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Magnus Manske

Heinrich Magnus Manske (nacido el 24 de mayo de 1974) es un bioquímico alemán y uno de los principales investigadores en materia de malaria . Es científico de alto nivel en el Wellcome Sanger Institute de Cambridge (Reino Unido) [1] [3] [4] [5] [6] y desarrollador de software de una de las primeras versiones del software MediaWiki , que impulsa Wikipedia y varios otros sitios web basados ​​en wikis .

Primeros años de vida

Manske nació en Colonia , Alemania. Estudió bioquímica en la Universidad de Colonia y se graduó en 2006 con un doctorado; su tesis fue una herramienta de código abierto para la biología molecular llamada GENtle . [2] [7]

Carrera

Como estudiante, Manske fue uno de los primeros colaboradores de la enciclopedia de Internet Nupedia , precursora de Wikipedia, y más tarde escribió una de las primeras versiones del software MediaWiki en el que se ejecuta Wikipedia. [8] Manske ha trabajado en Cambridge con el Wellcome Sanger Institute desde abril de 2007, [9] [10] [11] [12] [13] pero sigue activo en el desarrollo de herramientas para Wikipedia [14] y sus proyectos hermanos Wikidata y Wikimedia Commons . [15]

En 2012, Manske fue coautor de un artículo publicado en Nature que demostraba nuevas formas de identificar áreas en las que los parásitos de la malaria están evolucionando y describía técnicas para mapear la resistencia a los medicamentos contra la malaria. Los investigadores desarrollaron una técnica para extraer el ADN del parásito de la malaria directamente de la sangre, lo que minimiza los errores en la secuenciación. [9] [16]

Desarrollo de MediaWiki

Como estudiante, Manske fue uno de los colaboradores más activos del proyecto Nupedia , [17] enviando contenido sobre temas de biología [8] y desarrollando herramientas y extensiones para Nupedia. [18] Más tarde, descontento con las limitaciones del software existente, [17] Manske desarrolló una de las primeras versiones de lo que más tarde se convirtió en MediaWiki . [18] [19] Su nueva versión del software se instaló en 2002. [17]

El software wiki que se utilizó inicialmente para Wikipedia se llamaba UseModWiki y estaba escrito en Perl . Con problemas de escala que empezaban a presentarse a medida que Wikipedia crecía, en el verano de 2001, Manske comenzó a trabajar en un reemplazo para UseModWiki que estaría respaldado por una base de datos y contendría "características específicas de Wikipedia". [20] El 25 de enero de 2002, Manske lanzó la primera versión de un motor wiki PHP basado en MySQL , llamado Phase II . [21] Una innovación implementada por Manske en Phase II fue el uso de espacios de nombres para separar diferentes tipos de páginas, como el espacio de nombres "Talk" o "User", que lo distinguía del software wiki anterior que no tenía diferentes espacios de nombres. [20] Phase II también introdujo una serie de otras características que todavía están presentes, incluyendo la carga de archivos, listas de seguimiento, firmas automáticas y lista de contribuciones de usuarios. [22] [23] La reescritura de Manske también facilitó la integración de fotografías en los artículos de Wikipedia y creó un nuevo grupo de usuarios: administradores, autorizados a eliminar páginas y bloquear a los vándalos. [17] [24]

Manske era partidario del código abierto y, específicamente, de la licencia GPL , y su trabajo en las primeras versiones de MediaWiki se publicó bajo la licencia GPL. [25]

El software de la Fase II de Manske tuvo problemas de carga a medida que Wikipedia seguía creciendo, por lo que Lee Daniel Crocker realizó otra reescritura, lo que condujo a la Fase III, que se utilizó a partir de junio de 2002 y desde 2003 en adelante se llamó "MediaWiki". [21] El software MediaWiki resultante ahora se utiliza como plataforma central tanto para Wikipedia como para muchos proyectos hermanos de Wikimedia , así como en muchas organizaciones e instituciones.

