organización científica americana
La Asociación de Instalaciones de Recursos Biomoleculares (ABRF) se dedica a promover los laboratorios de biotecnología centrales y de investigación a través de la investigación, la comunicación y la educación. [1] Los miembros de ABRF incluyen más de 2000 científicos que representan 340 laboratorios centrales diferentes en 41 países, incluidos aquellos de la industria, el gobierno, las instituciones académicas y de investigación.
Historia
En 1986 se celebró una reunión satélite del Fondo de Recursos de Investigación junto con la Sexta Conferencia Internacional sobre Métodos de Análisis de Secuencias de Proteínas. [ cita necesaria ] El año siguiente se enviaron muestras de secuenciación de proteínas y aminoácidos para inspeccionar 103 instalaciones principales. En 1989, la ABRF se organizó e incorporó formalmente. Cada año se celebró una reunión anual como reunión satélite de la Protein Society hasta 1996, cuando comenzaron las reuniones separadas. [2]
Grupos de Investigación ABRF
Los Grupos de Investigación se establecen para cumplir dos de los propósitos de la Asociación de Instalaciones de Recursos Biomoleculares. En primer lugar, proporcionar mecanismos para la autoevaluación y la mejora de la exactitud, precisión y eficiencia de los procedimientos y operaciones en las instalaciones de recursos y los laboratorios de investigación. En segundo lugar, contribuir a la educación del personal de las instalaciones de recursos y de los laboratorios de investigación, de los usuarios, de los administradores y de los miembros interesados de la comunidad científica. [3] Los resultados de los estudios del Grupo de Investigación ABRF se han publicado en artículos científicos. [4] [5] [6] Los resultados de los estudios del Grupo de Investigación ABRF se han reutilizado en otras investigaciones. [7] [8] [9]
Tecnologías de recursos
Los miembros de ABRF participan en un amplio espectro de tecnologías biomoleculares que se implementan en instalaciones centrales:
- Automatización: cribado de alto rendimiento, LIMS , robótica .
- Química de proteínas/péptidos : análisis de aminoácidos, secuenciación de terminales N y C, síntesis de péptidos, matrices de péptidos/proteínas.
- Biofísica : calorimetría , CD, fluorescencia , dispersión de luz , SPR , ultracentrifugación .
- Clasificación celular activadora de fluorescencia por citometría de flujo
- Expresión , identificación y perfiles de proteínas: fluorescencia diferencial, electroforesis en gel 2-D convencional , descubrimiento de biomarcadores de enfermedades.
- Expresión y perfiles genéticos : matrices de genes, PCR en tiempo real .
- Espectrometría de masas : análisis cualitativo, cuantitativo y estructural de proteínas, carbohidratos , oligonucleótidos y lípidos .
- Microscopía microscopía óptica e imágenes, Microscopía confocal.
- Química de los Ácidos Nucleicos : secuenciación de ADN , síntesis de ADN , síntesis de ARN , genotipado .
- Separaciones: PAGE 1 y 2-D, electroforesis capilar , cromatografía .
- Control de Calidad : GLP, GMP, calidad y cumplimiento.
- Universal Proteomics Standard (UPS), una mezcla de proteínas utilizada como estándar de referencia en proteómica, introducida por el sPRG antes mencionado. [10] Esto incluye dos conjuntos: el original (UPS1, donde las 48 proteínas están a 48 pmol) y un rango dinámico de concentraciones (llamado UPS2), que van desde 500 amol a 50 pmol. [11]
- Otros: bioinformática , análisis de carbohidratos , visualización diferencial, producción de proteínas recombinantes .
Conferencia anual
Cada año, la conferencia anual de la Asociación de Instalaciones de Recursos Biomoleculares se lleva a cabo durante la primavera en una ciudad de América del Norte. Esta conferencia internacional se utiliza para exponer a los miembros a la biotecnología nueva y emergente a través de conferencias, mesas redondas, presentaciones de grupos de investigación, sesiones de carteles, talleres y exhibiciones técnicas.
