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Jemma Geoghegan

Jemma Louise Geoghegan (nacida en 1985 o 1986) [1] es una viróloga evolutiva nacida en Escocia , con sede en la Universidad de Otago , Nueva Zelanda, que se especializa en la investigación de enfermedades infecciosas emergentes y el uso de la metagenómica para rastrear la evolución de los virus . Como líder en varios proyectos de investigación financiados por el gobierno, Geoghegan se convirtió en la cara pública de la secuenciación genómica durante la respuesta de Nueva Zelanda al COVID-19 . Su investigación ha contribuido al debate sobre la causa probable del COVID-19 y los desafíos en torno a la predicción de pandemias. Recibió el premio Young Tall Poppy en 2017, una beca Rutherford Discovery en 2020 y el premio Prime Minister's Emerging Scientist Prize de 2021 .

Vida temprana y educación

Geoghegan nació y creció en Cupar , Escocia. Fue aceptada en la Universidad de Strathclyde , Glasgow , pero en 2004 se tomó un año libre de la escuela antes de comenzar sus estudios universitarios para trabajar como profesora voluntaria en Baddegama , Sri Lanka . [1] A la edad de 18 años, regresó a la Universidad de Strathclyde y completó su Licenciatura en Ciencias ( con honores ) en Genética , especializándose en Biología Forense en 2009. [2] Recibió una beca para hacer un doctorado en la Universidad de Otago y se mudó a Nueva Zelanda . El profesor Hamish Spencer le ofreció la oportunidad de hacer el doctorado , quien dijo que "eligió a Geoghegan para el puesto debido a su formación 'interesante'". [2] Al completar su doctorado en biología evolutiva en 2012, [3] Geoghegan fue a Nueva York, donde trabajó con un grupo de la Universidad de Nueva York que se centró en el VIH . En 2013 se mudó a Australia y trabajó como investigadora postdoctoral en la Universidad de Sídney de 2013 a 2017, antes de conseguir su propio laboratorio en la Universidad Macquarie . [1]

Carrera

Geoghegan trabajó como profesora en la Universidad Macquarie de 2017 a 2020. [4] En 2017, por su investigación como bióloga evolutiva, recibió el premio Tall Young Poppy. [5]

Desde 2020, Geoghegan ha sido profesora titular en el departamento de microbiología e inmunología de la Universidad de Otago y científica asociada senior en el Instituto de Ciencias Ambientales e Investigación (ESR). En agosto de 2023 fue promovida a la Cátedra Webster Family en Patogénesis Viral en Otago. [6]

Secuenciación del genoma

Perfil público

Geoghegan ha sido descrito como uno de los "comunicadores destacados de Nueva Zelanda... uno de los rostros de los esfuerzos de secuenciación del genoma de COVID-19 de este país". [1] En un artículo publicado en The Spinoff , la científica Siouxsie Wiles, con sede en Nueva Zelanda, reconoció a Geoghegan como "una de las personas detrás de los increíbles esfuerzos de Nueva Zelanda para secuenciar todas las cepas del virus que tenemos aquí". [7] Wiles también recomendó que aquellos interesados ​​en aprender más sobre la secuenciación del genoma consulten la investigación que está desarrollando un equipo que incluye a Geoghegan. [8] El artículo de esta investigación se publicó más tarde el 11 de diciembre de 2020. [9] The Guardian reconoció a Geoghegan como "uno de los científicos que lideran el trabajo para analizar las secuencias genómicas del virus". [10]

Cuando Gran Bretaña decidió en julio de 2021 levantar todas las restricciones de salud pública tras los confinamientos durante la COVID-19 a pesar de que solo la mitad de la población estaba vacunada, Geoghegan compartió las preocupaciones de Siouxsie Wiles , Ashley Bloomfield y Julie Anne Genter de que esto probablemente conduciría a la circulación mundial de variantes más peligrosas del virus, lo que socavaría los programas de vacunación. Dijo que esto estaba " [entrenando] al virus para que escapara a la inmunidad inducida por la vacuna", y que el país necesitaba un umbral de vacunación más alto para hacer frente a la variante Delta . [11]