Manske continuó desarrollando extensiones para MediaWiki y herramientas utilizadas para construir Wikipedia y sus proyectos hermanos, incluidas herramientas para mapear la membresía de categorías, calcular intersecciones de categorías e importar imágenes de Flickr a Commons . [26] [27] [28] Manske también desarrolló la extensión Cite que trajo una sintaxis similar a XML a la gestión de citas. [29]

Herramientas

Además de trabajar en MediaWiki, Manske ha creado herramientas que funcionan con él, como "wiki shoot me", que identifica en un mapa las fotos que es necesario tomar y permite subirlas, o Reasonator, que toma la información sin procesar de Wikidata y la presenta como si fuera un artículo de Wikipedia. [30]

Reconocimiento

Se reconoce a Manske como el creador del primer artículo en la Wikipedia alemana, que trataba sobre la reacción en cadena de la polimerasa , escrito por primera vez por él en 2001. [31] [32] [33]

En 2002, Jimmy Wales nombró el 25 de enero como el Día de Magnus Manske en honor a sus contribuciones a Wikipedia, proclamando que "Esta noche, en la cena, cada wikipedista debería brindar por Magnus y sus muchos inventos". [34]

Larry Sanger , en sus memorias sobre la historia temprana de Wikipedia, destacó las contribuciones de Manske al proyecto y atribuye el éxito final de Wikipedia a un grupo central de actores, en el que Manske desempeñó un papel: [35]

Wikipedia comenzó con un puñado de personas, muchas de ellas de Nupedia. La influencia de los nupedianos fue crucial desde el principio. Pienso, especialmente, en el incansable Magnus Manske (que trabajó en el software de ambos proyectos), nuestra fiel seguidora Ruth Ifcher y el programador muy inteligente y jugador de póquer Lee Daniel Crocker, por nombrar algunos... Aún así, como el proyecto comenzó con estas buenas personas y pudimos adoptar, explicar y promover buenos hábitos y políticas a las personas más nuevas, las raíces nupedianas del proyecto ayudaron a desarrollar una comunidad sólida, funcional y exitosa.

Manske, junto con otros, fue reconocido como un importante colaborador de MediaWiki por la USENIX Advanced Computing Technical Association en 2010, cuando MediaWiki y la Fundación Wikimedia fueron honrados con un premio STUG (Software Tools User Group). [36]

