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Caja fuerte SYBR

SYBR Safe es un colorante de cianina [1] que se utiliza como colorante de ácidos nucleicos en biología molecular . [2] SYBR Safe es uno de los varios colorantes SYBR fabricados por Life Technologies Corporation. SYBR Safe se une al ADN . El complejo de ADN-colorante resultante absorbe luz azul (λ max = 509 nm) y emite luz verde (λ max = 524 nm).

Se publicó un estudio exhaustivo de los colorantes de ADN basados ​​en naranja de tiazol, que incluía SYBR Safe, SYBR Green, PicoGreen, SYTO-16, SYTO-9 y un nuevo derivado TOPhBu. En este trabajo, se publica la síntesis de estos compuestos y se caracteriza espectroscópicamente para cuantificar su aumento de fluorescencia al unirse al ADN de doble cadena. Se evaluó la capacidad de los colorantes para detectar ADN a bajas concentraciones utilizando dos nuevas métricas, el aumento absoluto de la fluorescencia (AFE) y el aumento relativo de la fluorescencia (RFE). Se probaron en experimentos de qPCR que mostraron algunas diferencias importantes en la sensibilidad y la eficiencia de la qPCR, lo que facilita la selección de marcadores de ADN para fines analíticos. [3]

Seguridad

SYBR Safe se comercializa como una alternativa más segura al bromuro de etidio . [4] SYBR Safe tiene una estructura muy similar a la del naranja de tiazol, [5] [6] [7] que tiene un grupo metilo unido al nitrógeno cargado, mientras que SYBR Safe tiene un grupo N -propilo. Se ha demostrado que el naranja de tiazol es de tres a cuatro veces menos mutagénico que el bromuro de etidio, mientras que SYBR Safe es de cuatro a cinco veces menos mutagénico. [8] Además, según el sitio web de Life Technologies, SYBR Safe no es letal en ratas en dosis tan altas como 5 g/kg, y las ratas no muestran síntomas de toxicidad aguda. El naranja de tiazol sí muestra toxicidad en esta dosis.

Colorantes de cianina similares

Véase también

Referencias

  1. ^ Evenson WE; Boden LM; Muzikar KA; O'Leary DJ (2012). "Asignaciones de RMN de 1H y 13C para los colorantes de cianina SYBR Safe y naranja de tiazol". Journal of Organic Chemistry . 77 (23): 10967–10971. doi :10.1021/jo3021659. PMID  23137048.
  2. ^ Se utiliza más comúnmente como tinción de ADN en electroforesis en gel de agarosa.
  3. ^ Domahidy, Farkas; Kovács, Beatriz; Cseri, Levente; Katona, Gergely; Rózsa, Balázs; et al. (19 de junio de 2024). "Estudio integral de tintes de ADN a base de tiazol-naranja". ChemPhotoChem . doi : 10.1002/cptc.202400080 . ISSN  2367-0932. Este artículo incorpora texto de esta fuente, que está disponible bajo la licencia CC BY 4.0.
  4. ^ Haines, Alicia M.; Tobe, Shanan S.; Kobus, Hilton J.; Linacre, Adrian (marzo de 2015). "Propiedades de los colorantes de tinción de ácidos nucleicos utilizados en la electroforesis en gel". Electroforesis . 36 (6): 941–944. doi :10.1002/elps.201400496. PMID  25546455. S2CID  27324826.
  5. ^ O'Neil, Casey S.; Beach, Jacie L.; Gruber, Todd D. (junio de 2018). "Naranja de tiazol como reemplazo cotidiano del bromuro de etidio y colorantes de ADN costosos para electroforesis". Electroforesis . 39 (12): 1474–1477. doi :10.1002/elps.201700489. PMID  29645293. S2CID  4790798.
  6. ^ Evenson, William E.; Boden, Lauren M.; Muzikar, Katy A.; O'Leary, Daniel J. (27 de noviembre de 2012). "Tareas de RMN de 1H y 13C para los colorantes de cianina SYBR Safe y naranja de tiazol". The Journal of Organic Chemistry . 77 (23): 10967–10971. doi :10.1021/jo3021659. PMID  23137048.
  7. ^ Biancardi, Alessandro; Tarita, Biver; Alberto, Marini; Benedetta, Mennucci; Fernando, Secco (2011). "Naranja de tiazol (TO) como sonda para interruptores de luz: un estudio combinado cuántico-mecánico y espectroscópico". Química física Química Física . 13 (27): 12595–12602. Bibcode :2011PCCP...1312595B. doi :10.1039/C1CP20812H. PMID  21660321.
  8. ^ Evenson WE; Boden LM; Muzikar KA; O'Leary DJ (2012). "Asignaciones de RMN de 1H y 13C para los colorantes de cianina SYBR Safe y naranja de tiazol". Journal of Organic Chemistry . 77 (23): 10967–10971. doi :10.1021/jo3021659. PMID  23137048.