Biología Sintética Lenguaje Abierto

Norma para el intercambio de diseños biológicos

El lenguaje abierto de biología sintética ( SBOL ) ^[1] es un estándar de datos propuesto para intercambiar diseños de biología sintética entre paquetes de software. ^{[2] El grupo de desarrolladores de SBOL [3]} lo ha estado desarrollando desde 2008. Este grupo tiene como objetivo desarrollar el estándar de una manera abierta y democrática para incluir tantos intereses como sea posible y evitar el dominio por parte de una sola empresa. El grupo también tiene como objetivo desarrollar y mejorar el estándar de diseño con el tiempo, ya que el campo de la biología sintética refleja este desarrollo.

También se ha creado un lenguaje de modelado gráfico llamado SBOL Visual para visualizar diseños SBOL. ^[4]

Símbolos visuales estándar del Lenguaje Abierto de Biología Sintética (SBOL): promotor , sitio de unión del cebador , cds , sitio de restricción , etc.

Lanzamientos

Referencias

1. "El lenguaje abierto de la biología sintética (SBOL)".
2. Galdzicki, Michal; Clancy, Kevin P; Oberortner, Ernst; Pocock, Matthew; Quinn, Jacqueline Y; Rodriguez, Cesar A; Roehner, Nicholas; Wilson, Mandy L; Adam, Laura; Anderson, J Christopher; Bartley, Bryan A; Beal, Jacob; Chandran, Deepak; Chen, Joanna; Densmore, Douglas; Endy, Drew; Grünberg, Raik; Hallinan, Jennifer; Hillson, Nathan J; Johnson, Jeffrey D; Kuchinsky, Allan; Lux, Matthew; Misirli, Goksel; Peccoud, Jean; Plahar, Hector A; Sirin, Evren; Stan, Guy-Bart; Villalobos, Alan; Wipat, Anil; Gennari, John H; Myers, Chris J; Sauro, Herbert M (6 de junio de 2014). "El lenguaje abierto de biología sintética (SBOL) proporciona un estándar comunitario para comunicar diseños en biología sintética". Nature Biotechnology . 32 (6): 545–550. doi : 10.1038/nbt.2891 . PMID  24911500.
3. "Gobernanza | Lenguaje Abierto de Biología Sintética (SBOL)". sbolstandard.org . Archivado desde el original el 1 de diciembre de 2015.
4. Quinn, Jacqueline Y.; Cox, Robert Sidney; Adler, Aaron; Beal, Jacob; Bhatia, Swapnil; Cai, Yizhi; Chen, Joanna; Clancy, Kevin; Galdzicki, Michal; Hillson, Nathan J.; Le Novère, Nicolas; Maheshwari, Akshay J.; McLaughlin, James Alastair; Myers, Chris J.; P, Umesh; Pocock, Matthew; Rodriguez, Cesar; Soldatova, Larisa; Stan, Guy-Bart V.; Swainston, Neil; Wipat, Anil; Sauro, Herbert M. (3 de diciembre de 2015). "SBOL Visual: un lenguaje gráfico para diseños genéticos". PLOS Biology . 13 (12): e1002310. doi : 10.1371/journal.pbio.1002310 . Número  de modelo : PMID 26633141 . 
5. Beal, Jacob; Cox, Robert Sidney; Grünberg, Raik; McLaughlin, James; Nguyen, Tramy; Bartley, Bryan; Bissell, Michael; Choi, Kiri; Clancy, Kevin; MacKlin, Chris; Madsen, Curtis; Misirli, Goksel; Oberortner, Ernst; Pocock, Matthew; Roehner, Nicholas; Samineni, Meher; Zhang, Michael; Zhang, Zhen; Zundel, Zach; Gennari, John H.; Myers, Chris; Sauro, Herbert; Wipat, Anil (2016). "Synthetic Biology Open Language (SBOL) Versión 2.1.0". Revista de bioinformática integrativa . 13 (3): 291. doi : 10.1515/jib-2016-291 . hdl : 1983/5e0058e9-0cfa-40a5-b0b8-6195f61ff524 . PMID:  28187407.