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Chou Kuo-Chen

Kuo-Chen Chou (周国城; 14 de agosto de 1938–5 de julio de 2021) fue un biofísico y bioinformático chino-estadounidense que fundó el Gordon Life Science Institute, una organización de investigación sin fines de lucro en Boston, Massachusetts . [3] Entre otras contribuciones, desarrolló la composición de pseudoaminoácidos (PseAAC), utilizada en biología computacional para el análisis proteómico y la composición de pseudonucleótidos K-tuplas (PseKNC) para el análisis del genoma. [ cita requerida ] Es el padre de James Chou . [4]

En 2020, se reveló que Chou había sido expulsado del consejo editorial del Journal of Theoretical Biology y prohibido como revisor de la revista Bioinformatics por manipular repetidamente el proceso de revisión por pares para obtener citas de sus propios artículos. [5] Los editores del Journal of Theoretical Biology se refirieron a ello como "mala conducta científica del más alto orden". [5]

Investigación

En 1972, él y sus colaboradores, teniendo en cuenta el factor espacial y el factor de campo de fuerza entre la enzima y su sustrato , informaron que el límite superior de la reacción controlada por difusión de la enzima o enzima limitada por difusión es un orden de magnitud mayor que la estimación convencional, y se puede utilizar para dilucidar algunas tasas de reacción sorprendentemente altas en biología molecular. [ cita requerida ]

En 1977, predijo la existencia de fonones de baja frecuencia en proteínas, seguido por el desarrollo de la teoría del movimiento colectivo de baja frecuencia en proteínas y ADN después de haber sido confirmado por espectroscopia Raman . [6]

En 1995, propuso y demostró un teorema sobre la invariancia para abordar algunos problemas que suelen encontrarse en la bioinformática y la quimioinformática . [7]

En 1996, propuso la teoría de la clave distorsionada para orientar el diseño de fármacos peptídicos . [8]

Un diagrama de wenxiang

En 1997, propuso el diagrama wenxiang, una forma de mostrar las propiedades de los residuos en una hélice alfa similar a una rueda helicoidal . [ cita requerida ]

En 2011, propuso la regla de los 5 pasos, que se ha utilizado para análisis de proteomas y genomas , así como para predecir sitios de modificación postraduccional en secuencias de proteínas , ARN y ADN . [9] [ se necesita una mejor fuente ]

Hasta diciembre de 2019, Chou había publicado más de 720 artículos científicos en cinética enzimática, métodos gráficos en biología, predicción y función de la estructura de proteínas, movimiento colectivo de baja frecuencia en macromoléculas, análisis de proteomas y genomas, e identificación de sitios de modificación postraduccional en secuencias biológicas. [10]

Funciones editoriales

Chou desempeñó múltiples funciones editoriales, entre ellas la de editor en jefe (2008-2019) de The Open Bioinformatics Journal , y fue miembro de los consejos editoriales del Journal of Theoretical Biology (2005-2019), el Journal of Biomedicine and Biotechnology (2008-2014) y The Open Biochemistry Journal (2007-2019), entre otros. [ cita requerida ]

Fue editor honorario de The Open Bioinformatics Journal (2020-2021) y editor asociado de Medicinal Chemistry (2004-2021). [ cita requerida ]

Reconocimiento

Los artículos de Chou han sido ampliamente citados. Según Web of Science , su índice h es 135. [11] Ha sido seleccionado continuamente durante cinco años (2014, 2015, 2016, 2017 y 2018) por Thomson Reuters y Clarivate Analytics como Investigador altamente citado de ISI . [12] [13] [14] [15] [16] Sin embargo, es notable que muchas de las citas de Chou pueden ser resultado de la manipulación del proceso editorial y de arbitraje, según la controversia a continuación.

