Tandy Warnow es un científico informático estadounidense y catedrático distinguido Grainger de ingeniería en la Universidad de Illinois en Urbana-Champaign . [4] [5] Es conocida por su trabajo en la reconstrucción de árboles evolutivos , tanto en biología como en lingüística histórica , y también por sus métodos de alineación de secuencias múltiples. [6]
Warnow realizó sus estudios universitarios y de posgrado en matemáticas en la Universidad de California, Berkeley , donde obtuvo una licenciatura en 1984 y un doctorado [2] en 1991 bajo la supervisión de Eugene Lawler . Los otros miembros de su comité de tesis fueron Richard Karp , Manuel Blum , Dan Gusfield y David Gale . [2]
Después de una investigación postdoctoral en la Universidad del Sur de California de 1991 a 1992 (supervisores postdoctorales Michael Waterman y Simon Tavare ) y en los Laboratorios Nacionales Sandia en Albuquerque de 1992 a 1993, ocupó un puesto docente en la Universidad de Pensilvania , donde permaneció hasta su traslado. en 1999 a la Universidad de Texas. En 2014, Warnow se unió a la facultad de la Universidad de Illinois en Urbana-Champaign (UIUC), donde ocupa la Cátedra Distinguida Grainger de Ingeniería y Jefa Asociada del Departamento de Ciencias de la Computación. Warnow tiene nombramientos de cortesía en los Departamentos de Biología Animal, Bioingeniería, Ingeniería Eléctrica e Informática, Entomología, Matemáticas, Biología Vegetal y Estadística. [5] [7]
En 1995, una investigación realizada por Warnow, Donald Ringe y Ann Taylor en la Universidad de Pensilvania basada en cálculos de filogenia perfecta proporcionó una teoría integral sobre el momento de las primeras subdivisiones en las lenguas indoeuropeas . Sus cálculos apoyaron la hipótesis indohitita según la cual la primera de estas subdivisiones en separarse del resto de las lenguas indoeuropeas fueron las lenguas de Anatolia . Sus resultados también apoyan la hipótesis greco-armenia , según la cual la lengua armenia y la lengua griega forman una subfamilia del indoeuropeo. Encajan las lenguas germánicas en el árbol evolutivo de las lenguas indoeuropeas, previamente considerado problemático, al plantear la hipótesis de que la lengua protogermánica estaba estrechamente relacionada con las lenguas baltoeslavas, pero luego fue modificada por las migraciones hacia el oeste de las tribus germánicas que las lideraron. en contacto con hablantes de cursiva y celta . [8] Warnow y sus colegas ampliaron posteriormente este enfoque de filogenia perfecta para permitir préstamos no detectados entre idiomas, de modo que la evolución del lenguaje se modele con una red en lugar de un árbol. [9]
En 2009, Warnow y sus colegas lanzaron su software SATé para coestimar alineamientos de secuencias múltiples biológicas y árboles evolutivos. [10] Su software se basa menos firmemente en principios matemáticos firmes que algunos métodos de coestimación anteriores (como BAli-Phy [11] ), pero es significativamente más rápido, lo que permite la construcción rápida de árboles y alineaciones altamente precisos para miles de especies. . En comparación, el lento rendimiento de los métodos anteriores los limitaba a comparar sólo docenas de especies a la vez. [12] [13]
Su trabajo desde 2014 se ha centrado en tres temas: escalar múltiples alineamientos de secuencias a conjuntos de datos ultragrandes, estimación de árboles de especies utilizando múltiples genes (y abordar la heterogeneidad del árbol de genes debido a una clasificación de linaje incompleta ) y metagenómica. Sus principales contribuciones en estos temas incluyen el método PASTA para la coestimación de alineamientos y árboles, que mejora el SATé y puede producir alineamientos de alta precisión con hasta 1.000.000 de secuencias. [14] También ha desarrollado el método ASTRAL para la estimación de árboles de especies, que es un método estadísticamente consistente para construir árboles de especies en presencia de una clasificación de linaje incompleta. [15]
Warnow fue nombrado Cátedra Distinguida de Ingeniería Grainger en 2020 y Profesor Fundador de Ingeniería en 2014 (ambos en UIUC), y la Cátedra Centenario David Bruton Jr. en Ciencias de la Computación en la Universidad de Texas en Austin en 2010. [5] Warnow también recibió una beca de la Fundación John Simon Guggenheim en 2011, una beca del Instituto Radcliffe en 2003, una beca de la Fundación David y Lucile Packard en 1996 y el premio NSF Young Investigator Award en 1994. [5] En 2015, fue nombrada miembro de la Asociación para Computing Machinery (ACM) "Por contribuciones a la teoría matemática, algoritmos y software para filogenética molecular y lingüística histórica a gran escala". [16] En 2017, fue elegida miembro de la Sociedad Internacional de Biología Computacional (ISCB). [17] Fue nombrada miembro de la promoción de 2021 de becarios de la Asociación Estadounidense para el Avance de la Ciencia . [18]
La madre de Warnow era la destacada archivera Joan Warnow-Blewett , y su padre era Morton Warnow, hijo del líder de la banda Mark Warnow y sobrino del compositor Raymond Scott . [19] Su hermana gemela es Kimmen Sjolander , investigadora en bioinformática y miembro emérito de la facultad de la Universidad de California. Está casada con George Chacko, profesor asociado de investigación en Ciencias de la Computación en la Facultad de Ingeniería Grainger de UIUC , [20] y tienen dos hijos juntos, Kristin y Menaka. [19]