Medicago truncatula , el trébol de barril , [2] medick de espinas fuertes , [3] medick de barril , o medick de barril , es una pequeña leguminosa anual originaria de la región mediterránea que se utiliza en la investigación genómica . Es una planta parecida a un trébol de crecimiento bajo, de 10 a 60 centímetros (3,9 a 23,6 pulgadas) de altura con hojas trifoliadas . Cada folíolo es redondeado, de 1 a 2 centímetros (0,39 a 0,79 pulgadas) de largo, a menudo con una mancha oscura en el centro. Las flores son amarillas y se producen solas o en una pequeña inflorescencia de dos a cinco juntas; el fruto es una vaina pequeña y espinosa.
Esta especie se estudia como organismo modelo para la biología de las leguminosas porque tiene un genoma diploide pequeño , es autofértil, tiene un tiempo de generación rápido y una producción prolífica de semillas, es susceptible de transformación genética y su genoma ha sido secuenciado. [4]
Forma simbiosis con rizobios fijadores de nitrógeno ( Sinorhizobium meliloti y Sinorhizobium medicae ) y hongos micorrízicos arbusculares, incluido Rhizophagus irregularis (anteriormente conocido como Glomus intraradices ). La planta modelo Arabidopsis thaliana no forma ninguna simbiosis, lo que convierte a M. truncatula en una herramienta importante para estudiar estos procesos.
También es una especie de cultivo forrajero importante en Australia .
El borrador de la secuencia del genoma del cultivar A17 de M. truncatula se publicó en la revista Nature en 2011. [4]
La secuenciación fue realizada por una asociación internacional de laboratorios de investigación en la que participaron investigadores de la Universidad de Oklahoma (EE.UU.), el Instituto J. Craig Venter (EE.UU.), Genoscope (Francia) y el Centro Sanger (Reino Unido). Las instituciones asociadas incluyeron la Universidad de Minnesota (EE.UU.), la Universidad de California-Davis (EE.UU.), el Centro Nacional de Recursos Genómicos (EE.UU.), el Centro John Innes (Reino Unido), el Instituto Nacional de Investigación Agronómica (Francia), el Centro de Información de Munich para Protein Sequences (Alemania), Universidad de Wageningen (Países Bajos) y Universidad de Gante (Bélgica). El Consorcio de Secuenciación de Medicago truncatula comenzó en 2001 con una subvención inicial de la Fundación Samuel Roberts Noble. En 2003, la Fundación Nacional para la Ciencia y el Sexto Programa Marco de la Unión Europea comenzaron a proporcionar la mayor parte de la financiación. En 2009, se había completado el 84% del ensamblaje del genoma. [5]
El ensamblaje de la secuencia del genoma de M. truncatula se basó en cromosomas artificiales bacterianos (BAC). Este es el mismo enfoque utilizado para secuenciar los genomas de los humanos, la mosca de la fruta, Drosophila melanogaster , y la planta modelo, Arabidopsis thaliana . En julio de 2013 se publicó la versión 4.0 del genoma. [6] Esta versión combinó secuencias obtenidas de la secuenciación de escopeta con los conjuntos de secuencias basados en BAC, lo que ha ayudado a llenar los vacíos en las secuencias mapeadas previamente.
Un grupo paralelo conocido como Grupo Internacional de Anotación de Genes de Medicago (IMGAG) es responsable de identificar y describir secuencias genéticas putativas dentro de la secuencia del genoma.
El investigador Toby Kiers de la Universidad VU de Ámsterdam y sus asociados utilizaron M. truncatula para estudiar las simbiosis entre plantas y hongos y para ver si los socios en la relación podían distinguir entre comerciantes/proveedores buenos y malos. Al utilizar carbono etiquetado para rastrear la fuente de nutrientes que fluye a través del sistema de micorrizas arbusculares, los investigadores han demostrado que las plantas efectivamente habían dado más carbono a las especies de hongos más generosas. Al restringir la cantidad de carbono que las plantas daban al hongo, los investigadores también demostraron que los hongos transmitían más fósforo a las plantas más generosas. [7]
Wienkoop et al 2004 y Larrainzar et al 2007 realizaron una investigación proteómica mediante espectrometría de masas .
Courty, Pierre Emmanuel; Smith, Penélope; Koegel, Sally; Redecker, Dirk; Wipf, Daniel (1 de junio de 2015). "Absorción y transporte de nitrógeno inorgánico en interacciones beneficiosas entre la raíz y el microbio de la planta". Reseñas críticas en ciencias vegetales . 34 (1–3): 4–16. doi :10.1080/07352689.2014.897897. S2CID 85772198.
