Juan II de Baden (1434 en el castillo de Hohenbaden en Baden-Baden - 9 de febrero de 1503 en Ehrenbreitstein) fue un margrave titular de Baden y fue arzobispo y elector de Tréveris como Juan II de Baden desde 1456 hasta su muerte en 1503.
Juan II de Baden fue el tercer hijo del margrave Jacobo I de Baden-Baden y su esposa Catalina de Lorena . Juan recibió una estricta educación religiosa, ya que estaba destinado desde muy temprana edad a una carrera eclesiástica. Por insistencia de su padre, la mayoría de sus hermanos también siguieron una carrera religiosa, con la excepción de sus dos hermanos mayores Carlos I y Bernardo II y su hermana Margarita . Estudió en Erfurt , Pavía y Colonia entre 1452 y 1456, junto con sus hermanos menores Jorge y Marcos.
El 21 de junio de 1456, a la edad de 22 años, fue elegido arzobispo de Tréveris como Juan II de Baden . Su madre era de Lorena y tenía conexiones con Tréveris. El papa Calixto III lo confirmó como administrador de Tréveris, porque aún no había alcanzado la edad mínima de 35 años para la consagración como obispo. Cuando alcanzó esa edad en 1465, fue consagrado por su obispo sufragáneo Hubertis Agrippina y los obispos de Metz y Worms .
En 1459, Diether von Isenburg fue elegido arzobispo de Maguncia , superando por un estrecho margen a Adolfo II de Nassau . Sin embargo, el Papa no confirmó la elección de Dieter. Esto condujo a la Guerra de Baden-Palatinado , en la que Juan II y sus hermanos participaron del lado de Adolfo II de Nassau.
Juan II de Baden apoyó la reforma en los monasterios benedictinos y los animó a unirse a la Congregación de Bursfelde . En 1469, envió a Johann Fart, el prior del monasterio de Santa María en Tréveris, a la Abadía de Maria Laach , donde Johann actuó como abad reformador . Johann fue el 21.º abad y su mandato duró desde 1470 hasta 1491. Al nombrar a Johann, Juan II frustró las intenciones del arzobispo Rupert de Colonia, que tenía en mente un candidato reformista diferente.
Durante el reinado de Juan II, el 16 de marzo de 1473 se fundó la tan esperada Universidad de Tréveris, que impartía estudios de teología , filosofía , medicina y derecho . En 1477 ofició la boda de Maximiliano de Habsburgo y María de Borgoña .
En 1488, Juan II de Baden libró una disputa contra Cuno III von Winneburg y Beilstein y en 1497 hizo que 12.000 hombres sitiaran la ciudad de Boppard , que intentaba recuperar su libertad imperial.
El 16 de enero de 1500, nombró a su sobrino nieto Jacobo como coadjutor con derecho a suceder ( en latín : coadiutor cum iure successionis ) y desde 1501 Jacobo dirigió el gobierno del Electorado.
Juan II murió en 1503 en Ehrenbreitstein (hoy parte de Coblenza ), después de un mandato de 46 años, 7 meses y 18 días, el más largo de cualquier obispo de Tréveris. Fue enterrado en la catedral de Tréveris en una magnífica tumba que mandó construir durante su vida.