El CompTox Chemicals Dashboard es una base de datos en línea de libre acceso creada y mantenida por la Agencia de Protección Ambiental de los Estados Unidos (EPA). La base de datos proporciona acceso a múltiples tipos de datos, incluidas propiedades fisicoquímicas , destino y transporte ambiental, exposición, uso, toxicidad in vivo y bioensayo in vitro . La EPA y otros científicos utilizan los datos y modelos contenidos en el panel para ayudar a identificar sustancias químicas que requieren más pruebas y reducir el uso de animales en las pruebas químicas. El Dashboard también se utiliza para proporcionar acceso público a la información de los Planes de Acción de la EPA, por ejemplo, sobre sustancias alquiladas perfluoradas . [2] [3]
Originalmente denominada Chemistry Dashboard, la primera versión se lanzó en 2016. [4] La última versión de la base de datos (versión 3.0.5) contiene datos seleccionados manualmente para más de 875 000 sustancias químicas e incorpora los últimos datos generados por el programa de detección de alto rendimiento Toxicity Forecaster (ToxCast) de la EPA. [5] El Chemicals Dashboard incorpora datos de varias bases de datos anteriores de la EPA en un solo paquete, incluido el ToxCast Dashboard, [6] el Endocrine Disruption Screening Program (EDSP) Dashboard [7] y la Chemical and Products Database (CPDat). [8]
La base de datos del Panel de control de productos químicos CompTox contiene estructuras químicas e información de alta calidad que han sido ampliamente seleccionadas y controladas en cuanto a calidad, y que pueden usarse como un recurso para los científicos analíticos involucrados en la identificación de estructuras. [9]
Los datos sobre riesgos químicos que aparecen en el panel de control proceden tanto de estudios tradicionales con animales de laboratorio como de pruebas de alto rendimiento . Los datos biológicos de las pruebas de alto rendimiento se generan mediante el programa ToxCast de la EPA [5] . Los datos de ToxCast en la base de datos proporcionan información sobre los ensayos utilizados y su potencia y eficacia de respuesta. Estos datos se pueden encontrar en la pestaña de bioactividad.
Se puede acceder al Panel de sustancias químicas a través de una interfaz web o se pueden descargar conjuntos de datos para su uso sin conexión. La pestaña Listas se puede utilizar para buscar y descargar grupos de sustancias químicas relacionadas en función de su relevancia para un tema de investigación específico (como aditivos en cigarrillos o sustancias químicas que demuestran efectos sobre los efectos del desarrollo neurológico) o los puntos finales de ensayo específicos que cubren.
Dentro del panel de control en línea, se pueden realizar búsquedas por categorías de producto/uso, ensayo/gen, nombre sistemático, sinónimo, número CAS , ID de sustancia DSSTox o InChiKey . En la pestaña Búsqueda avanzada, se pueden buscar sustancias químicas en función de su masa o fórmula molecular . También se pueden realizar búsquedas de grupos de sustancias químicas en función del nombre químico CASRN, InChIKey, ID de sustancia DSSTox, ID de compuesto DSSTox, esqueleto InChIKey, fórmula MS-Ready, fórmula exacta o masa monoisotópica utilizando la función de búsqueda por lotes.
En The Chemicals Dashboard se ha integrado una herramienta de lectura cruzada automatizada denominada Generalized Read-Across (GenRA). GenRA está diseñada para mantener la consideración experta inherente al método de lectura cruzada, pero automatiza el proceso de selección de sustancias químicas para ayudar a predecir la toxicidad. [10]
El Dashboard también tiene la capacidad de buscar fuentes de literatura científica existentes como PubMed , a través de una versión web de "Abstract Sifter", [11] Google Scholar e informes de los Valores de toxicidad revisados por pares provisionales de la EPA (PPRTV) y el Sistema integrado de información de riesgos de la EPA (IRIS).
La predicción QSAR en tiempo real para múltiples propiedades fisicoquímicas y puntos finales de toxicidad está disponible a través de la pestaña de predicciones.
El panel de control proporciona soporte para la espectrometría de masas, proporcionando búsquedas en los datos químicos contenidos en la base de datos en función de la masa y la fórmula molecular . El panel de control se ha aplicado a la búsqueda de análisis no dirigidos de " incógnitas conocidas ". [12] Se admiten tanto la espectrometría de masas dirigida como la espectrometría de masas no dirigida. Las búsquedas utilizan una búsqueda basada en formas "listas para MS" de compuestos químicos. Las sustancias químicas individuales se colapsan en una forma que se detectaría mediante espectrometría de masas, de modo que las sales se desalinizan y neutralizan y los productos químicos multicomponentes se separan en sus componentes individuales. [13]