Proteína ribosomal SA

Gen codificador de proteínas en la especie Homo sapiens

La proteína ribosomal 40S SA es una proteína ribosomal que en los humanos está codificada por el gen RPSA . ^{[5] [6]} También actúa como receptor de la superficie celular , en particular para la laminina , y está implicada en varios procesos patogénicos.

Función

Las lamininas , una familia de glucoproteínas de la matriz extracelular , son el principal componente no colágeno de las membranas basales . Se las ha implicado en una amplia variedad de procesos biológicos, entre los que se incluyen la adhesión celular , la diferenciación , la migración , la señalización , el crecimiento de neuritas y la metástasis . Muchos de los efectos de la laminina están mediados por interacciones con los receptores de la superficie celular . Estos receptores incluyen miembros de la familia de las integrinas , así como proteínas de unión a la laminina no integrinas. El gen RPSA codifica una proteína multifuncional, que es a la vez una proteína ribosómica y un receptor de laminina no integrina de alta afinidad. Esta proteína se ha denominado de diversas formas: proteína ribosómica SA; RPSA; LamR; LamR1; Precursor del receptor de laminina de 37 kDa; 37LRP; Receptor de laminina de 67 kDa; 67LR; Receptor de laminina de 37/67 kDa; LRP/LR; LBP/p40; y proteína asociada al ribosoma p40. La proteína ribosomal SA y RPSA son el nombre y símbolo aprobados. La secuencia de aminoácidos de RPSA está altamente conservada a través de la evolución , lo que sugiere una función biológica clave . Se ha observado que el nivel de transcripción de RPSA es mayor en el tejido de carcinoma de colon y en las líneas celulares de cáncer de pulmón que en sus contrapartes normales. Además, existe una correlación entre la regulación positiva de este polipéptido en las células cancerosas y su fenotipo invasivo y metastásico . Existen múltiples copias del gen RPSA; sin embargo, la mayoría de ellas son pseudogenes que se cree que surgieron de eventos retroposicionales . Se han encontrado dos variantes de transcripción empalmadas alternativamente que codifican la misma proteína para este gen. ^[7]

Estructura y estabilidad

El ADN complementario (ADNc) del gen RPSA está formado por el ensamblaje de siete exones, seis de los cuales corresponden a la secuencia codificante. ^[6] La secuencia de aminoácidos de RPSA, deducida a partir de la secuencia de su ADNc, incluye 295 residuos. RPSA se puede subdividir en dos dominios principales: un dominio N (residuos 1–209), que corresponde a los exones 2-5 del gen, y un dominio C (residuos 210–295), que corresponde a los exones 6–7. El dominio N de RPSA es homólogo a la proteína ribosomal S2 (RPS2) de los procariotas. Contiene una secuencia palindrómica 173LMWWML178 que se conserva en todos los metazoos. Su dominio C está altamente conservado en vertebrados. La secuencia de aminoácidos de RPSA es 98% idéntica en todos los mamíferos. RPSA es una proteína ribosomal que ha adquirido la función de receptor de laminina durante la evolución. ^{[8] [9]} La estructura del dominio N de RPSA es similar a la del RPS2 procariota. ^[10] El dominio C está intrínsecamente desordenado en solución. El dominio N es monomérico en solución y se despliega de acuerdo con un equilibrio de tres estados. El intermediario de plegamiento es predominante a 37 °C. ^[11]

Interacciones

Varias interacciones de RPSA que se habían descubierto originalmente mediante métodos de biología celular se han confirmado posteriormente mediante el uso de derivados recombinantes y experimentos in vitro. Estos últimos han demostrado que el dominio N plegado y el dominio C desordenado de RPSA tienen funciones comunes y específicas. ^[12]

• La RPSA se une a proteínas que participan en la traducción del código genético. (i) Las pruebas de doble híbrido en levadura han demostrado que la RPSA se une a la proteína ribosomal S21 de la subunidad ribosomal pequeña 40S. ^{[13] [14]} (ii) Las deleciones seriadas de la RPSA han demostrado que el segmento de residuos 236-262, incluido en el dominio C, está involucrado en la interacción entre la RPSA y la subunidad 40S del ribosoma. ^[15] (iii) Los estudios basados ​​en espectroscopia de resonancia magnética nuclear (RMN) han demostrado que el dominio de unión del anticodón de la lisil-ARNt sintetasa se une directamente al dominio C de la RPSA. ^[16]
• La RPSA se identificó inicialmente como una proteína de unión a la laminina. ^{[17] [18]} Tanto el dominio N recombinante como el dominio C de la RPSA se unen a la laminina in vitro y se unen con constantes de disociación similares (300 nM). ^{[10] [12]}
• Tanto la RPSA como la laminina pertenecen al interactoma heparina/sulfato de heparán. ^[19] La heparina se une in vitro al dominio N de la RPSA, pero no a su dominio C. Además, el dominio C de la RPSA y la heparina compiten por la unión a la laminina, lo que demuestra que el dominio C altamente ácido de la RPSA imita a la heparina (y potencialmente a los sulfatos de heparán) en la unión a la laminina. ^[12]
• El RPSA es un receptor celular potencial para varios flavivirus patógenos , incluido el virus del dengue (DENV), ^{[20] [21]} y alfavirus , incluido el virus Sindbis (SINV). ^[22] El dominio N del RPSA incluye un sitio de unión para SINV in vitro. ^[10] El dominio N también incluye sitios de unión débiles para el dominio recombinante 3 (ED3, residuos 296-400) de las proteínas de la envoltura de dos flavivirus , el virus del Nilo Occidental y el serotipo 2 del DENV. El dominio C incluye sitios de unión débiles para el dominio 3 del virus de la fiebre amarilla (YFV) y de los serotipos 1 y 2 del DENV. Por el contrario, el dominio 3 del virus de la encefalitis japonesa no parece unirse al RPSA in vitro. ^[12]
• RPSA también es un receptor para moléculas pequeñas. (i) RPSA se une a la aflatoxina B1 tanto in vivo como in vitro. ^[23] (ii) RPSA es un receptor para el galato de epigalocatequina (EGCG), que es un componente principal del té verde y tiene muchos efectos relacionados con la salud. ^{[24] [25]} EGCG se une solo al dominio N de RPSA in vitro, con una constante de disociación de 100 nM, pero no a su dominio C. ^[12]

Referencias

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