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Paso limitante de la velocidad (bioquímica)

En bioquímica , un paso limitante de velocidad es un paso que controla la velocidad de una serie de reacciones bioquímicas. [1] [2] Sin embargo, la afirmación es un malentendido de cómo opera una secuencia de pasos de reacción catalizados por enzimas. En lugar de que un solo paso controle la velocidad, se ha descubierto que múltiples pasos controlan la velocidad. Además, cada paso de control controla la velocidad en diversos grados.

Blackman (1905) [3] afirmó como axioma: "cuando un proceso está condicionado en cuanto a su rapidez por una serie de factores separados, la velocidad del proceso está limitada por el ritmo del factor más lento". Esto implica que debería ser posible, estudiando el comportamiento de un sistema complicado como una vía metabólica, caracterizar un solo factor o reacción (es decir, la más lenta), que desempeña el papel de paso maestro o limitante de la velocidad. En otras palabras, el estudio del control del flujo puede simplificarse al estudio de una sola enzima ya que, por definición, sólo puede haber un paso "limitante de la velocidad". Desde su concepción, el paso "limitador de la velocidad" ha desempeñado un papel importante al sugerir cómo se controlan las vías metabólicas. Desafortunadamente, la noción de un paso "limitador de la tasa" es errónea, al menos en condiciones de estado estacionario. Los libros de texto de bioquímica modernos han comenzado a restar importancia al concepto. Por ejemplo, la séptima edición de los Principios de Bioquímica de Lehninger [4] establece explícitamente: "Ahora ha quedado claro que, en la mayoría de las vías, el control del flujo se distribuye entre varias enzimas, y el grado en que cada una de ellas contribuye al control varía". con circunstancias metabólicas". Sin embargo, el concepto todavía se utiliza incorrectamente en los artículos de investigación. [5] [6]

Perspectiva historica

Desde la década de 1920 hasta la de 1950, hubo varios autores que discutieron el concepto de pasos limitantes de velocidad, también conocidos como reacciones maestras. Varios autores han afirmado que el concepto de paso "limitador de velocidad" es incorrecto. Burton (1936) [7] fue uno de los primeros en señalar que: "En el estado estacionario de las cadenas de reacción, el principio de la reacción maestra no tiene aplicación". Hearon (1952) [8] hizo un análisis matemático más general y desarrolló reglas estrictas para la predicción del dominio en una secuencia lineal de reacciones catalizadas por enzimas. Webb (1963) [9] fue muy crítico con el concepto de paso limitante de la velocidad y con su aplicación ciega para resolver problemas de regulación en el metabolismo. Waley (1964) [10] hizo un análisis simple pero esclarecedor de cadenas lineales simples. Demostró que siempre que las concentraciones intermedias fueran bajas en comparación con los valores de las enzimas, la siguiente expresión era válida:

donde es igual al flujo de la ruta, y y son funciones de las constantes de velocidad y las concentraciones de metabolitos intermedios. Los términos son proporcionales a los valores límite de velocidad de las enzimas. El primer punto a tener en cuenta de la ecuación anterior es que el flujo de la vía es función de todas las enzimas; no es necesario que haya una medida que "limite la tasa". Sin embargo, si todos los términos desde hasta , son pequeños en relación con, entonces la primera enzima contribuirá más a determinar el flujo y, por lo tanto, podría denominarse el paso "limitante de velocidad".

Perspectiva moderna

La perspectiva moderna es que la limitación de la tasa debe ser cuantitativa y que se distribuya a través de una vía en diversos grados. Esta idea fue considerada por primera vez por Higgins [11] a finales de la década de 1950 como parte de su tesis doctoral [12] donde introdujo la medida cuantitativa que llamó "coeficiente de reflexión". Esto describió el cambio relativo de una variable a otra para pequeñas perturbaciones. En su doctorado. En su tesis, Higgins describe muchas propiedades de los coeficientes de reflexión, y en trabajos posteriores, tres grupos, Savageau, [13] [14] Heinrich y Rapoport [15] [16] y Jim Burns en su tesis (1971) y publicaciones posteriores [17 ] [18] desarrollaron de forma independiente y simultánea este trabajo en lo que ahora se llama análisis de control metabólico o, en la forma específica desarrollada por Savageau, teoría de sistemas bioquímicos . Estos desarrollos ampliaron significativamente las ideas originales de Higgins, y el formalismo es ahora el enfoque teórico principal para describir modelos continuos y deterministas de redes bioquímicas.

