La final de la Copa Intertoto de la UEFA de 1998 la ganaron el Valencia , el Werder Bremen y el Bolonia . Los tres equipos avanzaron a la Copa de la UEFA . El torneo de 1998 vio el debut de los clubes españoles en la competición y también el regreso de los clubes ingleses, desde la polémica que rodeó a sus participantes en 1995 .
Partido concedido porque Leiftur alineó a un jugador no elegible.
Baltika Kaliningrado ganó 5-1 en el global.
Örgryte ganó 5-2 en el global.
National București ganó 5-2 en total.
Debrecen ganó 10-2 en el global.
Brno ganó 6-1 en el global.
Vojvodina ganó 5-3 en el global.
El St. Gallen ganó 9-3 en el global.
OD Trenčín ganó 5-2 en el global.
El Vorskla Poltava ganó 6-0 en el global.
El GP de Macedonia ganó 5-3 en el global.
Torpedo Kutaisi ganó 7-1 en el global.
Ruch Chorzów ganó 3-2 en el global.
Rimavská Sobota ganó 3-2 en el global.
Kongsvinger ganó 9-1 en total.
Lyngby ganó 4-2 en el global.
Diósgyőr ganó 5-2 en el global.
Hradec Králové ganó 2-1 en el global.
Altay ganó 5-4 en el global.
TPS 3–3 Sion en el global. TPS ganó gracias a la regla de los goles de visitante .
Inkaras Kaunas 1–1 Baki Fahlasi en el global. Inkaras Kaunas ganó 5-4 en los penaltis .
El Werder Bremen ganó 5-1 en el global.
La Sampdoria ganó 2-1 en el global.
Naţional București ganó 4-3 en el global.
Vojvodina ganó 4-0 en el global.
Bastia ganó 7-1 en el global.
Altay ganó 2-1 en el global.
Baltika Kaliningrado ganó 1-0 en el global.
Akademisk Boldklub 3–3 Vorskla Poltava en el global. Vorskla Poltava ganó por regla de goles a domicilio .
Lommel 2-2 Torpedo Kutaisi en el global. Lommel ganó por la regla de los goles a domicilio .
El Samsunspor ganó 4-3 en el global.
El Austria Salzburgo ganó 3-2 en el global.
Brno 5-5 Espanyol en el global. El Espanyol ganó gracias a la regla de los goles marcados fuera de casa .
El Shinnik Yaroslavl ganó 5-2 en el global.
Örgryte 2–2 Ruch Chorzów en el global. Ruch Chorzów ganó por la regla de los goles a domicilio .
El Twente ganó 2-0 en el global.
Debrecen 1–1 Hradec Králové en el global. "Debrecen ganó por la regla de los goles a domicilio" .
Debrecen ganó 3-2 en el global.
La Sampdoria ganó 4-0 en el global.
El Espanyol ganó 2-1 en el global.
Ruch Chorzów 2–2 Estrela da Amadora en el global. Ruch Chorzów ganó 4-2 en los penaltis .
Bolonia 3–3 Nacional București en el global. "Bolonia ganó por regla de goles a domicilio" .
El Valencia ganó 4-2 en el global.
El Samsunspor ganó 4-0 en el global.
Fortuna Sittard ganó 5-2 en el global.
Bastia ganó 4-3 en el global.
El Werder Bremen ganó 5-2 en el global.
El Austria Salzburgo ganó 5-3 en el global.
Vojvodina ganó 4-2 en el global.
Vojvodina ganó 4-2 en el global.
El Bolonia ganó 3-2 en el global.
El Austria Salzburgo ganó 4-3 en el global.
Ruch Chorzów ganó 4-0 en el global.
El Werder Bremen ganó 6-0 en el global.
El Valencia ganó 3-0 en el global.
El Valencia ganó 4-1 en el global.
El Werder Bremen ganó 2-1 en el global.
El Bolonia ganó 3-0 en el global.