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Inte: ligando

Inte:Ligand se fundó en Maria Enzersdorf , Baja Austria (Niederösterreich) en 2003. [1] Ese mismo año establecieron la sede de la empresa en Mariahilferstrasse en Viena , Austria .

En 2007, Inte:Ligand recibió el premio NÖ Innovation (Innovationpreis) por el desarrollo del software de simulación LigandScout. [2] [3] [4] [5] A partir de 2017, se publicaron más de 1500 literatura, capítulos de libros y artículos de revisión relacionados con la tecnología de software InteLigand en las áreas de detección virtual, [6] [7] [8] 3D -modelado de farmacóforos, [9] [10] [11] [12] identificación de resultados, [13] [14] [ 15] [16] [17] [18] apoyo a la toma de decisiones en química medicinal, [19] [20] [21 ] perfil de actividad, [22] acoplamiento, diseño de compuestos basado en fragmentos, [23] interacciones proteína-proteína, [24] reutilización de fármacos [25] y simulaciones de dinámica molecular. [26] [27] [28]

Otras aplicaciones incluyen el descubrimiento de nuevos ligandos de mieloperoxidasa , [29] inhibidores de la transcriptasa inversa del VIH , [30] aplicaciones en perfiles de bioactividad antiviral, [31] el desarrollo de modelos para predecir la actividad de la proteasa del VIH , [32] la actividad del citocromo P450. predicción, [33] y modelos de simulación para la actividad en el Factor Xa . [34]

Ciencia y Tecnología

Ver también

Otras empresas e instituciones que ofrecen software de descubrimiento de fármacos:

