La lisidina es un nucleósido poco común , que rara vez se ve fuera del ARNt . Es un derivado de la citidina en el que el carbonilo se sustituye por el aminoácido lisina . La tercera posición en el anticodón del ARNt específico de isoleucina generalmente se cambia de una citidina que se emparejaría con guanosina a una lisidina que se emparejaría con adenosina . La lisidina mejora la fidelidad de la traducción porque la uridina no se puede utilizar en esta posición a pesar de que es un compañero convencional para la adenosina, ya que también " oscilará el par de bases " con la guanosina. [1] [2] La lisidina se indica como L [3] o k 2 C [4] (lisina unida al átomo C2 de citidina).
La base de lisidina se empareja con adenosina en el contexto de un par de bases de citidina a guanosina. R = ribosa. Las flechas indican los enlaces de hidrógeno que van desde los hidrógenos hasta el aceptor de enlaces. La notación de lisidina, L , se muestra arriba.
Referencias
^ Nakanishi, Kotaro; Fukai, Shuya; Ikeuchi, Yoshiho; Soma, Akiko; Sekine, Yasuhiko; Suzuki, Tsutomu; Nureki, Osamu (24 de mayo de 2005). "Base estructural para la formación de lisidina por la ATP pirofosfatasa acompañada de un bucle específico de lisina y un dominio de reconocimiento de ARNt". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 102 (21): 7487–7492. Código bibliográfico : 2005PNAS..102.7487N. doi : 10.1073/pnas.0501003102 . PMC 1140429 . PMID 15894617.
^ Salowe, Scott P.; Wiltsie, Judyann; Hawkins, Julio C.; Sonatore, Lisa M. (abril de 2009). "La flexibilidad catalítica de la tRNAIle-lisidina sintetasa puede generar sustratos de tRNA alternativos para la isoleucil-tRNA sintetasa". Revista de Química Biológica . 284 (15): 9656–9662. doi : 10.1074/jbc.M809013200 . PMC 2665086 . PMID 19233850.
^ Nakanishi, Kotaro; Bonnefond, Luc; Kimura, Satoshi; Suzuki, Tsutomu; Ishitani, Ryuichiro; Nureki, Osamu (octubre de 2009). "Base estructural para la fidelidad traduccional garantizada por la transferencia de ARN lisidina sintetasa". Naturaleza . 461 (7267): 1144-1148. Código Bib :2009Natur.461.1144N. doi : 10.1038/naturaleza08474. PMID 19847269. S2CID 4426738.
^ Sonawane, Kailas D.; Tewari, Ravindra (19 de septiembre de 2008). "Preferencias conformacionales del nucleósido lisidina hipermodificado (k 2 C) que ocurren en la posición 'bamboleo' en el bucle anticodón de tRNA Ile ". Nucleósidos, nucleótidos y ácidos nucleicos . 27 (10-11): 1158-1174. doi :10.1080/15257770802341475. PMID 18788046. S2CID 25220901.
