycetota. [23]

Filogenia

Taxonomía

La taxonomía actualmente aceptada se basa en la Lista de nombres procariotas con relevancia en la nomenclatura (LPSN) [2] y el Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI). [31]

Véase también

Referencias

  1. ^ Oren A, Garrity GM (2021). "Publicación válida de los nombres de cuarenta y dos filos de procariotas". Int J Syst Evol Microbiol . 71 (10): 5056. doi : 10.1099/ijsem.0.005056 . PMID  34694987. S2CID  239887308.
  2. ^ de Euzéby JP, Parte AC. "Actinobacteria". Lista de nombres procariotas con posición en la nomenclatura (LPSN). Archivado desde el original el 6 de mayo de 2021. Consultado el 7 de junio de 2021 .
  3. ^ Goodfellow M (2012). "Filo XXVI. Actinobacteria phyl. nov." En Goodfellow M, Kämpfer P, Trujillo ME, Suzuki K, Ludwig W, Whitman WB (eds.). Bergey's Manual of Systematic Bacteriology . Vol. 5 (2.ª ed.). Nueva York, NY: Springer. págs. 33–34.
  4. ^ Gao B, Gupta RS (marzo de 2012). "Marco filogenético y firmas moleculares para los principales clados del filo Actinobacteria". Microbiology and Molecular Biology Reviews . 76 (1): 66–112. doi :10.1128/MMBR.05011-11. PMC 3294427 . PMID  22390973. 
  5. ^ Servin JA, Herbold CW, Skophammer RG, Lake JA (enero de 2008). "Evidencia que excluye la raíz del árbol de la vida de las actinobacterias". Mol. Biol. Evol . 25 (1): 1–4. doi : 10.1093/molbev/msm249 . PMID  18003601.
  6. ^ Ghai R, Rodriguez-Valera F, McMahon KD, Toyama D, Rinke R, Cristina Souza de Oliveira T, et al. (2011). Lopez-Garcia P (ed.). "Metagenómica de la columna de agua en el curso superior prístino del río Amazonas". PLOS ONE . ​​6 (8): e23785. Bibcode :2011PLoSO...623785G. doi : 10.1371/journal.pone.0023785 . PMC 3158796 . PMID  21915244. 
  7. ^ Hogan CM (2010). "Bacterias". En Draggan S, Cleveland CJ (eds.). Enciclopedia de la Tierra . Washington DC: Consejo Nacional para la Ciencia y el Medio Ambiente. Archivado desde el original el 11 de mayo de 2011.
  8. ^ Ningthoujam DS, Sanasam S, Tamreihao K, Nimaichand S (noviembre de 2009). "Actividades antagónicas de aislamientos de actinomicetos locales contra patógenos fúngicos del arroz". Revista Africana de Investigación en Microbiología . 3 (11): 737–742.
  9. ^ Donald, Lavinia; Pipite, Atanas; Subramani, Ramesh; Owen, Jeremy; Keyzers, Robert A.; Taufa, Taitusi (2022). "Streptomyces: sigue siendo el mayor productor de nuevos metabolitos secundarios naturales, una perspectiva actual". Investigación en microbiología . 13 (3): 418–465. doi : 10.3390/microbiolres13030031 . ISSN  2036-7481.
  10. ^ ab Procópio, Rudi Emerson de Lima; Silva, Ingrid Reis da; Martíns, Mayra Kassawara; Azevedo, João Lúcio de; Araújo, Janete Magali de (2012). "Antibióticos producidos por Streptomyces". La Revista Brasileña de Enfermedades Infecciosas . 16 (5): 466–471. doi : 10.1016/j.bjid.2012.08.014 . ISSN  1678-4391. PMID  22975171.
  11. ^ Turroni F, Peano C, Pass DA, Foroni E, Severgnini M, Claesson MJ, Kerr C, Hourihane J, Murray D, Fuligni F, Gueimonde M, Margolles A, De Bellis G, O'Toole PW, van Sinderen D, Marchesi JR, Ventura M (11 de mayo de 2012). "Diversidad de bifidobacterias dentro de la microbiota intestinal infantil". MÁS UNO . 7 (5): e36957. Código Bib : 2012PLoSO...736957T. doi : 10.1371/journal.pone.0036957 . PMC 3350489 . PMID  22606315. 
  12. ^ Pinzone MR, Celesia BM, Di Rosa M, Cacopardo B, Nunnari G (2012). "Translocación microbiana en enfermedades hepáticas crónicas". Revista Internacional de Microbiología . 2012 : 694629. doi : 10.1155/2012/694629 . PMC 3405644 . PMID  22848224. 
  13. ^ Ghai R, Mizuno CM, Picazo A, Camacho A, Rodriguez-Valera F (2013). "La metagenómica descubre un nuevo grupo de actinobacterias marinas ultrapequeñas y de bajo GC". Scientific Reports . 3 : 2471. Bibcode :2013NatSR...3E2471G. doi :10.1038/srep02471. PMC 3747508 . PMID  23959135. 