Referencias

  1. ^ "Inte:Ligand Software-Entwicklungs- und Consulting GmbH - Viena - Telefon - Kontakt - Información y consultoría - Firmen AZ". firman.wko.at (en alemán austriaco) . Consultado el 2 de julio de 2017 .
  2. ^ Wolber, Gerhard; Dornhofer, Alois A.; Langer, Thierry (1 de diciembre de 2006). "Superposición eficiente de pequeñas moléculas orgánicas utilizando farmacóforos 3D". Revista de diseño molecular asistido por computadora . 20 (12): 773–788. Código Bib : 2006JCAMD..20..773W. doi :10.1007/s10822-006-9078-7. ISSN  0920-654X. PMID  17051340. S2CID  31986330.
  3. ^ "Land Niederösterreich und Wirtschaftskammer NÖ verleihen NÖ Innovationspreis 2007". OTS.en . Consultado el 2 de julio de 2017 .
  4. ^ "Waldviertelnews.at". www.waldviertelnews.at . Consultado el 2 de julio de 2017 .
  5. ^ Wolber, Gerhard; Langer, Thierry (1 de enero de 2005). "LigandScout: farmacóforos tridimensionales derivados de ligandos unidos a proteínas y su uso como filtros de detección virtuales". Revista de información y modelado químico . 45 (1): 160–169. doi :10.1021/ci049885e. ISSN  1549-9596. PMID  15667141.
  6. ^ Karaboga, Arnaud S.; Planesas, Jesús M.; Petronin, Florent; Teixidó, Jordi; Souchet, Michel; Pérez-Nueno, Violeta I. (24 de mayo de 2013). "Modelo de farmacóforo altamente específico y sensible para identificar antagonistas de CXCR4. Comparación con el rendimiento de detección virtual de acoplamiento y coincidencia de formas". Revista de información y modelado químico . 53 (5): 1043-1056. doi :10.1021/ci400037y. ISSN  1549-9596. PMID  23577723.
  7. ^ Lijadoras, Marijn PA; Barbosa, Arménio JM; Zarzycka, Bárbara; Nicolaes, Gerry AF; Klomp, enero PG; de Vlieg, Jacob; Del Río, Alberto (25 de junio de 2012). "Análisis comparativo de herramientas de detección de farmacóforos". Revista de información y modelado químico . 52 (6): 1607-1620. doi :10.1021/ci2005274. ISSN  1549-9596. PMID  22646988.
  8. ^ Kaserer, T.; Obermoser, V.; Weninger, A.; Ráfaga, R.; Schuster, D. (29 de noviembre de 2016). "Evaluación de herramientas de detección virtual 3D seleccionadas para la identificación prospectiva de agonistas parciales γ del receptor activado por proliferador de peroxisomas (PPAR)". Revista europea de química medicinal . 124 : 49–62. doi : 10.1016/j.ejmech.2016.07.072 . PMID  27560282.
  9. ^ Seidel, Thomas; Bryant, Sharon D.; Ibis, Gökhan; Poli, Giulio; Langer, Thierry (2017). Varnek, Alexandre (ed.). Tutoriales en Quimioinformática . John Wiley & Sons, Ltd. págs. 279–309. doi :10.1002/9781119161110.ch20. ISBN 9781119161110.
  10. ^ Lagarde, Nathalie; Delahaye, Solenne; Zagury, Jean-François; Montes, Matthieu (6 de septiembre de 2016). "Discriminación de ligandos agonistas y antagonistas de los receptores nucleares mediante farmacóforos 3D". Revista de quimioinformática . 8 (1): 43. doi : 10.1186/s13321-016-0154-2 . ISSN  1758-2946. PMC 5011875 . PMID  27602059. 
  11. ^ Liu, Jiyuan; Tian, ​​Zhen; Zhang, Yalin (6 de octubre de 2016). "Descubrimiento basado en la estructura de semioquímicos potencialmente activos para Cydia pomonella (L.)". Informes científicos . 6 (1): 34600. Código bibliográfico : 2016NatSR...634600L. doi :10.1038/srep34600. ISSN  2045-2322. PMC 5052595 . PMID  27708370. 
  12. ^ Wolber, Gerhard; Kosara, Robert (2006). Langer, Thierry; Hoffmann, Rémy D. (eds.). Farmacóforos y búsquedas de farmacóforos . Wiley-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA. págs. 131-150. doi :10.1002/3527609164.ch6. ISBN 9783527609161.
  13. ^ Langer, Thierry; Hoffmann, Rémy; Bryant, Sharon; Lesur, Brigitte (2009). "Hallazgo de éxito: hacia enfoques 'más inteligentes'". Opinión actual en farmacología . 9 (5): 589–593. doi :10.1016/j.coph.2009.06.001. PMID  19576852.
