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estreptomicetáceas

Streptomycetaceae es una familia de la clase Actinomycetota , que forma el orden monotípico Streptomycetales . Incluye el importante género Streptomyces . Ésta fue la fuente original de muchos antibióticos , concretamente la estreptomicina , el primer antibiótico contra la tuberculosis .

genómica

Los alineamientos de secuencias de genomas actinomicetotales han llevado a la identificación de tres indeles característicos conservados que son exclusivos del orden Streptomycetales. La enzima PBGD contiene una inserción de cuatro aminoácidos que está presente en todas las especies de Streptomyces y Kitasatospora setae , pero no en ningún otro Actinomycetota. De manera similar, una inserción de un aminoácido está presente en una región conservada de la adenilato quinasa y se encuentra en todas las especies de Streptomyces y K. setae , pero no se encuentra en ningún otro Actinomycetota. También se han identificado cinco proteínas distintivas conservadas que están presentes en varias especies de Streptomyces secuenciadas , pero no en K. setae ; sin embargo, como aún no se ha secuenciado el genoma completo de K. setae , estas proteínas pueden estar presentes en K. setae . Además, se han identificado 11 proteínas distintivas conservadas que se encuentran en todas las especies secuenciadas de Streptomyces y K. setae . Se cree que estas proteínas son exclusivas del orden Streptomycetales, por lo que proporcionan marcadores moleculares que pueden usarse para distinguir este grupo del resto de Actinomycetota. Los árboles filogenéticos indican que el orden Catenulisporales está estrechamente relacionado con el orden Streptomycetales. Esta inferencia está respaldada por un indel característico conservado de un aminoácido que se encuentra de forma única en todas las especies de Streptomycetales y Catenulisporales acidiphilia , la única especie de Catenulisporales cuyo genoma completo ha sido secuenciado. Además, se han identificado tres proteínas distintivas conservadas que se encuentran en todas las especies de Streptomycetales y C. acidiphilia . Tanto el indel característico conservado como las proteínas distintivas conservadas proporcionan evidencia de que los órdenes Streptomycetales y Catenulisporales están estrechamente relacionados. [4]

Filogenia

La taxonomía actualmente aceptada se basa en la Lista de nombres procarióticos con estatus en la nomenclatura (LPSN) [3] y el Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI) [5].

Géneros incertae sedis:

Ver también

Notas

  1. ^ Allostreptomyces no está incluido en este árbol filogenético.

Referencias

  1. ^ Waksman SA, Henrici AT (1943). "La Nomenclatura y Clasificación de los Actinomicetos". J Bacteriol . 46 (4): 337–341. doi :10.1128/jb.46.4.337-341.1943. PMC  373826 . PMID  16560709. S2CID  8824754.
  2. ^ Cavalier-Smith T. (2002). "El origen neomurano de las arqueobacterias, la raíz negibacteriana del árbol universal y la megaclasificación bacteriana". Int J Syst Evol Microbiol . 52 (Parte 1): 7–76. doi : 10.1099/00207713-52-1-7 . PMID  11837318.
  3. ^ ab AC Parte; et al. "Estreptomicetáceas". Lista de nombres procarióticos con posición en la nomenclatura (LPSN) . Consultado el 9 de septiembre de 2023 .
  4. ^ Gao, B.; Gupta, RS (2012). "Marco filogenético y firmas moleculares de los principales clados del filo Actinobacteria". Reseñas de Microbiología y Biología Molecular . 76 (1): 66-112. doi :10.1128/MMBR.05011-11. PMC 3294427 . PMID  22390973. 
  5. ^ Repetidores; et al. "Estreptomicetáceas". Base de datos de taxonomía del Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI) . Consultado el 9 de septiembre de 2023 .
  6. ^ Nouioui I, Carro L, García-López M, Meier-Kolthoff JP, Woyke T, Kyrpides NC, Pukall R, Klenk HP, Goodfellow M, Markus Göker M (2018). "Clasificación taxonómica basada en el genoma del filo actinobacteria". Frente. Microbiol . 9 : 2007. doi : 10.3389/fmicb.2018.02007 . PMC 6113628 . PMID  30186281. 
  7. ^ "El LTP" . Consultado el 20 de noviembre de 2023 .
  8. ^ "Árbol LTP_all en formato newick" . Consultado el 20 de noviembre de 2023 .
  9. ^ "Notas de la versión LTP_08_2023" (PDF) . Consultado el 20 de noviembre de 2023 .
  10. ^ "Versión GTDB 08-RS214". Base de datos de taxonomía del genoma . Consultado el 10 de mayo de 2023 .
  11. ^ "bac120_r214.sp_label". Base de datos de taxonomía del genoma . Consultado el 10 de mayo de 2023 .
  12. ^ "Historia del taxón". Base de datos de taxonomía del genoma . Consultado el 10 de mayo de 2023 .

enlaces externos

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