En enero de 2022, cuando la variante Ómicron comenzó a circular en Nueva Zelanda y parecía que habría otra mutación , BA.2, [12] Geoghegan señaló que "la nueva mutación se encuentra en gran medida a través de la secuenciación del genoma, ya que solo ciertos tipos de pruebas de PCR (hisopado nasal) detectan las diferencias sutiles entre Delta y BA.2... [pero que]... las personas que están completamente vacunadas con refuerzos estaban "efectivamente protegidas" contra la nueva variante. [13] En junio de 2022, se sostuvo ampliamente que Omicron probablemente se volvería endémica en Nueva Zelanda. Considerando las implicaciones de esto, un comentarista escribió: "los únicos determinantes de cuántas personas se enfermarán, incapacitarán o morirán por el virus son sus saltos evolutivos y nuestras acciones para dar forma a su entorno". [14] Geoghegan estuvo de acuerdo en que el huésped y el virus están en una "carrera armamentista evolutiva en la que siguen cambiando para tratar de vencerse entre sí", pero señaló que es difícil predecir cómo podría cambiar el virus a medida que nuevas variantes intentan evadir la inmunidad de la vacunación o la vacunación previa. Infección. Dijo que factores como "células que se replican e infectan rápidamente dentro de una persona inmunodeprimida crónica... [o]... una recombinación de diferentes variantes, tal vez en un huésped animal" podrían afectar esto. [14]

Debate sobre las causas del COVID-19

A principios de 2020, cuando se plantearon preguntas sobre las causas de la pandemia de coronavirus, Geoghegan fue consultada en 7 News , como científica cuya "experiencia se centra en el área donde se encuentran los animales y los humanos", si y cómo el COVID-19 había saltado de los animales a los humanos. Explicó que los murciélagos contienen virus similares al COVID-19, pero para confirmar que estaban "genéticamente relacionados", era necesario observar las "firmas genéticas" del virus. [15] En 2018, Geoghegan había participado en un estudio de investigación que utilizó una lente metagenómica para mostrar mediante el examen de la secuenciación del genoma de los virus en los peces como los ancestros de todos los vertebrados, cómo un virus puede propagarse y evolucionar a través del tiempo y el espacio, confirmando que existe en la naturaleza y no necesariamente creado por humanos. [16] Geoghegan ha señalado que el genoma del SARS-CoV-2, el virus que causa la COVID-19, está estrechamente relacionado con otros virus presentes en la naturaleza y que, como nuevo virus del SARS , es probable que el coronavirus haya seguido una ruta similar a la que causó el brote de SARS en 2003, cuando se propagó de animales vivos a humanos. Geoghegan concluyó que "las interacciones humanas con animales vivos hacen que sea más probable que se produzca un salto de hospedador, y los mercados de animales vivos son una fuente masiva de estas interacciones". [17]

Predicción de virus

Geoghegan publicó un artículo en el Australasian Science Journal (2016) que investigó el papel de los factores biológicos como el tamaño, la estructura y el modo de transmisión de los virus en la predicción de su riesgo de ser transmisibles entre humanos. [18] En el mismo año colaboró ​​en una investigación con Edward Holmes que explora si los virus podrían predecirse. [19] Al discutir la investigación con Ed Yong en The Atlantic , Geoghegan dijo que la predicción es difícil debido a la gran cantidad de virus y apoyó las conclusiones de otro científico, Kristian Anderson, del Scripps Research Institute cuando dijo que era "simplemente imposible... [predecir] ... si un virus animal recién descubierto podría saltar a los humanos y causar una pandemia". [20] En el artículo, Geoghagen argumentó que es mejor identificar "líneas de falla" donde los animales y las personas interactúan. Yong concluyó: "El tipo de vigilancia que Geoghagen, Andersen y otros están pidiendo... [es] ...vital". [20] En mayo de 2020, Geoghegan le dijo a The Sydney Morning Herald que la mejor manera de obtener conocimiento sobre la posible predicción de virus es financiar la vigilancia de las personas, particularmente en lugares donde interactúan con animales vivos e identificar las "zonas de riesgo". [21] Presentado por Kate Hawkesby en Newstalk ZB como "un experto en secuenciación del genoma", Geoghegan explicó que cuando un virus salta de persona a persona, crea una nueva mutación que podría rastrearse en términos de origen y posible propagación en la comunidad. [22]

