Su padre, Jim Hinrich, fue su entrenador durante los cuatro años en permaneció allí, donde acumuló un registro de 82 victorias y tan solo 9 derrotas, ganando además el campeonato estatal en su año sénior.
Cuando se graduó ya era el líder histórico en puntos, asistencias y robos de este instituto.
Allí, en su año freshman consiguió 123 asistencias y recibió el premio Clyde Lovellette al jugador más mejorado.
Recibió también el premio Ted Owens a mejor jugador defensivo de Kansas.
A pesar de ello su equipo, los Chicago Bulls, cayeron en seis partidos contra los Washington Wizards.
Al finalizar la temporada regular promediaba 15.9 puntos, 6.4 asistencias y 3.6 robos por partido; además fue el único jugador de los Bulls en promediar más de un robo por partido.
Acabó la temporada regular promediando 16.6 puntos, 6.3 asistencias, 3.4 rebotes y 1.2 robos por partido, los mejores números de su carrera.
Se perdió varios partidos y jugó con molestias tantos otros, por lo que registró los números más bajos en puntos (11.5), asistencias (6.0), rebotes (3.3) y minutos jugados (31.7) de su carrera.
En la temporada 2008-09 la llegada del número 1 del draft, el base Derrick Rose, forzó a Hinrich a jugar muchos minutos de escolta y jugar de base solamente cuando Rose estuviera descansando.
[5] y, al año siguiente, ejerce su opción de jugador para seguir una temporada más en Chicago, la 2015–16.
Sin embargo, al terminar la temporada 2005-06, Hinrich cambió de opinión y aceptó un puesto en la lista del equipo.