Las variaciones en la terminología entre los diferentes artículos sobre análisis del control metabólico [15] [17] se armonizaron posteriormente mediante un acuerdo general. [19]

Ver también

Referencias

  1. ^ Nelson, David L.; Cox, Michael M. (2005). Principios de bioquímica de Lehninger . Macmillan. pag. 195.ISBN​ 978-0-7167-4339-2.
  2. ^ Rajvaidya, Neelima; Markandey, Dilip Kumar (2005). Bioquímica Ambiental. Publicación APH. pag. 408.ISBN 978-81-7648-789-4.
  3. ^ Blackman, FF (1905). "Factores óptimos y limitantes". Anales de botánica . 19 (74): 281–295. doi : 10.1093/oxfordjournals.aob.a089000. ISSN  0305-7364. JSTOR  43235278.
  4. ^ Nelson, David L.; Cox, Michael M. (2017). Principios de bioquímica de Lehninger (Séptima ed.). Nueva York, NY. ISBN 9781464126116.{{cite book}}: Mantenimiento CS1: falta el editor de la ubicación ( enlace )
  5. ^ Zuo, Jianlin; Tang, Jinshuo; Lu, Meng; Zhou, Zhongsheng; Li, Yang; Tian, ​​Hao; Liu, Enbo; Gao, Baoying; Liu, Te; Shao, Pu (24 de noviembre de 2021). "Enzimas limitadoras de la tasa de glucólisis: nuevos reguladores potenciales de la patogénesis de la artritis reumatoide". Fronteras en Inmunología . 12 : 779787. doi : 10.3389/fimmu.2021.779787 . PMC 8651870 . PMID  34899740. 
  6. ^ Zhou, Daoying; Duan, Zhen; Li, Zhenyu; Ge, Fangfang; Wei, Ran; Kong, Lingsuo (14 de diciembre de 2022). "La importancia de la glucólisis en la progresión tumoral y su relación con el microambiente tumoral". Fronteras en Farmacología . 13 : 1091779. doi : 10.3389/fphar.2022.1091779 . PMC 9795015 . PMID  36588722. 
  7. ^ Burton, Alan C. (diciembre de 1936). "La base del principio de la reacción maestra en biología". Revista de fisiología celular y comparada . 9 (1): 1–14. doi :10.1002/jcp.1030090102.
  8. ^ Hearon, John Z. (1 de octubre de 1952). "Tasa de comportamiento de los sistemas metabólicos". Revisiones fisiológicas . 32 (4): 499–523. doi :10.1152/physrev.1952.32.4.499. PMID  13003538.
  9. ^ Webb, John Leyden (1963). Inhibidores enzimáticos y metabólicos . Nueva York: Academic Press. págs. 380–382.
  10. ^ Waley, Sg (1 de junio de 1964). "Una nota sobre la cinética de los sistemas multienzimáticos". Revista Bioquímica . 91 (3): 514–517. doi :10.1042/bj0910514. PMC 1202985 . PMID  5840711. 
  11. ^ Higgins, Joseph (mayo de 1963). "Análisis de reacciones secuenciales". Anales de la Academia de Ciencias de Nueva York . 108 (1): 305–321. doi :10.1111/j.1749-6632.1963.tb13382.x. PMID  13954410. S2CID  30821044.
  12. ^ Higgins, José (1959). Propiedades cinéticas de sistemas enzimáticos secuenciales . Universidad de Pensilvania: Tesis doctoral.
  13. ^ Savageau, Michael A. (febrero de 1971). "La sensibilidad de los parámetros como criterio para evaluar y comparar el desempeño de sistemas bioquímicos". Naturaleza . 229 (5286): 542–544. doi :10.1038/229542a0. PMID  4925348. S2CID  4297185.
  14. ^ Salvajeau, Michael A. (1972). "El comportamiento de los sistemas de control bioquímico intactos* *Esta no será una revisión exhaustiva de los diferentes métodos para analizar sistemas bioquímicos, sino más bien un tratamiento selectivo de un enfoque particular. Recientemente se han presentado revisiones que cubren enfoques alternativos a estos problemas (28, 33)". Temas actuales en regulación celular . 6 : 63–130. doi :10.1016/B978-0-12-152806-5.50010-2. ISBN 9780121528065.
  15. ^ ab Heinrich, Reinhart; Rapoport, Tom A. (febrero de 1974). "Un tratamiento lineal en estado estacionario de cadenas enzimáticas. Propiedades generales, control y fuerza efectora". Revista europea de bioquímica . 42 (1): 89–95. doi : 10.1111/j.1432-1033.1974.tb03318.x . PMID  4830198.
  16. ^ Enrique, Reinhart; Rapoport, Tom A. (febrero de 1974). "Un tratamiento lineal en estado estacionario de cadenas enzimáticas. Crítica del teorema de cruce y un procedimiento general para identificar sitios de interacción con un efector". Revista europea de bioquímica . 42 (1): 97-105. doi : 10.1111/j.1432-1033.1974.tb03319.x . PMID  4830199.
  17. ^ ab Kacser, H; Quemaduras, JA (1973). "El control del flujo". Simposios de la Sociedad de Biología Experimental . 27 : 65-104. PMID  4148886.
  18. ^ Kacser, H.; Quemaduras, JA; Kacser, H.; Fell, DA (1 de mayo de 1995). "El control del flujo". Transacciones de la sociedad bioquímica . 23 (2): 341–366. doi :10.1042/bst0230341. PMID  7672373.
  19. ^ Quemaduras, JA; Cornish-Bowden, A.; Groen, Alaska; Heinrich, R.; Kacser, H.; Porteoso, JW; Rapoport, SM; Rapoport, TA; Stucki, JW; Tager, JM; Wanders, RJA; Westerhoff, HV (1985). "Análisis de control de sistemas metabólicos". Tendencias Bioquímica. Ciencia . 10 : 16. doi : 10.1016/0968-0004(85)90008-8.