Gripe aviar

En agosto de 2023, Geoghegan fue coautor de un artículo en el que advertía de que nuevas cepas de la gripe aviar (conocida como gripe aviar) estaban provocando una panzootia mundial entre las aves acuáticas, con [cada vez más frecuentes] "propagaciones a huéspedes no aviares como los mamíferos". [23] El artículo señalaba que hasta 2023 no se habían producido casos de las variantes en Nueva Zelanda, pero advertía de que el país era vulnerable debido a la gran cantidad de aves migratorias que llegan cada año, algunas de las cuales pueden sufrir infecciones asintomáticas. Los autores señalaron que Nueva Zelanda tenía poca vigilancia de los virus activos en la vida silvestre y sugirieron una serie de medidas que el país podría adoptar para estar preparado ante incursiones. Entre ellas se incluirían la sensibilización cuando se produjeran muertes inesperadas de animales, una mayor focalización en los patógenos conocidos y la maximización del uso de las "capacidades de genómica viral... establecidas durante la COVID-19". [23]

Proyectos de investigación seleccionados

Instituto de Ciencias e Investigaciones Ambientales

En mayo de 2020, como resultado de una colaboración entre la Universidad de Otago y el Instituto de Ciencias Ambientales e Investigación (ESR), Geoghegan recibió 600.000 dólares del Fondo de Aceleración de la Innovación COVID-19 del Ministerio de Negocios, Innovación y Empleo (MBIE). Su función era dirigir un equipo internacional de científicos para secuenciar los genomas de todos los casos positivos de COVID-19 de Nueva Zelanda y rastrear cómo se propagó el virus en el país. [24] En agosto de 2020, el equipo pudo mostrar una secuenciación genómica que confirmaba que el origen del virus en Nueva Zelanda era del extranjero y se propagaba principalmente dentro del país en reuniones sociales. [25] Cuando Auckland tuvo otro brote comunitario del virus en agosto de 2020, Geoghegan le dijo a Kathryn Ryan en RNZ National que el trabajo en el que estaba involucrada con el ESR podía identificar de qué instalación de cuarentena o puesto fronterizo se había originado el virus y comparar los genomas de los nuevos casos con los de las "instalaciones de aislamiento administrado", o de todo el mundo. [26]

En un podcast, Geoghegan explicó cómo funcionaba la secuenciación del genoma y que los datos recopilados se estaban compartiendo a nivel internacional como una respuesta rápida al COVID-19. [27] Tras el segundo brote del virus en la comunidad de Nueva Zelanda en agosto de 2020, Geoghegan dijo:

Es vital que la genómica sea parte de esta respuesta para permitirnos rastrear dónde pueden haber surgido estos casos y estimar el tamaño y la cantidad de grupos presentes... [y] ...al comparar los genomas del virus de estos casos con los de las instalaciones de cuarentena y la población mundial, podemos determinar su origen probable y cuánto tiempo han estado circulando en la comunidad. [28]

En noviembre de 2020, cuando un miembro de la tripulación que había llegado a Nueva Zelanda desde el extranjero dio positivo, Geoghegan reiteró la importancia de la secuenciación del genoma para establecer si el virus estaba relacionado con infecciones locales o globales y la probabilidad de que la transmisión de los casos ocurriera durante el vuelo. [29]

Beca de descubrimiento Rutherford

El 22 de octubre de 2020, la Royal Society Te Aparangi anunció que Geoghegan había recibido la beca Rutherford Discovery Fellowship , financiada por el gobierno . La beca de 800.000 dólares financiaría el estudio de Geoghegan, titulado Barreras ecológicas e impulsores de la aparición de virus . Su objetivo era mostrar "cómo evolucionan los virus para dar el salto a una nueva especie huésped , mediante la secuenciación del ARN de diversas especies animales de Nueva Zelanda y el análisis de los virus presentes". Geoghegan describió esto como significativo en el contexto de la pandemia de COVID-19 , y sería el "primer estudio que examina la ecología y la evolución de los virus de tal magnitud en este país". [30] [31]

