Linaje SARS-CoV-2 B.1.617

Linaje del virus COVID-19

El linaje B.1.617 es un linaje del SARS-CoV-2 , el virus que causa el COVID-19 . ^[1] Llamó la atención internacional por primera vez a finales de marzo de 2021, después de que el recién creado INSACOG realizara la secuenciación del genoma de muestras positivas en varios estados de la India . El análisis de muestras de Maharashtra reveló que, en comparación con diciembre de 2020, hubo un aumento en la fracción de muestras con las mutaciones E484Q y L452R . ^[2] Más tarde , los medios de comunicación apodaron a Lineage B.1.617 como un doble mutante . ^[3]

El linaje B.1.617 tiene tres sublinajes según la nomenclatura PANGO :

• B.1.617.1 (variante Kappa), detectada por primera vez en India en diciembre de 2020
• B.1.617.2 (variante Delta), detectada por primera vez en India a finales de 2020
• B.1.617.3, observado por primera vez en enero de 2021 ^[4]

Mutaciones

Proteína 'pico' del SARS-CoV-2

Estas son algunas de las mutaciones comunes presentes en la proteína de pico del linaje B.1.617. No todos los sublinajes de B.1.617 comparten las mismas mutaciones:

• L452R . La sustitución en la posición 452, una sustitución de leucina por arginina , confiere una mayor afinidad de la proteína de pico por el receptor ACE2 y una menor capacidad de reconocimiento del sistema inmunológico. ^{[5] [6]} Estas mutaciones, cuando se toman individualmente, no son exclusivas de la variante; más bien, lo es su ocurrencia simultánea. ^{[5] [7]} Esta mutación está presente en los tres sublinajes de B.1.617.
• T478K. La sustitución en la posición 478, una sustitución de treonina por lisina , ^[8] solo se encuentra en el linaje B.1.617.2. ^[9]
• E484Q . La sustitución en la posición 484, una sustitución de ácido glutámico por glutamina , confiere al linaje B.1.617 un potencial de unión más fuerte al receptor ACE2 humano , así como una mejor capacidad para evadir el sistema inmunológico del huésped en comparación con otras variantes. Esta mutación no está presente en el genoma B.1.617.2. ^[10]
• D614G . La sustitución en la posición 614, una sustitución de ácido aspártico por glicina , se comparte con otros linajes altamente transmisibles como B.1.1.7 , B.1.351 y P.1 . ^[11]
• P681R . La sustitución en la posición 681, una sustitución de prolina por arginina , que, según William A. Haseltine , puede aumentar la infectividad a nivel celular de la variante "al facilitar la escisión de la proteína precursora S a la configuración activa S1/S2". ^[10] Esta mutación está presente en los tres sublinajes de B.1.617.

Historia

La primera secuencia del genoma B.1.617 se envió a GISAID en el otoño de 2020, según una fuente. ^[12] El equipo de PANGO detrás de la curación manual del árbol filogenético del SARS-CoV-2 observó que la secuencia más temprana era del 7 de diciembre de 2020. Propusieron una nueva designación para la variante que contiene las mutaciones en la proteína de pico, incluidas G142D, L452R, E484Q. , D614G, P681R, entre otros, y a esta variante se le asignó el linaje PANGO B.1.617 el 1 de abril de 2021. ^[13] Revisaron el árbol filogenético para incluir tres sublinajes de B.1.617 el 21 de abril de 2021 después de notar que no todas las secuencias del genoma siendo asignado por la herramienta PANGOLIN contenía el mismo conjunto de mutaciones. ^[14]

Hasta mediados de abril de 2021, India presentó la mayor cantidad de genomas B.1.617, seguida en frecuencia por el Reino Unido y Estados Unidos. Según la información del genoma, el linaje B.1.617 se detectó por primera vez en el Reino Unido el 22 de febrero de 2021 y en los EE. UU. el 23 de febrero de 2021. ^[12]

Después de detectar 77 casos del linaje B.1.617 en el Reino Unido a mediados de abril de 2021, Public Health England designó el linaje como variante bajo investigación. ^[15] En menos de dos meses, la variante Delta se convertiría en la variante dominante en el Reino Unido y los investigadores afirmaron que la evidencia preliminar sugirió que puede haber un mayor riesgo de hospitalización para Delta en comparación con la variante Alfa previamente dominante. ^[dieciséis]