Mala conducta editorial y abuso de citas

En 2019, la revista Bioinformatics publicó un editorial que detallaba las acciones de un revisor que incurrió en citas coercitivas . [17] En 2020, el Journal of Theoretical Biology publicó otro editorial en el que afirmaba que el mismo revisor formaba parte de su consejo editorial y también había incurrido en malas prácticas de citación coercitiva, y había cometido más infracciones de la conducta científica. [18] La revista Nature reveló más tarde que el individuo anónimo era Kuo-Chen Chou. [5]

Referencias

  1. ^ Chou, Kuo Chen; Nemethy, George; Scheraga, Harold A. (30 de mayo de 1990). "Energética de las interacciones de elementos estructurales regulares en proteínas". Accounts of Chemical Research . 23 (5): 134–141. doi :10.1021/ar00173a003.
  2. ^ "Obituario de Kuo - Chen Chou". Brown & Hickey Funeral Home . Consultado el 26 de octubre de 2022 .
  3. ^ "Instituto de Ciencias de la Vida Gordon". gordonlifescience.org .
  4. ^ "La controversia sobre los medicamentos contra la gripe". The Scientist Magazine® .
  5. ^ abc Noorden, Richard Van (6 de febrero de 2020). "Investigador muy citado expulsado del comité de la revista por abuso de citas". Nature . 578 (7794): 200–201. Bibcode :2020Natur.578..200V. doi : 10.1038/d41586-020-00335-7 . PMID  32047304.
  6. ^ Chou KC (1988). "Movimiento colectivo de baja frecuencia en biomacromoléculas y sus funciones biológicas". (secundario). Química biofísica . 30 (1): 3–48. doi :10.1016/0301-4622(88)85002-6. PMID  3046672.; Chou KC (marzo de 1994). "Fe de erratas". Química biofísica . 49 (2): 183. doi :10.1016/0301-4622(94)85002-X.
  7. ^ Chou KC (abril de 1995). "Un nuevo enfoque para predecir las clases estructurales de proteínas en un espacio de composición de aminoácidos (20-1)-D". Proteins . 21 (4): 319–44. doi :10.1002/prot.340210406. PMID  7567954. S2CID  25196569.
  8. ^ Chou KC (1996). "Revisión: Predicción de los sitios de escisión de la proteasa del virus de la inmunodeficiencia humana en las proteínas". Analytical Biochemistry . 233 (1): 1–14. doi :10.1006/abio.1996.0001. PMID  8789141.
  9. ^ Chou, Kuo-Chen (21 de marzo de 2011). "Algunas observaciones sobre la predicción de atributos proteicos y la composición de pseudoaminoácidos". Journal of Theoretical Biology . 273 (1): 236–247. Bibcode :2011JThBi.273..236C. doi :10.1016/j.jtbi.2010.12.024. ISSN  0022-5193. PMC 7125570 . PMID  21168420. 
  10. ^ "Kuo-Chen Chou - Citas de Google Académico". scholar.google.com .
  11. ^ "Perfil de Publons de Kuo-Chen Chou". publons.com .
  12. ^ "Listas de HCR archivadas" (PDF) .
  13. ^ "Listas de HCR archivadas" (PDF) .
  14. ^ "Listas de HCR archivadas" (PDF) .
  15. ^ "Listas de HCR archivadas" (PDF) .
  16. ^ "Listas de HCR archivadas" (PDF) .
  17. ^ Wren, JD; Valencia, A; Kelso, J (15 de septiembre de 2019). "Citación coaccionada por el revisor: informe de caso, actualización de la política de la revista y sugerencias para la prevención futura". Bioinformática . 35 (18): 3217–3218. doi :10.1093/bioinformatics/btz071. PMC 6748764 . PMID  30698640. 
  18. ^ Chaplain, M; Kirschner, D; Iwasa, Y (7 de marzo de 2020). "Mala praxis editorial en JTB: informe de un caso". Revista de biología teórica . 488 : 110171. Bibcode :2020JThBi.48810171C. doi : 10.1016/j.jtbi.2020.110171 . PMID  32007131.

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