- ABRF 2023, 7-10 de mayo de 2023, Boston, MA
- ABRF 2022, 27–30 de marzo de 2022, Palm Springs, CA
- ABRF 2021, 7 a 11 de marzo de 2021, reunión virtual debido al COVID-19
- ABRF 2020, 29 de febrero - 3 de marzo de 2020, Palm Springs, CA
- ABRF 2019, 23–26 de marzo, San Antonio , Texas; 30 años desafiando los límites de la ciencia y la tecnología, abriendo puertas al futuro
- ABRF 2018, 22–25 de abril, Myrtle Beach, Carolina del Sur ; La Conferencia Premier de Servicios Básicos
- ABRF 2017, 25–28 de marzo, San Diego , California; Un foro para promover las tecnologías centrales de hoy para permitir las innovaciones del mañana
- ABRF 2016, 20–23 de febrero, Pie. Lauderdale , Florida; Tecnologías innovadoras que aceleran el descubrimiento
- ABRF 2015, 28–31 de marzo, San Luis , Misuri; Tecnologías integradoras para el avance de los núcleos científicos
- ABRF 2014, 23–25 de marzo, Albuquerque , Nuevo México; Ciencia en equipo y Big Data: núcleos en la frontera
- ABRF 2013, 2 a 5 de marzo, Palm Springs, California; Herramientas para el avance de la ciencia de la convergencia
- ABRF 2012, 17–20 de marzo, Orlando, Florida; Aprendiendo de las biomoléculas
- ABRF 2011, 19 a 22 de febrero, San Antonio, Texas; Tecnologías para permitir la medicina personalizada
- ABRF 2010, 20–23 de marzo, Sacramento, California; Traducir la investigación básica con avances en la tecnología biomolecular
- ABRF 2009, 7 a 10 de febrero, Memphis, Tennessee; Aplicación y optimización de biotecnologías existentes y emergentes
- ABRF 2008, 9 a 12 de febrero, Salt Lake City, Utah; Habilitación de tecnologías en las ciencias biológicas
- ABRF 2007, 31 de marzo al 3 de abril, Tampa, Florida; Creando la hoja de ruta biológica
- ABRF 2006, 11 a 14 de febrero, Long Beach, California; Integrando ciencia, herramientas y tecnologías con la biología de sistemas
- ABRF 2005, 5 a 8 de febrero, Savannah, Georgia; Tecnologías biomoleculares: del descubrimiento a la hipótesis
- ABRF 2004, 28 de febrero al 2 de marzo, Portland, Oregón; Integración de tecnologías en proteómica y genómica
- ABRF 2003, 10 a 13 de febrero, Denver, Colorado; Traducir la biología mediante proteómica y genómica funcional
- ABRF 2002, 9–12 de marzo, Austin, Texas; Tecnologías biomoleculares: herramientas para el descubrimiento en proteómica y genómica
- ABRF 2001, 24–27 de febrero, San Diego, CA; La Nueva Biología: Tecnología para resolver Comunicaciones Macromoleculares
- ABRF 2000, 19 a 22 de febrero, Bellevue, Washington; Del análisis singular al global de los sistemas biológicos
- ABRF 1999, 19–22 de marzo, Durham, Carolina del Norte; Bioinformática y tecnologías biomoleculares: vinculación de genomas, proteomas y bioquímica
- ABRF 1998, 21 a 24 de marzo, San Diego, California; De los genomas a la función: desafíos técnicos de la era posgenoma
- ABRF 1997, 9 a 12 de febrero, Baltimore, Maryland; Técnicas en la interfaz genoma-proteoma
- ABRF 1996, 30 de marzo al 2 de abril, San Francisco, California; Técnicas Biomoleculares
Premio ABRF
El premio ABRF se presenta en la reunión anual de la ABRF por contribuciones destacadas a las tecnologías biomoleculares. Ganadores de premios anteriores (los años se refieren a la conferencia anual en la que se entregó el premio): [12]
Revista de técnicas biomoleculares
La ABRF es el editor de la Revista de Técnicas Biomoleculares. La revista está revisada por pares y se publica trimestralmente. [13] El objetivo principal de la revista es publicar reseñas científicas y artículos relacionados con las instalaciones de recursos biomoleculares. Los informes publicados por el Grupo de Investigación incluyen encuestas anuales. También se incluyen noticias y eventos, así como un seguimiento de artículos centrado en las técnicas utilizadas en entornos típicos de instalaciones centrales. El editor en jefe actual es Ron Orlando, Universidad de Georgia .
Junta Ejecutiva de la ABRF
- Kevin Knudtson, presidente de ABRF, División de Genómica, Universidad de Iowa
- Justine Kigenyi, tesorera, Centro médico de KU
- Marie Adams, Instituto Van Andel
- Roxann Ashworth, Universidad Johns Hopkins
- Kym Delventhal, Instituto Stowers de Investigación Médica
- Sridar Chittur, SUNY Albany
- Nick Ambulos, Facultad de Medicina de la Universidad de Maryland
- Sue Weintraub, Centro de Ciencias de la Salud de la Universidad de Texas en San Antonio
- Magnus Palmblad, Centro Médico de la Universidad de Leiden
- Ken Schoppmann, director ejecutivo de ABRF
Referencias
- ^ "Declaración de misión". Asociación de Instalaciones de Recursos Biomoleculares. Archivado desde el original el 1 de abril de 2019 . Consultado el 4 de marzo de 2020 .