  14. ^ Takimoto, Seisuke; Sugiura, Airi; Minami, Saki; Tasaka, Tomohiko; Nakagawa, Yoshiaki; Miyagawa, Hisashi (1 de abril de 2016). "Exploración in silico de agonistas / antagonistas de brasinolida". Cartas de química bioorgánica y medicinal . 26 (7): 1709-1714. doi :10.1016/j.bmcl.2016.02.054. PMID  26935445.
  15. ^ Vuorinen, Anna; Engeli, Roger; Meyer, Arne; Bachman, Fabio; Griesser, Ulrich J.; Schuster, Daniela; Odermatt, Alex (24 de julio de 2014). "Modelado de farmacóforos basado en ligandos y detección virtual para el descubrimiento de nuevos inhibidores de la 17β-hidroxiesteroide deshidrogenasa 2". Revista de Química Medicinal . 57 (14): 5995–6007. doi :10.1021/jm5004914. ISSN  0022-2623. PMC 4111740 . PMID  24960438. 
  16. ^ Perdih, Andrej; Kovac, Andreja; Wolber, Gerhard; Blanot, Didier; Gobec, Stanislav; Solmajer, Tom (15 de mayo de 2009). "Descubrimiento de nuevos inhibidores del ácido benceno 1,3-dicarboxílico de las ligasas bacterianas MurD y MurE mediante un enfoque de detección virtual basado en estructuras". Cartas de química bioorgánica y medicinal . 19 (10): 2668–2673. doi :10.1016/j.bmcl.2009.03.141. PMID  19369074.
  17. ^ Waltenberger, Birgit; Garscha, Ulrike; Temml, Verónica; Mentirosos, Josephine; Werz, Oliver; Schuster, Daniela; Stuppner, Hermann (25 de abril de 2016). "Descubrimiento de potentes inhibidores solubles de la epóxido hidrolasa (sEH) mediante detección virtual basada en farmacóforos". Revista de información y modelado químico . 56 (4): 747–762. doi : 10.1021/acs.jcim.5b00592. ISSN  1549-9596. PMID  26882208.
  18. ^ Voet, Arnout RD; Kumar, Ashutosh; Bérenger, Francois; Zhang, Kam YJ (1 de abril de 2014). "Combinación de enfoques in silico e in cerebro para la detección virtual y la predicción de pose en SAMPL4". Revista de diseño molecular asistido por computadora . 28 (4): 363–373. Código Bib : 2014JCAMD..28..363V. doi :10.1007/s10822-013-9702-2. ISSN  0920-654X. PMID  24446075. S2CID  13467787.
  19. ^ DeBonis, Salvatore; Skoufias, Dimitrios A.; Indorato, Rose-Laure; Liger, François; Marquet, Bernardo; Laggner, cristiano; José, Benoît; Kozielski, Frank (1 de marzo de 2008). "Relación estructura-actividad de análogos de S-tritil-l-cisteína como inhibidores de la kinesina mitótica humana Eg5". Revista de Química Medicinal . 51 (5): 1115-1125. doi :10.1021/jm070606z. ISSN  0022-2623. PMID  18266314.
  20. ^ Polishchuk, Pavel G.; Samoylenko, Georgiy V.; Khristova, Tetiana M.; Krysko, Olga L.; Kabanova, Tatiana A.; Kabanov, Vladimir M.; Kornílov, Alexander Yu.; Klimchuk, Olga; Langer, Thierry (8 de octubre de 2015). "Diseño, cribado virtual y síntesis de antagonistas de αIIbβ3 como agentes antiplaquetarios". Revista de Química Medicinal . 58 (19): 7681–7694. doi :10.1021/acs.jmedchem.5b00865. ISSN  0022-2623. PMID  26367138.
  21. ^ Barreca, María Letizia; De Luca, Laura; Iraci, Nunzio; Rao, Ángela; Ferro, Stefanía; Maga, Giovanni; Chimirri, Alba (1 de marzo de 2007). "Identificación de farmacóforos basada en la estructura de nuevos andamios químicos como inhibidores de la transcriptasa inversa no nucleósidos". Revista de información y modelado químico . 47 (2): 557–562. doi :10.1021/ci600320q. ISSN  1549-9596. PMID  17274611.
  22. ^ Langer, Thierry; Bryant, Sharon D (1 de octubre de 2013). "Métodos computacionales para la polifarmacología y perfiles de objetivos de fármacos". Descubrimiento y diseño de fármacos in silico . Serie de libros sobre ciencia del futuro. Future Science Ltd. págs. 178–188. doi :10.4155/ebo.13.417. ISBN 978-1-909453-01-2.
  23. ^ Deyon-Jung, Laurence; Morice, Christophe; Chéry, Florencia; Gay, Julie; Langer, Thierry; Frantz, Marie-Céline; Rozot, Roger; Dalko-Csiba, María (16 de marzo de 2016). "Detección in silico basada en farmacóforos de fragmentos: un enfoque poderoso para el descubrimiento eficiente de clientes potenciales". Medicina. Química. Comunitario . 7 (3): 506–511. doi :10.1039/c5md00444f. ISSN  2040-2511.
  24. ^ Golestaniano, Sahand; Sharifi, Amirhossein; Popowicz, Grzegorz M.; Azizian, Homa; Foroumadi, Alireza; Szwagierczak, Aleksandra; Holak, Tad A.; Amanlou, Massoud (15 de enero de 2016). "Descubrimiento de nuevos inhibidores duales contra las proteínas Mdm2 y Mdmx mediante enfoques in silico y ensayos de unión". Ciencias de la vida . 145 : 240–246. doi :10.1016/j.lfs.2015.12.047. PMID  26746660.
  25. ^ Wei, Yinxiang; Mamá, Yuanfang; Zhao, Qing; Ren, Zhiguang; Li, Yan; Hou, Tingjun; Peng, Hui (1 de agosto de 2012). "Nuevo uso de un fármaco antiguo: inhibición de ABCG2 con sorafenib". Terapéutica molecular del cáncer . 11 (8): 1693-1702. doi : 10.1158/1535-7163.MCT-12-0215 . ISSN  1535-7163. PMID  22593228.
  26. ^ Shirgahi Talari, Faezeh; Bagherzadeh, Kowsar; Golestanian, Sahand; Jarstfer, Michael; Amanlou, Massoud (28 de diciembre de 2015). "Potentes inhibidores de la telomerasa humana: simulaciones dinámicas moleculares, detección virtual basada en múltiples farmacóforos y ensayos bioquímicos". Revista de información y modelado químico . 55 (12): 2596–2610. doi : 10.1021/acs.jcim.5b00336. ISSN  1549-9596. PMID  26529120.
  27. ^ Rakers, Christin; Schumacher, Fabián; Meinl, Walter; Glatt, Hansruedi; Kleuser, Burkhard; Wolber, Gerhard (1 de enero de 2016). "Predicción in silico de la actividad de la sulfotransferasa 1E1 humana guiada por farmacóforos a partir de simulaciones de dinámica molecular". Revista de Química Biológica . 291 (1): 58–71. doi : 10.1074/jbc.M115.685610 . ISSN  0021-9258. PMC 4697188 . PMID  26542807. 
  28. ^ Wieder, Marco; Perricone, Ugo; Boresch, Stefan; Seidel, Thomas; Langer, Thierry (12 de febrero de 2016). "Evaluación de la estabilidad de las características del farmacóforo mediante simulaciones de dinámica molecular". Comunicaciones de investigación bioquímica y biofísica . 470 (3): 685–689. doi :10.1016/j.bbrc.2016.01.081. PMID  26785387.
  29. ^ Malle, E.; Furtmüller, PG; Sattler, W.; Obinger, C. (2007). "Mieloperoxidasa: ¿un objetivo para el desarrollo de nuevos fármacos?". Revista británica de farmacología . 152 (6): 838–854. doi : 10.1038/sj.bjp.0707358. PMC 2078229 . PMID  17592500. 
  30. ^ Barreca, ML; De Luca, L.; Iraki, N.; Rao, A.; Ferro, S.; Magá, G.; Chimirri, A (2007). "Identificación de farmacóforos basada en la estructura de nuevos andamios químicos como inhibidores de la transcriptasa inversa no nucleósidos". J. química. inf. Modelo . 47 (2): 557–562. doi :10.1021/ci600320q. PMID  17274611.
  31. ^ Steindl, TM; Schuster, D.; Wolber, G.; Laggner, C.; Langer, T. (2007). "Modelado de farmacóforos basado en estructuras de alto rendimiento como base para una detección virtual paralela exitosa". J. Mol asistido por computadora. Des . 20 (12): 703–715. doi :10.1007/s10822-006-9066-y. PMID  17009092. S2CID  32857983.
  32. ^ Steindl, TM; Schuster, Laggner; Chuang, K.; Hoffmann, R.; Langer, T. (2007). "Detección paralela y perfiles de actividad con modelos de farmacóforos inhibidores de la proteasa del VIH". J. química. inf. Modelo . 47 (2): 563–571. doi :10.1021/ci600321m. PMID  17381173.
  33. ^ Schuster, D.; Laggner, C.; Steindl, TM; Langer, T. (2006). "Desarrollo y validación de un perfilador in silico P450 basado en modelos farmacóforos". actual. Descubrimiento de drogas. Tecnología . 3 (1): 1–48. doi :10.2174/157016306776637609. PMID  16712462.
  34. ^ Krovat, EM; Fruhwirth, KH; Langer, T. (2005). "Identificación de farmacoforos, cribado in silico y diseño de biblioteca virtual de inhibidores del factor humano Xa". J. química. inf. Modelo . 45 (1): 146-159. doi :10.1021/ci049778k. PMID  15667140.