OpenChrom admite únicamente el análisis y la representación de datos cromatográficos y espectrométricos de masas. No tiene capacidades para la adquisición de datos o el control del hardware del proveedor. OpenChrom se basa en la plataforma de cliente enriquecido (RCP) de Eclipse, por lo que está disponible para varios sistemas operativos, por ejemplo, Microsoft Windows , macOS y Linux . Se distribuye bajo la Licencia Pública Eclipse 1.0 (EPL). Las bibliotecas de terceros se dividen en paquetes individuales y se publican bajo varias licencias compatibles con OSI .
Historia
ChemClipse versión 0.7.0
OpenChrom fue desarrollado por Philip Wenig ( SCJP , LPIC-1 ) como parte de su tesis doctoral en la Universidad de Hamburgo , Alemania. [5] El objetivo de la tesis fue aplicar técnicas de reconocimiento de patrones en conjuntos de datos registrados mediante pirólisis analítica junto con cromatografía y espectrometría de masas (Py-GC/MS). [6] [7]
OpenChrom ganó el premio Thomas Krenn Open Source Award 2010 [8], así como el premio Eclipse Community Award 2011. [9] Los desarrolladores también son miembros fundadores del Eclipse Science Working Group. [10] Después de la comercialización exitosa del desarrollo por contrato y los servicios en torno al proyecto OpenChrom, el proveedor Lablicate reforzó el compromiso con el software libre/de código abierto con el lanzamiento de ChemClipse en octubre de 2016, que sirve como base para todos los productos OpenChrom. [11]
Formatos de datos admitidos
Cada proveedor de sistemas almacena los datos de análisis registrados en su propio formato propietario . Eso dificulta la comparación de conjuntos de datos de diferentes sistemas y proveedores. Además, es un gran inconveniente para las pruebas entre laboratorios. El objetivo de OpenChrom es admitir de forma nativa una amplia gama de diferentes formatos de datos de espectrometría de masas . [12] OpenChrom se asegura de que los archivos de datos sin procesar no puedan modificarse de acuerdo con las buenas prácticas de laboratorio . Para ayudar a los científicos, OpenChrom admite varios formatos abiertos para importar y exportar los resultados del análisis. Además, OpenChrom ofrece su propio formato de código abierto (*.ocb) que permite guardar el cromatograma editado así como los picos y resultados de identificación.
Soporte para identificadores de picos y espectro de masas
Soporte de cuantificación
Soporte de filtro (por ejemplo, eliminación de escaneo y fragmentos masivos, reducción de ruido, suavizado Savitzky-Golay , CODA , plegado hacia atrás)
^ OpenChrom: un software de código abierto multiplataforma para el análisis espectrométrico de masas de datos cromatográficos , Philip Wenig, Juergen Odermatt, BMC Bioinformatics ; 2010 ; doi :10.1186/1471-2105-11-405
^ Softwarebasierte Verfahren zur datenbankgestützten Identifizierung organischer Substanzen mittels analytischer Pyrolyse gekoppelt mit Gaschromographie/Massenspektrometrie (Py-GC/MS) , Philip Wenig, Disertación ; 2012 ; DNB-IDN 1027167683
^ Postoptimización de datos Py-GC/MS: un estudio de caso que utiliza un nuevo filtro de reducción de ruido químico digital (NOISERA) para mejorar la calidad de los datos utilizando el software de espectrometría de masas OpenChrom , Philip Wenig, Journal of Analytical and Applied Pyrolysis ; 2011 ; doi :10.1016/j.jaap.2011.05.013
^ Caracterización de emisiones olorosas utilizando un nuevo software para identificar picos en modelos quimiométricos de cromatografía de gases: conjuntos de datos de espectrometría de masas , KR Murphy, P. Wenig, G. Parcsi, T. Skov, RM Stuetz, Chemometrics and Intelligent Laboratory Systems ; 2012 ; doi : 10.1016/j.chemolab.2012.07.006
^ Werner Fischer: Ganador del premio Thomas Krenn Open Source 2010
^ Fundación Eclipse : se anuncian los ganadores de los premios de la comunidad Eclipse, Santa Clara, CA - 21 de marzo de 2011
^ Diana Kupfer: Información sobre el grupo de trabajo científico de Eclipse, 11 de junio de 2014
^ Philip Wenig: ChemClipse 0.7.0 lanzado, 2 de octubre de 2016
^ Dąbrowski, Łukasz (7 de agosto de 2015). "Revisión de software gratuito de procesamiento de datos para cromatografía". Revista Mediterránea de Química . 4 (4): 193–200. doi : 10.13171/mjc.4.4.2015.15.09.16.35/dabrowski .