stringtranslate.com

EGR1

EGR-1 (proteína de respuesta al crecimiento temprano 1), también conocida como ZNF268 (proteína de dedo de zinc 268) o NGFI-A (proteína A inducida por factor de crecimiento nervioso), es una proteína que en los humanos está codificada por el gen EGR1 .

EGR-1 es un factor de transcripción de mamíferos . También se lo conoce como Krox-24, TIS8 y ZENK . Se descubrió originalmente en ratones .

Función

La proteína codificada por este gen pertenece a la familia EGR de proteínas de dedo de zinc de tipo Cys 2 His 2 . Es una proteína nuclear y funciona como regulador transcripcional. Los productos de los genes diana que activa son necesarios para la diferenciación y la mitogénesis . Los estudios sugieren que se trata de un gen supresor de tumores . [5]

Tiene un patrón de expresión distintivo en el cerebro y se ha demostrado que su inducción está asociada con la actividad neuronal. Varios estudios sugieren que tiene un papel en la plasticidad neuronal . [6]

EGR-1 es un factor de transcripción importante en la formación de la memoria . Tiene un papel esencial en la reprogramación epigenética de las neuronas cerebrales . EGR-1 recluta la proteína TET1 que inicia una vía de desmetilación del ADN . [7] La ​​eliminación de las marcas de metilación del ADN permite la activación de genes posteriores. EGR-1, junto con TET1, se emplea en la programación de la distribución de los sitios de metilación en el ADN cerebral durante el desarrollo cerebral, en el aprendizaje y en la plasticidad neuronal a largo plazo . También se ha descubierto que EGR-1 regula la expresión de VAMP2 (una proteína importante para la exocitosis sináptica ). [8]

Además de su función en el sistema nervioso, hay evidencia significativa de que EGR-1 junto con su parálogo EGR-2 se induce en enfermedades fibróticas, tiene funciones clave en la fibrinogénesis y es necesario para la fibrosis inducida experimentalmente en ratones. [9]

También puede estar involucrado en la función ovárica [10]

Estructura

El dominio de unión al ADN de EGR-1 consta de tres dominios de dedos de zinc del tipo Cys 2 His 2. La estructura de aminoácidos del dominio de dedos de zinc de EGR-1 se muestra en esta tabla, utilizando el código de aminoácidos de una sola letra. Los dedos 1 a 3 se indican con f1 - f3. Los números hacen referencia a los residuos (aminoácidos) de la hélice alfa (no hay cero). Los residuos marcados con 'x' no son parte de los dedos de zinc, sino que sirven para conectarlos entre sí.

Clave de aminoácidos: Alanina (Ala, A), Arginina (Arg, R), Asparagina (Asn, N), Ácido aspártico (Asp, D), Cisteína (Cys, C), Ácido glutámico (Glu, E), Glutamina (Gln, Q), Glicina (Gly, G), Histidina (His, H), Isoleucina (Ile, I), Leucina (Leu, L), Lisina (Lys, K), Metionina (Met, M), Fenilalanina (Phe, F), Prolina (Pro, P), Serina (Ser, S), Treonina (Thr, T), Triptófano (Trp, W), Tirosina (Tyr, Y), Valina (Val, V)

La estructura cristalina del ADN unido por el dominio de dedo de zinc de EGR-1 se resolvió en 1991, lo que ayudó en gran medida a las primeras investigaciones en los dominios de unión al ADN con dedo de zinc. [11]

La proteína humana EGR-1 contiene (en su forma no procesada) 543 aminoácidos con un peso molecular de 57,5 ​​kDa , y el gen está ubicado en el cromosoma 5 .

Especificidad de unión al ADN

EGR-1 se une a la secuencia de ADN 5'-GCG TGG GCG-3' (y otras similares como 5'-GCG GGG GCG-3'). [12] [13] La posición f1 6 une la 5' G (la primera base desde la izquierda); la posición f1 3 a la segunda base (C); la posición f1 -1 se une a la tercera posición (G); la posición f2 6 a la cuarta base (T); y así sucesivamente.