- ^ Crabb, JW: "ABRF; una breve historia" ABRF News, junio de 1995
- ^ "Directrices para grupos de investigación" (PDF) . Asociación de Instalaciones de Recursos Biomoleculares. Archivado desde el original (PDF) el 31 de enero de 2012 . Consultado el 15 de abril de 2009 .
- ^ Choi, Meena; Eren-Dogu, Zeynep F.; Colángelo, Cristóbal; Cottrell, Juan; Hoopmann, Michael R.; Kapp, Eugene A.; Kim, Sangtae; Lam, Henry; Neubert, Thomas A.; Palmblad, Magnus; Phinney, Brett S.; Weintraub, Susan T.; MacLean, Brendan; Vitek, Olga (2017). "Estudio de 2015 del Grupo de investigación de informática de proteomas ABRF (iPRG): detección de proteínas diferencialmente abundantes en experimentos cuantitativos LC-MS / MS sin etiquetas". Revista de investigación del proteoma . 16 (2): 945–957. doi : 10.1021/acs.jproteome.6b00881. PMID 27990823. S2CID 4578078.
- ^ Chalkley, Robert J.; Bandeira, Nuño; Cámaras, Matthew C.; Clauser, Karl R.; Cottrell, John S.; Deutsch, Eric W.; Kapp, Eugene A.; Lam, Henry HN; McDonald, W. Hayes; Neubert, Thomas A.; Sol, Rui-Xiang (2014). "Grupo de investigación en informática de proteomas (iPRG)_2012: un estudio sobre la detección de péptidos modificados en una mezcla compleja". Proteómica molecular y celular . 13 (1): 360–371. doi : 10.1074/mcp.M113.032813 . PMC 3879627 . PMID 24187338 . Consultado el 5 de noviembre de 2018 .
- ^ Bennett, Keiryn L.; Wang, Xia; Bystrom, Cory E.; Cámaras, Matthew C.; Andacht, Tracy M.; Dangott, Larry J.; Elortza, Félix; Leszyk, Juan; Molina, Henrik; Moritz, Robert L.; Phinney, Brett S.; Thompson, J. Will; Bunger, Maureen K.; Tabb, David L. (2015). "Estudio del grupo de investigación proteómica ABRF 2012/2013: evaluación de la variabilidad longitudinal intralaboratorio en análisis de espectrometría de masas en tándem de cromatografía líquida de péptidos de rutina". Proteómica molecular y celular . 14 (12): 3299–3309. doi : 10.1074/mcp.O115.051888 . PMC 4762617 . PMID 26435129 . Consultado el 5 de noviembre de 2018 .
- ^ Nguyen, Trung Hai; Rustenburg, Ariën S.; Krimmer, Stefan G.; Zhang, Hexi; Clark, John D.; Novick, Paul A.; Branson, Kim; Pande, Vijay S.; Chodera, John D.; Minh, David DL (2018). "Análisis bayesiano de calorimetría de titulación isotérmica para termodinámica vinculante". MÁS UNO . 13 (9): e0203224. Código Bib : 2018PLoSO..1303224N. doi : 10.1371/journal.pone.0203224 . PMC 6136728 . PMID 30212471.
- ^ El, Mateo; Edfors, Fredrik; Pérez-Riverol, Yasset; Payne, Samuel H.; Hoopmann, Michael R.; Palmblad, Magnus; Forsström, Björn; Käll, Lukas (2018). "Un estándar de proteínas que emula la homología para la caracterización de algoritmos de inferencia de proteínas". Revista de investigación del proteoma . 17 (5): 1879–1886. doi : 10.1021/acs.jproteome.7b00899. PMC 6474350 . PMID 29631402.
- ^ Wu, Guanying; Wan, Xiang; Xu, Baohua (2018). "Una nueva estimación de la tasa de descubrimiento falso a nivel de proteínas". Genómica BMC . 19 (Suplemento 6): 567. doi : 10.1186/s12864-018-4923-3 . PMC 6101079 . PMID 30367581.
- ^ "Estándares universales de proteómica: validación del futuro de la proteómica" . Consultado el 22 de agosto de 2016 .
- ^ "Estándares proteómicos UPS1 y UP2" . Consultado el 22 de agosto de 2016 .
- ^ "Premio ABRF". Asociación de Instalaciones de Recursos Biomoleculares. Archivado desde el original el 30 de enero de 2012 . Consultado el 22 de agosto de 2016 .
- ^ "JBT: Revista de técnicas biomoleculares". Asociación de Instalaciones de Recursos Biomoleculares. Archivado desde el original el 10 de septiembre de 2022 . Consultado el 16 de octubre de 2022 .
enlaces externos
- Asociación de instalaciones de recursos biomoleculares ABRF
- Federación de Sociedades Americanas de Biología Experimental FASEB
- Foro de discusión ABRF
- Revista de técnicas biomoleculares
- ABRF en LinkedIn
- Liderazgo