  14. ^ Muestra I (2 de mayo de 2010). «Los organismos vivos más antiguos: supervivientes ancestrales con un futuro frágil». The Guardian . Archivado desde el original el 2 de marzo de 2013.
  15. ^ Hanson J. "El ser vivo más antiguo del mundo". Está bien ser inteligente . Archivado desde el original el 13 de julio de 2018. Consultado el 13 de julio de 2018 .
  16. ^ Johnson SS, Hebsgaard MB, Christensen TR, Mastepanov M, Nielsen R, Munch K, et al. (septiembre de 2007). "Las bacterias antiguas muestran evidencia de reparación del ADN". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 104 (36): 14401–14405. Bibcode :2007PNAS..10414401J. doi : 10.1073/pnas.0706787104 . PMC 1958816 . PMID  17728401. 
  17. ^ Gardnerella en los encabezamientos de materias médicas (MeSH) de la Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU.
  18. ^ Mahajan GB (2012). "Agentes antibacterianos de actinomicetos: una revisión". Frontiers in Bioscience . 4 : 240–53. doi :10.2741/e373.
  19. ^ Gupte M, Kulkarni P, Ganguli BN (enero de 2002). "Antibióticos antimicóticos". Applied Microbiology and Biotechnology . 58 (1): 46–57. doi :10.1007/s002530100822. PMID  11831475. S2CID  8015426.
  20. ^ Bressan W (2003). "Control biológico de hongos patógenos de la semilla del maíz mediante el uso de actinomicetos". Biocontrol . 48 (2): 233–240. doi :10.1023/a:1022673226324. S2CID  29320215.
  21. ^ Ventura M, Canchaya C, Tauch A, Chandra G, Fitzgerald GF, Chater KF, van Sinderen D (septiembre de 2007). "Genómica de Actinobacteria: trazando la historia evolutiva de un filo antiguo". Microbiology and Molecular Biology Reviews . 71 (3): 495–548. doi :10.1128/MMBR.00005-07. hdl :11381/1721088. PMC 2168647 . PMID  17804669. 
  22. ^ Ghai R, McMahon KD, Rodriguez-Valera F (febrero de 2012). "Rompiendo un paradigma: las actinobacterias de agua dulce cosmopolitas y abundantes tienen un bajo contenido de GC". Environmental Microbiology Reports . 4 (1): 29–35. Bibcode :2012EnvMR...4...29G. doi :10.1111/j.1758-2229.2011.00274.x. PMID  23757226.
  23. ^ Hayward D, van Helden PD, Wiid IJ (2009). "Evolución de la secuencia de glutamina sintetasa en las micobacterias y su uso como marcadores moleculares para la especiación de Actinomycetota". BMC Evol. Biol . 9 : 48. doi : 10.1186/1471-2148-9-48 . PMC 2667176. PMID  19245690 . 
  24. ^ Nouioui I, Carro L, García-López M, Meier-Kolthoff JP, Woyke T, Kyrpides NC, Pukall R, Klenk HP, Goodfellow M, Markus Göker M (2018). "Clasificación taxonómica basada en el genoma del filo Actinobacteria". Portada. Microbiol . 9 : 2007. doi : 10.3389/fmicb.2018.02007 . PMC 6113628. PMID  30186281 . 
  25. ^ "El LTP". Archivado desde el original el 14 de junio de 2021 . Consultado el 23 de febrero de 2021 .
  26. ^ "Árbol LTP_all en formato newick". Archivado desde el original el 28 de febrero de 2022. Consultado el 23 de febrero de 2021 .
  27. ^ "Notas de la versión LTP_12_2021" (PDF) . Archivado (PDF) del original el 28 de febrero de 2022 . Consultado el 23 de febrero de 2021 .
  28. ^ "GTDB release 08-RS214". Base de datos de taxonomía del genoma . Archivado desde el original el 26 de octubre de 2022. Consultado el 10 de mayo de 2023 .
  29. ^ "bac120_r214.sp_label". Base de datos de taxonomía del genoma . Archivado desde el original el 16 de mayo de 2023. Consultado el 10 de mayo de 2023 .
  30. ^ "Historia del taxón". Base de datos de taxonomía del genoma . Archivado desde el original el 1 de noviembre de 2021. Consultado el 10 de mayo de 2023 .
  31. ^ Schoch CL, Ciufo S, Domrachev M, Hotton CL, Kannan S, Khovanskaya R, et al. "Actinobacteria". Base de datos de taxonomía del Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI) . Archivado desde el original el 17 de abril de 2021. Consultado el 20 de marzo de 2021 .

Lectura adicional

Enlaces externos

Wikispecies tiene información relacionada con Actinomycetota .