En 2021, el trabajo de Geoghegan continuó y se centró inicialmente en la variante del virus del Reino Unido que había estallado en Nueva Zelanda. Dijo que la variante contenía "algunas mutaciones que probablemente estaban aumentando la tasa de transmisión... [pero]... el mayor impulsor de la propagación del virus es una población que no tiene inmunidad, que es básicamente toda Nueva Zelanda". [32]

Premios

En 2017, Geoghegan recibió el premio Young Tall Poppy, organizado por el Instituto Australiano de Política y Ciencia (AIPS). Geoghegan dijo que le apasionaba comunicar los resultados de sus investigaciones a la comunidad en general y que el premio era una oportunidad para adquirir más habilidades en esta área. [33]

Geoghegan recibió el Premio Alan Wilton de la Sociedad de Genética de Australia para reconocer las contribuciones destacadas al campo de la investigación genética realizadas por científicos de Australasia al comienzo de su carrera en 2017. [34]

En 2017 ganó el Premio a la Excelencia en Investigación en el Inicio de Carrera de la Facultad de Ciencias e Ingeniería de la Universidad Macquarie. [35]

En mayo de 2022, Geoghegan recibió el premio Científico Emergente del Primer Ministro de 2021, por un valor de 200.000 dólares. [36] En la revista North & South , Paul Gorman escribió que "cientos, si no miles, de neozelandeses siguen vivos gracias a que Geoghegan y sus colegas rastrearon los brotes de la variante Delta durante la fase de eliminación de la pandemia. Algunos contemporáneos creen que ha ayudado a salvar millones de vidas en todo el mundo debido a que la gente evitó el virus". [2] Geohegan reconoció que al recibir el premio estaba desafiando el estigma en torno a las mujeres en la ciencia y "planeaba utilizar los fondos del premio para apoyar más investigaciones y la formación de los estudiantes". [37]

Referencias

  1. ^ abcd UNI News (2 de diciembre de 2020). «Una exploradora moderna: la Dra. Jemma Geoghegan». Universidad de Otago. The Otago Bulletin. Archivado desde el original el 3 de diciembre de 2020. Consultado el 29 de marzo de 2021 .
  2. ^ abc Gorman, Paul (octubre de 2022). "El cazador de virus". Norte y Sur . Archivado desde el original el 27 de octubre de 2022. Consultado el 27 de octubre de 2022 .
  3. ^ Geoghegan, Jemma (2013), Modelado de la selección bajo herencia blanda (tesis doctoral), OUR Archive, hdl :10523/3718, Wikidata  Q111965714
  4. ^ "MICROBIOLOGÍA E INMUNOLOGÍA Te Tari Moromoroiti me te Ārai Mate – Dra. Jemma Geoghegan". micro.otago.ac.nz . Archivado desde el original el 5 de marzo de 2022 . Consultado el 29 de marzo de 2021 .
  5. ^ "Macquarie cultiva bien nuestras amapolas altas: la bióloga evolutiva Dra. Jemma Geoghegan recibe el premio". Universidad Macquarie. Sala de prensa. 21 de agosto de 2017. Archivado desde el original el 24 de agosto de 2017. Consultado el 29 de marzo de 2021 .
  6. ^ "Nuevo y prestigioso puesto para la profesora Jemma Geoghegan". Universidad de Otago . Archivado desde el original el 7 de agosto de 2023. Consultado el 7 de agosto de 2023 .
  7. ^ Wiles, Siouxsie (23 de noviembre de 2020). «Dolores en un avión: nuevos hallazgos sobre la transmisión de Covid en vuelo». The Spinoff. Archivado desde el original el 22 de noviembre de 2020. Consultado el 29 de marzo de 2021 .
  8. ^ Wiles, Siouxsie (13 de agosto de 2020). "Cómo la secuenciación del genoma podría resolver el caso del regreso de la COVID-19 en Nueva Zelanda". Universidad de Auckland. Archivado desde el original el 19 de agosto de 2020. Consultado el 4 de abril de 2021 .
  9. ^ Geoghegan, Jemma L.; et al. (11 de diciembre de 2020). "La epidemiología genómica revela patrones de transmisión y dinámica del SARS-CoV-2 en Aotearoa Nueva Zelanda". Nature Communications . 11 (6351): 6351. Bibcode :2020NatCo..11.6351G. doi : 10.1038/s41467-020-20235-8 . PMC 7733492 . PMID  33311501. 
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