Interacciones

Se ha demostrado que EGR-1 interactúa con:

Véase también

Referencias

  1. ^ abc GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000120738 – Ensembl , mayo de 2017
  2. ^ abc GRCm38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSMUSG00000038418 – Ensembl , mayo de 2017
  3. ^ "Referencia de PubMed humana:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  4. ^ "Referencia PubMed de ratón:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU . .
  5. ^ "Entrez Gene: Respuesta de crecimiento temprano EGR1 1".
  6. ^ Knapska E, Kaczmarek L (noviembre de 2004). "Un gen para la plasticidad neuronal en el cerebro de los mamíferos: Zif268/Egr-1/NGFI-A/Krox-24/TIS8/ZENK?". Progress in Neurobiology . 74 (4): 183–211. doi :10.1016/j.pneurobio.2004.05.007. PMID  15556287. S2CID  39251786.
  7. ^ Sun Z, Xu X, He J, Murray A, Sun MA, Wei X, Wang X, McCoig E, Xie E, Jiang X, Li L, Zhu J, Chen J, Morozov A, Pickrell AM, Theus MH, Xie H. EGR1 recluta a TET1 para dar forma al metiloma cerebral durante el desarrollo y tras la actividad neuronal. Nat Commun. 29 de agosto de 2019;10(1):3892. doi: 10.1038/s41467-019-11905-3. PMID 31467272
  8. ^ Petersohn D, Thiel G (agosto de 1996). "El papel de las proteínas de dedo de zinc Sp1 y zif268/egr-1 en la regulación transcripcional del gen humano de la sinaptobrevina II". Revista Europea de Bioquímica . 239 (3): 827–34. doi : 10.1111/j.1432-1033.1996.0827u.x . PMID  8774732.
  9. ^ Bhattacharyya S, Wu M, Fang F, Tourtellotte W, Feghali-Bostwick C, Varga J (mayo de 2011). "Factores de transcripción de respuesta de crecimiento temprano: mediadores clave de la fibrosis y nuevos objetivos para la terapia antifibrótica". Matrix Biology . 30 (4): 235–42. doi :10.1016/j.matbio.2011.03.005. PMC 3135176 . PMID  21511034. 
  10. ^ Han P, Guerrero-Netro H, Estienne A, Cao B, Price CA (octubre de 2017). "Regulación y acción de la respuesta de crecimiento temprano 1 en células de la granulosa bovina". Reproducción . 154 (4): 547–557. doi : 10.1530/REP-17-0243 . PMID  28733346.
  11. ^ Pavletich NP, Pabo CO (mayo de 1991). "Reconocimiento de ADN mediante dedo de cinc: estructura cristalina de un complejo Zif268-ADN a 2,1 A". Science . 252 (5007): 809–17. doi :10.1126/science.2028256. PMID  2028256. S2CID  38000717.
  12. ^ Christy B, Nathans D (noviembre de 1989). "Sitio de unión al ADN de la proteína inducible por factor de crecimiento Zif268". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 86 (22): 8737–41. Bibcode :1989PNAS...86.8737C. doi : 10.1073/pnas.86.22.8737 . PMC 298363 . PMID  2510170. 
  13. ^ Swirnoff AH, Milbrandt J (abril de 1995). "Especificidad de unión al ADN de NGFI-A y factores de transcripción de dedo de zinc relacionados". Biología molecular y celular . 15 (4): 2275–87. doi :10.1128/mcb.15.4.2275. PMC 230455 . PMID  7891721. 
  14. ^ Zhang F, Lin M, Abidi P, Thiel G, Liu J (noviembre de 2003). "La interacción específica de Egr1 y c/EBPbeta conduce a la activación transcripcional del gen del receptor de lipoproteína de baja densidad humana". The Journal of Biological Chemistry . 278 (45): 44246–54. doi : 10.1074/jbc.M305564200 . PMID  12947119.
  15. ^ ab Silverman ES, Du J, Williams AJ, Wadgaonkar R, Drazen JM, Collins T (noviembre de 1998). "La proteína de unión a la proteína de unión al elemento de respuesta a AMPc (CBP) y p300 son coactivadores transcripcionales del factor de respuesta al crecimiento temprano-1 (Egr-1)". The Biochemical Journal . 336 ( Pt 1) (1): 183–9. doi :10.1042/bj3360183. PMC 1219856 . PMID  9806899. 
  16. ^ Russo MW, Sevetson BR, Milbrandt J (julio de 1995). "Identificación de NAB1, un represor de la transcripción mediada por NGFI-A y Krox20". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 92 (15): 6873–7. Bibcode :1995PNAS...92.6873R. doi : 10.1073/pnas.92.15.6873 . PMC 41432 . PMID  7624335. 
  17. ^ Liu J, Grogan L, Nau MM, Allegra CJ, Chu E, Wright JJ (abril de 2001). "Interacción física entre p53 y el gen de respuesta primaria Egr-1". Revista Internacional de Oncología . 18 (4): 863–70. doi :10.3892/ijo.18.4.863. PMID  11251186.
  18. ^ Bae MH, Jeong CH, Kim SH, Bae MK, Jeong JW, Ahn MY, et al. (octubre de 2002). "Regulación de Egr-1 por asociación con el componente C8 del proteasoma". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Molecular Cell Research . 1592 (2): 163–7. doi : 10.1016/s0167-4889(02)00310-5 . PMID  12379479.

Lectura adicional

Enlaces externos