La geranilgeraniltransferasa Rab, también conocida como (proteína) geranilgeraniltransferasa II, es una de las tres preniltransferasas . Transfiere (normalmente) dos grupos geranilgeranilo a la(s) cisteína(s) en el extremo C de las proteínas Rab . [2]
El extremo C de las proteínas Rab varía en longitud y secuencia y se denomina hipervariable. Por lo tanto, las proteínas Rab no tienen una secuencia de consenso, como la secuencia CAAX, que la geranilgeraniltransferasa Rab pueda reconocer. En cambio, las proteínas Rab se unen mediante la proteína de escolta Rab (REP) en una región más conservada de la proteína Rab y luego se presentan a la geranilgeraniltransferasa Rab.
Una vez que las proteínas Rab están preniladas, los anclajes lipídicos garantizan que las Rab ya no sean solubles. Por lo tanto, el REP desempeña un papel importante en la unión y solubilización de los grupos geranilgeranilo y transporta la proteína Rab a la membrana celular correspondiente.
La geranilgeraniltransferasa Rab (RabGGTasa; código de la comisión de enzimas EC 2.5.1.60) está clasificada como una enzima transferasa; específicamente, pertenece a la familia de las proteínas preniltransferasas junto con otras dos enzimas (la proteína farnesiltransferasa y la proteína geranilgeraniltransferasa tipo I). La reacción catalizada por la RabGGTasa se resume de la siguiente manera:
Esta reacción es esencial para controlar la unión y fusión de las membranas. Estudios realizados en ratones han demostrado que los genes de la GGTasa Rab se expresan en todos los órganos adultos principales, así como en algunas unidades embrionarias, como la médula espinal y el hígado (Chinpaisal).
La “externalización” de la especificidad de la geranilgeraniltransferasa Rab (utilizando REP para interactuar con las proteínas Rab que prenila, como se mencionó anteriormente) es única entre las preniltransferasas. La Rab GGTasa es “responsable de la mayor cantidad de eventos de prenilación de proteínas individuales en la célula”, [1] probablemente debido a esta capacidad de interactuar con muchas proteínas Rab diferentes (puede prenilar cualquier secuencia que contenga un residuo de cisteína).
Estudios in vitro han demostrado que la Rab GGTasa puede ser inhibida por fármacos bifosfonatos que contienen nitrógeno, como el risedronato; sin embargo, los efectos de dichos fármacos parecen ser mucho más limitados in vivo (Coxon).
La RabGGTasa es un heterodímero compuesto por subunidades alfa y beta que están codificadas por los genes RABGGTA y RABGGTB , respectivamente. La estructura de la RabGGTasa de rata se ha determinado por difracción de rayos X (ver imagen a la izquierda) a una resolución de 1,80 Å. [1] La estructura secundaria de la RabGGTasa está compuesta en gran parte por hélices alfa ; la subunidad alfa es 74% helicoidal sin láminas beta , mientras que la subunidad beta es 51% helicoidal y 5% lámina beta. Hay 28 hélices alfa en total (15 en la subunidad alfa y 13 en la subunidad beta) y 15 láminas beta muy cortas (no más de 4 residuos). La RabGGTasa funcional se une a tres iones metálicos como ligandos: dos iones de calcio (Ca 2+ ) y un ion de zinc (Zn 2+ ), todos los cuales interactúan con la subunidad beta.