Véase también

Referencias

  1. ^ Publicaciones de Magnus Manske indexadas por Google Scholar
  2. ^ por Magnus Manske (2006). GENtle, una herramienta gratuita de biología molecular multipropósito (tesis doctoral). Universidad de Colonia. Archivado desde el original el 7 de abril de 2015. Consultado el 27 de marzo de 2016 .
  3. ^ Magnus Manske en el servidor de bibliografía DBLP
  4. ^ Publicaciones de Magnus Manske indexadas por Microsoft Academic
  5. ^ Publicaciones de Magnus Manske indexadas en la base de datos bibliográfica Scopus . (requiere suscripción)
  6. ^ Daub, J.; Gardner, PP; Tate, J.; Ramsköld, D.; Manske, M.; Scott, WG; Weinberg, Z.; Griffiths-Jones, S.; Bateman, A. (2008). "El RNA WikiProject: Anotación comunitaria de familias de ARN". ARN . 14 (12): 2462–2464. doi :10.1261/rna.1200508. PMC 2590952 . PMID  18945806. 
  7. ^ Alastair Kerr (21 de junio de 2011). «Desktop Sequence Analysis: software review». Blog de conocimientos sobre bioinformática . Archivado desde el original el 30 de septiembre de 2018. Consultado el 4 de junio de 2013 .
  8. ^ ab Claudia Lehnen (2 de febrero de 2008). "Der Wikipedia-Pionier aus Köln" [El pionero de Wikipedia de Colonia]. Kölner Stadt-Anzeiger (en alemán). Archivado desde el original el 12 de julio de 2015 . Consultado el 22 de junio de 2013 .
  9. ^ ab Manske, M.; Miotto, O.; Campino, S.; Auburn, S.; Almagro-García, J.; Maslen, G.; o'Brien, J.; Djimde, A.; Doumbo, O.; Zongo, I.; Ouedraogo, JB; Michon, P.; Mueller, I.; Siba, P.; Nzila, A.; Borrmann, S.; Kiara, SM; Marsh, K.; Jiang, H.; Su, XZ; Amaratunga, C.; Fairhurst, R.; Socheat, D.; Nosten, F.; Imwong, M.; White, NJ; Sanders, M.; Anastasi, E.; Alcock, D.; et al. (2012). "Análisis de la diversidad de Plasmodium falciparum en infecciones naturales mediante secuenciación profunda". Naturaleza . 487 (7407): 375–9. Código Bibliográfico :2012Natur.487..375M. doi :10.1038/nature11174. PMC 3738909 . PMID  22722859. 
  10. ^ Manske, HM; Kwiatkowski, DP (2009). "Look Seq: Un visualizador basado en navegador para datos de secuenciación profunda". Genome Research . 19 (11): 2125–32. doi :10.1101/gr.093443.109. PMC 2775587 . PMID  19679872. 
  11. ^ Manske, HM; Kwiatkowski, DP (2009). "SNP-o-matic". Bioinformática . 25 (18): 2434–5. doi :10.1093/bioinformatics/btp403. PMC 2735664 . PMID  19574284. 
  12. ^ Robinson, T.; Campino, SG; Auburn, S.; Assefa, SA; Polley, SD; Manske, M.; MacInnis, B.; Rockett, KA; Maslen, GL; Sanders, M.; Quail, MA; Chiodini, PL; Kwiatkowski, DP; Clark, TG; Sutherland, CJ (2011). "Genotipos resistentes a fármacos y multiclonalidad en Plasmodium falciparum analizados mediante secuenciación genómica directa de sangre periférica de pacientes con malaria". PLOS ONE . ​​6 (8): e23204. Bibcode :2011PLoSO...623204R. doi : 10.1371/journal.pone.0023204 . PMC 3154926 . PMID  21853089. 
  13. ^ Logan, DW; Sandal, M.; Gardner, PP; Manske, M.; Bateman, A. (2010). "Diez reglas simples para editar Wikipedia". PLOS Computational Biology . 6 (9): e1000941. Bibcode :2010PLSCB...6E0941L. doi : 10.1371/journal.pcbi.1000941 . PMC 2947980 . PMID  20941386.  Icono de acceso abierto
  14. ^ "Magnus Manske". Archivado desde el original el 13 de junio de 2013. Consultado el 4 de junio de 2013 .
  15. ^ "Herramientas relacionadas con Wikimedia por Magnus Manske". Archivado desde el original el 14 de diciembre de 2018. Consultado el 4 de mayo de 2017 .
  16. ^ "Investigación sobre el ADN: los parásitos en el mapa mundial". China Weekly News . 26 de junio de 2012.
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  20. ^ de Sumana Harihareswara; Guillaume Paumier (2012). "MediaWiki". En Amy Brown; Greg Wilson (eds.). La arquitectura de las aplicaciones de código abierto . Kristian Hermansen. ISBN 978-1-105-57181-7Archivado desde el original el 24 de septiembre de 2013 . Consultado el 27 de marzo de 2016 .
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  23. ↑ Magnus Manske (27 de enero de 2002). «[Wikipedia-l] Lista de nuevas características». Archivado desde el original el 12 de noviembre de 2015. Consultado el 4 de junio de 2013 .
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  26. ^ "Los juguetes y herramientas de Magnus". Archivado desde el original el 10 de mayo de 2014. Consultado el 4 de junio de 2013 .
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  33. ^ Achim Sawall (28 de diciembre de 2009). "Wikipedia alemana erreicht die Millionenmarke". golem.de. Archivado desde el original el 21 de mayo de 2021 . Consultado el 25 de junio de 2013 .
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  36. ^ "Premio STUG". 6 de diciembre de 2011. Archivado desde el original el 11 de enero de 2012. Consultado el 4 de junio de 2013 .

Enlaces externos

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