Un outrón es una secuencia de nucleótidos en el extremo 5' del transcrito primario de un gen que se elimina mediante una forma especial de empalme de ARN durante la maduración del producto de ARN final. [1] Mientras que las secuencias de intrones se encuentran dentro del gen, las secuencias de outrones se encuentran fuera del gen. [2]
El outrón es una secuencia similar a un intrón que posee características similares, como el contenido de G+C [3] y un sitio aceptor de empalme que es la señal para el trans -empalme . [4] [5] Dicho sitio de empalme trans se define esencialmente como un sitio de empalme aceptor (3') sin un sitio de empalme donante (5') aguas arriba.
En eucariotas como euglenozoos , dinoflagelados , esponjas , nematodos , cnidarios , ctenóforos , platelmintos , crustáceos , quetognatos , rotíferos y tunicados , la longitud de los outrones líderes empalmados (SL) varía de 30 a 102 nucleótidos (nt) , con el exón SL la longitud oscila entre 16 y 51 nt, y la longitud completa del ARN SL oscila entre 46 y 141 nt. [3]
En el empalme cis estándar , se requiere el sitio de empalme donante en posición aguas arriba junto con un sitio aceptor ubicado en posición aguas abajo en la misma molécula de pre-ARN. Por el contrario, el transempalme de SL se basa en un sitio de empalme aceptor 3' en el outrón y un sitio de empalme donante 5' (dinucleótido GU) ubicado en una molécula de ARN separada, el ARN SL. [3] Además, el outrón del ARNm prematuro contiene una adenosina ramificada , seguida de un tracto de polipirimidina aguas abajo, que interactúa con la porción similar a un intrón del ARN SL para formar un subproducto ramificado en 'Y', que recuerda a la estructura de lazo formada . durante el empalme de intrones. Luego, la maquinaria nuclear resuelve esta estructura de ramificación en 'Y' mediante el empalme trans de la secuencia de ARN SL al sitio aceptor de empalme trans 3' (dinucleótido AG) del pre-ARNm. [2]
Cuando se procesan los outrones, el exón SL se transempalma a sitios aceptores posteriores, no apareados y distintos, adyacentes a cada marco de lectura abierto del pre-ARNm policistrónico, lo que conduce a transcripciones cubiertas maduras distintas.[6] [7] [8]