El AIG Japan Open Tennis Championships 2006 fue un torneo de tenis jugado en canchas duras al aire libre . Fue la 33.ª edición del evento conocido ese año como AIG Japan Open Tennis Championships , y fue parte de la International Series Gold del ATP Tour 2006 , y de la Tier III Series del WTA Tour 2006. Tanto el evento masculino como el femenino se llevaron a cabo en el Ariake Coliseum en Tokio, Japón, del 2 al 8 de octubre de 2006. Roger Federer y Marion Bartoli ganaron los títulos individuales.
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Roger Federer derrotó
Tim Henman , 6-3, 6-3
Marion Bartoli derrotó
Aiko Nakamura , 2–6, 6–2, 6–2
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Ashley Fisher /
Tripp Phillips derrotó Paul Goldstein / Jim Thomas , 6-2, 7-5
Rey Vania /
Jelena Kostanić derrotó
Chan Yung-jan / Chuang Chia-jung , 7–6 (7–2) , 5–7, 6–2