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Lila Kari

Lila Kari (de soltera Sântean ) es una científica informática rumana y canadiense , profesora en la Escuela de Ciencias de la Computación David R. Cheriton de la Universidad de Waterloo , Canadá.

Biografía

La profesora Kari obtuvo una maestría en la Universidad de Bucarest en 1987, estudiando allí con Gheorghe Păun , y luego se trasladó a la Universidad de Turku en Finlandia para sus estudios de posgrado, obteniendo un doctorado en 1991 bajo la supervisión de Arto Salomaa . [1] [2] Llegó a la Universidad de Western Ontario como profesora visitante en 1993, y en 1996 había sido contratada allí como miembro de la facultad con permanencia. [2] [3] En 2017 aceptó un puesto de profesora de informática y Cátedra de Investigación Universitaria en la Universidad de Waterloo .

Investigación

La investigación de tesis de Kari fue en teoría del lenguaje formal . A mediados de la década de 1990, inspirada por un artículo de Leonard Adleman en Science , cambió sus intereses a la computación del ADN . [4] En su investigación, junto con Laura Landweber, ha iniciado y explorado el estudio del poder computacional del procesamiento del ADN en ciliados , [5] utilizando su experiencia para demostrar que las operaciones de ADN realizadas por recombinación genética en estos organismos son completas de Turing . [3] En esa década, también estudió cuestiones teóricas relevantes para las biomoléculas de ADN, como el no determinismo y la indecidibilidad en el autoensamblaje . [6] Desde principios de la década de 2000, se ha centrado en el estudio de las firmas genómicas y los métodos libres de alineamiento para la informática de la biodiversidad . Sus métodos utilizan varios conceptos teóricos como la representación del juego del caos de secuencias genómicas de ADN, así como herramientas computacionales que incluyen aprendizaje automático supervisado y no supervisado para identificar y clasificar organismos de diferentes especies. [7] [8] Una aplicación destacada de su trabajo es el estudio de las firmas genómicas de los extremófilos microbianos , donde ella y su equipo han descubierto evidencia que sugiere que, además de la información taxonómica, la información ambiental también podría estar presente en las firmas genómicas. [9]

Premios y honores

Kari ganó el premio de tesis doctoral Rolf Nevanlinna a la mejor tesis doctoral finlandesa en matemáticas en 1991. [10] [11] De 2002 a 2011, ocupó una Cátedra de Investigación de Canadá en Bioinformática. [12]

Referencias

  1. ^ Lila Kari en el Proyecto de Genealogía Matemática
  2. ^ ab "Biografía", Journal of Universal Computer Science , archivado desde el original el 22 de julio de 2020
  3. ^ ab "Investigador en bioinformática recibe el premio Bucke", Western News , Universidad de Western Ontario , 21 de marzo de 2002.
  4. ^ "Carreras en nanobiotecnología: a través de los ojos de un matemático", Science Careers , 2 de febrero de 2001, archivado desde el original el 21 de agosto de 2011
  5. ^ Landweber, Laura; Kari, Lila (1999), "La evolución de la computación celular: la solución de la naturaleza a un problema computacional", Biosystems , 52 (1–3): 3–13, CiteSeerX 10.1.1.297.3259 , doi :10.1016/s0303-2647(99)00027-1, PMID  10636025 .
  6. ^ Adleman, Leonard; Kari, Jarkko; Kari, Lila; Reishus, Dustin; Sosik, Petr (2009), "La indecidibilidad del problema de la cinta infinita: implicaciones para la computación por autoensamblaje", SIAM J. Comput. , 38 (6): 2356–2381, CiteSeerX 10.1.1.158.2098 , doi :10.1137/080723971 .
  7. ^ Kari, Lila; colina, Kathleen; Sayem, Abu; Karamichalis, Rallis; Bryans, Nathaniel; Davis, Katelyn; Dattani, Nikesh (2015), "Mapeo del espacio de firmas genómicas", PLOS ONE , 10 (5): e0119815, arXiv : 1406.4105 , Bibcode : 2015PLoSO..1019815K, doi : 10.1371/journal.pone.0119815 , PMC 4441465 , PMID  26000734 .
  8. ^ Karamichalis, Rallis; Kari, Lila; Konstantinidis, Stavros; Kopecki, Steffen (2015), "Una investigación sobre variaciones intergenómicas e intragenómicas de firmas genómicas gráficas", BMC Bioinformatics , 16 : 246, arXiv : 1503.00162 , Bibcode :2015arXiv150300162K, doi : 10.1186/s12859-015-0655-4 , PMC 4527362 , PMID  26249837 .
  9. ^ Arias, PM, Butler, J., Randhawa, GS et al. El entorno y la taxonomía dan forma a la firma genómica de los extremófilos procariotas. Sci Rep 13, 16105 (2023). https://doi.org/10.1038/s41598-023-42518-y
  10. ^ "Premio de tesis doctoral Rolf Nevanlinna". Archivado desde el original el 23 de junio de 2007. Consultado el 22 de febrero de 2012 .
  11. ^ Hamalainen, Anna-Liisa (diciembre de 1992), "Tytto joka haluaa kaiken" (PDF) , Kodin Kuvalehti (en finlandés): 22-24
  12. ^ "Canada Research Chairs: Lila Kari". Archivado desde el original el 8 de mayo de 2014. Consultado el 22 de febrero de 2012 .

Enlaces externos