Referencias

1. "Linaje B.1.617". Linajes PANGO . Consultado el 12 de junio de 2021 .
2. "La secuenciación del genoma realizada por INSACOG muestra variantes preocupantes y una variante novedosa en la India". Oficina de información de prensa del Gobierno de la India . 24 de marzo de 2021.
3. "Covid-19: la variante de doble mutación alimenta los temores". El Telégrafo en línea . 17 de marzo de 2021.
4. "Linaje B.1.617.3". cov-lineages.org . Consultado el 10 de julio de 2021 .
5. Starr, Tyler N.; Greaney, Allison J.; Dingens, Adam S.; Bloom, Jesse D. (abril de 2021). "Mapa completo de mutaciones RBD del SARS-CoV-2 que escapan al anticuerpo monoclonal LY-CoV555 y su cóctel con LY-CoV016". Medicina de informes celulares . 2 (4): 100255. doi : 10.1016/j.xcrm.2021.100255 . ISSN  2666-3791. PMC 8020059 . PMID  33842902. 
6. Zhang, Wenjuan; Davis, Brian D.; Chen, Stephanie S.; Sincuir Martínez, Jorge M.; Plummer, Jasmine T.; Vail, Eric (6 de abril de 2021). "Aparición de una nueva variante del SARS-CoV-2 en el sur de California". JAMA . 325 (13): 1324-1326. doi : 10.1001/jama.2021.1612 . PMC 7879386 . PMID  33571356. 
7. Koshy, Jacob (8 de abril de 2021). "Coronavirus | Cepa india 'doble mutante' llamada B.1.617". El hindú . Consultado el 19 de abril de 2021 . Aunque estas mutaciones se han encontrado individualmente en varias otras variantes de coronavirus, la presencia de ambas mutaciones juntas se encontró por primera vez en algunos genomas de coronavirus de la India.
8. Greenwood, Michael (30 de marzo de 2021). "La mutación T478K del SARS-CoV-2 se propaga a una velocidad alarmante en México". Noticias médicas . Consultado el 6 de septiembre de 2021 . La mutación T478K constituye el intercambio del aminoácido no cargado treonina por la lisina cargada positivamente en la posición 478...
9. Delphine Planas (8 de julio de 2021). "Sensibilidad reducida de la variante Delta del SARS-CoV-2 a la neutralización de anticuerpos". Naturaleza . 596 (7871): 276–280. Código Bib :2021Natur.596..276P. doi : 10.1038/s41586-021-03777-9 . PMID  34237773. S2CID  235775860. La mutación T478K en el RBD es exclusiva de la variante Delta...
10. Haseltine, William. "Una variante india del SARS-CoV-2 aterriza en California. ¿Más peligro por delante?". Forbes . Consultado el 20 de abril de 2021 .
11. "Variantes preocupantes del SARS-CoV-2 al 3 de junio de 2021". Centro Europeo para la Prevención y el Control de Enfermedades . Archivado desde el original el 11 de junio de 2021.
12. "Reacción de los expertos a los casos de la variante B.1.617 (la 'variante india') que se están investigando en el Reino Unido". Centro de medios científicos . Consultado el 20 de abril de 2021 .
13. "Nuevo sublinaje B.1 propuesto que circula en la India n.º 38". GitHub . Consultado el 2 de abril de 2021 .
14. "Posibles secuencias que deberían incluirse en B.1.617 #49". GitHub . Consultado el 28 de febrero de 2021 .
15. "Casos confirmados de variantes de COVID-19 identificados en el Reino Unido". www.gov.uk. ​15 de abril de 2021. Archivado desde el original el 16 de abril de 2021.  Este artículo incorpora texto publicado bajo la licencia británica de gobierno abierto  v3.0:
16. "Casos confirmados de variantes de COVID-19 identificados en el Reino Unido". www.gov.uk. ​3 de junio de 2021. Archivado desde el original el 4 de junio de 2021.  Este artículo incorpora texto publicado bajo la licencia británica de gobierno abierto  v3.0: