Ismail Khan ( en chagatai y persa : اسماعیل خان) fue Khan de Yarkand y Kashgar entre 1666 y 1669. Fue reemplazado por Ilbars Khan entre 1669 y 1670. Su kan fue restaurado entre 1670 y 1680.
En 1680, Galdan Boshugtu Khan dirigió a 120.000 jinetes dzungar hacia la cuenca del Tarim a través de Aksu y Turpan hacia Kashgar y Yarkand con la ayuda de Afaq Khoja de los Khoja de la Montaña Blanca y sus seguidores. El ejército hizo un buen progreso en su avance. El hijo del gobernante chagatai Ismail Khan, Babak Sultan, dirigió sus tropas y ofreció una feroz resistencia solo para morir en la batalla. Habiendo ocupado Kashgar, el ejército dzungar avanzó inmediatamente sobre Yarkand. El general Yiwazibo (Iwaz Beg), enviado para oponerse a su avance, fue asesinado, y los dzungar ocuparon Yarkand y tomaron a Ismail Khan y su familia como prisioneros para Ili . [1] [2]