Salmonella entérica subsp. enterica es una subespecie de Salmonella enterica , la bacteria Gram-negativa , flagelada , aeróbica y conforma de bastón. Muchos de los serovares patógenos de la especie S. enterica se encuentran en esta subespecie, incluido el responsable de la fiebre tifoidea . [1]
Salmonella entérica subsp. los serovares entéricos se definen en función de sus antígenos somáticos (O) y flagelares (H), con más de 2600 serovares en total; sólo alrededor de 50 de estos serovares son causas comunes de infecciones en humanos. [2] La mayoría de estos serovares se encuentran en el medio ambiente y sobreviven en las plantas, el agua y el suelo; Muchos serovares tienen una amplia gama de huéspedes que les permiten colonizar diferentes especies de mamíferos, aves, reptiles, anfibios e insectos. Las enfermedades zoonóticas , como la Salmonella , se propagan entre el medio ambiente y las personas. [3]
Actualmente se utilizan varias técnicas para diferenciar entre serotipos . Estos incluyen la búsqueda de la presencia o ausencia de antígenos , fagotipificación , huellas dactilares moleculares y biotipificación, donde los serovares se diferencian según los nutrientes que pueden fermentar. Un posible factor para determinar el rango de huéspedes de serovares particulares es la adquisición mediada por fagos de una pequeña cantidad de elementos genéticos que permiten la infección de un huésped particular. [4] Se postula además que los serovares que infectan a una gama limitada de especies se han separado de ancestros con una amplia gama de huéspedes y desde entonces se han especializado y han perdido la capacidad de infectar a algunos huéspedes. [5]
Los CDC publican un Informe Anual de Salmonella con una lista de los serovares más comúnmente asociados con enfermedades humanas; los 10 serovares principales se enumeran a continuación: [6]
Los estudios han concluido que la mayoría de las cepas de Salmonella enterica subsp. Los serovares enterica poseen plásmidos de virulencia específicos de serotipo . Se trata de virulencia asociada a plásmidos que se caracterizan por plásmidos con un número de copias bajo y, según el serotipo, su tamaño oscila entre 50 y 100 kb. [7] En 2012, PulseNet de los CDC se dio cuenta de un grupo emergente de SNP de Serovar Infantis resistente a múltiples fármacos , denominado REPJFX01. Este grupo de SNP tiene un megaplasmido grande (pESI) que contiene múltiples genes de resistencia a los medicamentos. [8] El USDA NARMS declaró que debido a este plásmido pESI, el serovar Infantis es el serovar líder en aves de corral. [9] NCBI tiene más de 12.500 aislamientos en el grupo REPJFX01 SNP, de los cuales más de 3.700 son aislados clínicos. [10] También se ha descubierto que el serovar Enteritidis, que es el serovar más común aislado en casos clínicos humanos, produce endotoxinas , codificadas por los genes stn y sly A, que se atribuyen a la patogenicidad de Enteritidis. [11]
En noviembre de 2016, surgió en Pakistán, principalmente en las ciudades de Hyderabad y Karachi , una nueva cepa de Salmonella enterica serovar Typhi extremadamente resistente a los medicamentos (XDR). [12] Las cepas resistentes a múltiples fármacos han estado presentes desde finales de la década de 1970 en África y Asia. [13] Estas cepas XDR son resistentes a todas las opciones de tratamiento con antibióticos: cloranfenicol , ampicilina , trimetoprim-sulfametoxazol , fluoroquinolonas y cefalosporinas de tercera generación . El brote ha estado en curso desde 2016. [14]
La nomenclatura de Salmonella enterica ha sido durante mucho tiempo un tema de debate en la comunidad de microbiología. [15] Originalmente en la década de 1880, las especies de Salmonella recibieron el nombre de la enfermedad, el huésped o la ubicación geológica con la que estaban asociadas; sin embargo, esta caracterización taxonómica fue cuestionada debido a que los miembros del género se clasificaron de manera incompatible con sus similitudes genéticas. En la década de 1980, el surgimiento de la secuenciación de nucleótidos y la hibridación de ADN llevó a muchos bacteriólogos consagrados como Le Minor y Popoff (1987), Euzéby (1999) y Ezaki y Yabuuchi (2000) a presentar propuestas de cambios de nomenclatura. [16] No fue hasta 2005, que Le Minor y Popoff volvieron a proponer y establecieron que " Salmonella enterica " sería el nombre de especie aprobado – excluyendo Salmonella bongori – y que Salmonella enterica contiene seis subespecies, de las cuales Salmonella enterica subsp. enterica contiene la mayor cantidad de serovares. [17] Los avances tecnológicos permiten a los investigadores utilizar datos de secuenciación del genoma completo para identificar y agrupar serovares utilizando dos métodos: tipificación de secuencia y reconocimiento de antígenos. [18]
Los nombres de serovares están en mayúscula, pero no en cursiva ni subrayados. Los serovares pueden designarse en forma completa o abreviada (incluye solo los nombres de género y serovares). Por ejemplo, en la designación completa Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi se escribe como tal, pero en una designación breve se escribe Salmonella Typhi. [19] Cada serotipo también puede tener muchas cepas, lo que permite un rápido aumento en el número total de bacterias antigénicamente variables . [20]
La Organización Mundial de la Salud caracteriza la salmonelosis como una enfermedad transmitida por los alimentos cuyos síntomas incluyen diarrea, fiebre, náuseas, vómitos y, en casos graves, la muerte. [21] Se ha evaluado que la salmonelosis ocurre principalmente en huéspedes humanos debido a la colonización bacteriana del tracto intestinal después del consumo de alimentos o agua contaminados, pero también se sabe que se transmite de persona a persona a través de la ruta fecal-oral. [22] Para reducir el riesgo asociado con contraer esta enfermedad, se deben aplicar medidas adecuadas de seguridad alimentaria a los productos alimenticios de alto riesgo, como aves, carne de res, cerdo, cordero, huevos y productos frescos. [23] Los fabricantes de alimentos, proveedores de ingredientes, restaurantes y cocineros caseros deben practicar procedimientos de procesamiento sanitario, almacenar los alimentos a menos de 5 °C y cocinar completamente todos los alimentos a las temperaturas designadas como seguras para el consumo. [23] Se ha vuelto cada vez más difícil mitigar la presencia de infecciones por salmonelosis en la población humana debido a la naturaleza única de los serovares resistentes a múltiples fármacos como resultado de los efectos contraproducentes del uso de antibióticos como tratamiento de amplio espectro. [24] Las deficiencias inmunitarias clave del huésped asociadas con el VIH , la malaria y la desnutrición han contribuido a una amplia propagación de esta enfermedad y a la necesidad de utilizar costosos medicamentos antimicrobianos en los servicios de salud más pobres del mundo. [25] Pero también se ha demostrado que los factores bacterianos, como la actividad regulada positivamente del gen de virulencia pgtE , debido a un polimorfismo de un solo nucleótido (SNP) en su región promotora, tienen un gran impacto en la patogénesis de este tipo de secuencia de Salmonella en particular . [26]
Hay factores que pueden aumentar el riesgo de infección. Estos incluyen un pH más alto en el estómago, resección gástrica y tratamiento con amortiguadores antiácidos. [27] Si el estómago tiene un pH más bajo, esto ayuda como técnica defensiva para evitar potencialmente una infección. [28]
Esta cepa es mesófila y algunas pueden sobrevivir a temperaturas extremadamente bajas o altas, que pueden oscilar entre 2 °C y 54 °C. [29] Los factores sigma dentro de la célula controlan la expresión genética y pueden detectar los cambios en el medio ambiente desde la membrana externa mediante la activación de genes que luego responden al estrés por calor y se adaptan en consecuencia. [30] S. enterica también puede responder rápidamente a las bajas temperaturas mediante proteínas de choque frío (CSP) sintetizándose a sí mismas para que la célula pueda reanudar su crecimiento más tarde. [31] El cloro puede ser un factor estresante químico para S. enterica porque una vez que el cloro está presente, S. enterica puede producir una biopelícula que se proporciona a sí misma con una matriz de exopolisacárido que tiene la capacidad de un ataque químico contra el cloro. [32] A partir de esto, el cloro tiene medidas preventivas para la formación de biopelículas en los sistemas de bebederos de aves y esto reduce el riesgo de S. enterica . [33] La adaptación exitosa permite a S. enterica resistir condiciones más ácidas, contrarrestando los efectos antibacterianos del estómago. [34]