SYBR Green I ( SG ) es un colorante de cianina asimétrico [1] utilizado como tinción de ácidos nucleicos en biología molecular . La familia de colorantes SYBR es producida por Molecular Probes Inc. , ahora propiedad de Thermo Fisher Scientific . SYBR Green I se une al ADN . El complejo de ADN-colorante resultante absorbe mejor la luz azul de 497 nanómetros (λ max = 497 nm) y emite luz verde (λ max = 520 nm). El colorante se une preferentemente al ADN bicatenario, pero teñirá el ADN monocatenario (ss) con un rendimiento menor. SYBR Green también puede teñir ARN con un rendimiento menor que el ssDNA.
El SYBR Green se utiliza en varias áreas de la bioquímica y la biología molecular . Se utiliza como colorante para la cuantificación del ADN bicatenario en algunos métodos de PCR cuantitativa . [2] También se utiliza para visualizar el ADN en la electroforesis en gel . Se pueden utilizar concentraciones más altas de SYBR Green para teñir geles de agarosa con el fin de visualizar el ADN presente. Además de marcar ácidos nucleicos puros, SYBR Green también se puede utilizar para marcar el ADN dentro de las células para la citometría de flujo y la microscopía de fluorescencia . En estos casos, puede ser necesario el tratamiento con ARNasa para reducir el fondo del ARN en las células.
Se publicó un estudio exhaustivo de colorantes de ADN basados en naranja de tiazol, que incluía SYBR Safe, SYBR Green, PicoGreen, SYTO-16, SYTO-9 y un nuevo derivado TOPhBu. En este estudio, se publica la síntesis de estos compuestos y se caracteriza espectroscópicamente para cuantificar su mejora de fluorescencia al unirse al ADN bicatenario. La capacidad de los colorantes para detectar ADN a bajas concentraciones se evaluó utilizando dos nuevas métricas, mejora de fluorescencia absoluta (AFE) y mejora de fluorescencia relativa (RFE). Se probaron en experimentos de qPCR que mostraron algunas diferencias importantes en la sensibilidad y la eficiencia de qPCR, que facilitan la selección de marcadores de ADN para fines analíticos. [3] Este estudio mostró que Sybr Green exhibe la mayor mejora de fluorescencia (AFE) y proporcionó la mejor característica para los métodos de PCR. El segundo mejor fue TOPhBu, que tiene valores cercanos a Sybr Green.
SYBR Green I se comercializa como un sustituto del bromuro de etidio , un posible mutágeno humano , ya que es más seguro trabajar con él y no presenta los complejos problemas de eliminación de desechos que presenta el bromuro de etidio. Sin embargo, cualquier molécula pequeña capaz de unirse al ADN con alta afinidad es un posible carcinógeno , incluido SYBR Green.
En un estudio en el que se utilizó la prueba de Ames , que mide la capacidad de los productos químicos para causar mutaciones, cuando se analizó en la misma concentración, el SYBR Green I fue del orden de 30 veces menos mutagénico que el bromuro de etidio. [4]