stringtranslate.com

Precursor del microARN mir-29

El precursor de microARN miR-29 , o pre-miARN, es una pequeña molécula de ARN con forma de tallo-bucle o de horquilla . Cada brazo de la horquilla puede procesarse para formar un miembro de una familia estrechamente relacionada de ARN cortos no codificantes que participan en la regulación de la expresión génica . [1] Los productos procesados ​​o "maduros" de la molécula precursora se conocen como microARN (miARN) y se han predicho o confirmado en una amplia gama de especies (consulte 'MIPF0000009' en miRBase: la base de datos de microARN).

Procesamiento de miRNA

Los miRNA animales se transcriben primero como una molécula de miRNA primaria. Este "pri-miRNA" puede contener una o más horquillas precursoras, que son liberadas del pri-miRNA por la enzima nuclear Drosha . La horquilla precursora de aproximadamente 70 nucleótidos se exporta desde el núcleo y posteriormente es procesada por la enzima Dicer para dar un miRNA maduro que tiene en promedio 22 nucleótidos de longitud. Cualquiera de los brazos del precursor puede producir un ARN maduro, aunque en la mayoría de los casos, el brazo 3' (3p) o el 5' (5p) se procesan y cargan preferentemente en el complejo de silenciamiento inducido por ARN (RISC). Para el precursor miR-29, el brazo 3' del ARN precursor produce el producto predominantemente abrumador (miR-29 o miR-29-3p), aunque el brazo 5' (miR-29* o miR-29-5p) también se ha verificado experimentalmente.

La familia miR-29

Muchos genomas de mamíferos codifican cuatro precursores de miR-29 estrechamente relacionados que se transcriben en dos unidades transcripcionales. Por ejemplo, el miR-29a y el miR-29b-1 humanos se procesan a partir de un intrón de un transcrito largo no codificante (LOC646329) del cromosoma 7. El miR-29b-2 (idéntico en secuencia al miR-29b-1) y el miR-29c se cotranscriben a partir del cromosoma 1. Los tres miRNA maduros principales procesados ​​a partir de estos precursores se conocen como hsa-miR-29a, hsa-miR-29b y hsa-miR-29c.

El análisis de supervivencia en tres conjuntos de datos independientes muestra que hsa-miR-29c está asociado con la supervivencia en el cáncer de mama. [2]

Objetivos del miR-29

Se cree que los productos maduros ejercen funciones reguladoras al unirse con complementariedad parcial a los elementos de reconocimiento de microARN (MRE) en la región no traducida 3' (3' UTR) de las transcripciones objetivo. La evidencia experimental sugiere que los posibles objetivos de los productos maduros de miR-29 incluyen los siguientes:


Recientemente, en un intento de identificar objetivos a nivel global utilizando el enfoque de proteómica cuantitativa - SILAC , se identificaron VDAC1 y VDAC2 como objetivos de miR-29a en células HEK293T . [8]

Referencias

  1. ^ Ambros V (diciembre de 2001). "microARN: pequeños reguladores con gran potencial". Cell . 107 (7): 823–6. doi : 10.1016/S0092-8674(01)00616-X . PMID  11779458.
  2. ^ Lánczky, András; Nagy, Ádám; Bottai, Giulia; Munkácsy, Gyöngyi; Szabó, András; Santarpia, Líbero; Győrffy, Balázs (1 de diciembre de 2016). "miRpower: una herramienta web para validar miARN asociados a la supervivencia utilizando datos de expresión de 2178 pacientes con cáncer de mama". Investigación y tratamiento del cáncer de mama . 160 (3): 439–446. doi :10.1007/s10549-016-4013-7. ISSN  1573-7217. PMID  27744485. S2CID  11165696.
  3. ^ Mott JL, Kobayashi S, Bronk SF, Gores GJ (septiembre de 2007). "Mir-29 regula la expresión de la proteína Mcl-1 y la apoptosis". Oncogene . 26 (42): 6133–40. doi :10.1038/sj.onc.1210436. PMC 2432524 . PMID  17404574. 
  4. ^ Pekarsky Y, Santanam U, Cimmino A, Palamarchuk A, Efanov A, Maximov V, Volinia S, Alder H, Liu CG, Rassenti L, Calin GA, Hagan JP, Kipps T, Croce CM (diciembre de 2006). "La expresión de Tcl1 en la leucemia linfocítica crónica está regulada por miR-29 y miR-181" (PDF) . Investigación del cáncer . 66 (24): 11590–3. doi : 10.1158/0008-5472.CAN-06-3613 . PMID  17178851.
  5. ^ Fabbri M, Garzon R, Cimmino A, Liu Z, Zanesi N, Callegari E, Liu S, Alder H, Costinean S, Fernandez-Cymering C, Volinia S, Guler G, Morrison CD, Chan KK, Marcucci G, Calin GA, Huebner K, Croce CM (octubre de 2007). "La familia MicroRNA-29 revierte la metilación aberrante en el cáncer de pulmón al dirigirse a las metiltransferasas de ADN 3A y 3B". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 104 (40): 15805–10. doi : 10.1073/pnas.0707628104 . PMC 2000384 . PMID  17890317. 
  6. ^ Gebeshuber CA, Zatloukal K, Martinez J (abril de 2009). "miR-29a suprime la tristetraprolina, que es un regulador de la polaridad epitelial y la metástasis". EMBO Reports . 10 (4): 400–5. doi :10.1038/embor.2009.9. PMC 2672883 . PMID  19247375. 
  7. ^ Sanduja S, Blanco FF, Dixon DA (2011). "Los roles de las proteínas TTP y BRF en la degradación regulada del ARNm". Wiley Interdisciplinary Reviews: ARN . 2 (1): 42–57. doi :10.1002/wrna.28. PMC 3030256 . PMID  21278925. 
  8. ^ Bargaje R, Gupta S, Sarkeshik A, Park R, Xu T, Sarkar M, Halimani M, Roy SS, Yates J, Pillai B (2012). "Identificación de nuevos objetivos para miR-29a utilizando proteómica de miRNA". PLOS ONE . ​​7 (8): e43243. doi : 10.1371/journal.pone.0043243 . PMC 3428309 . PMID  22952654. 

Enlaces externos