Gen codificador de proteínas en la especie Homo sapiens
El receptor de glutamato, ionotrópico, kainato 1 , también conocido como GRIK1 , es una proteína que en los humanos está codificada por el gen GRIK1 . [5]
Función
Este gen codifica una de las muchas subunidades del receptor de glutamato ionotrópico (GluR) que funcionan como un canal iónico controlado por ligando . La subunidad GluR específica codificada por este gen es del subtipo receptor de kainato . El ensamblaje del receptor y el tráfico intracelular de los receptores de glutamato ionotrópico están regulados por la edición de ARN y el splicing alternativo . Estos receptores median la neurotransmisión excitatoria y son críticos para la función sináptica normal . Se han descrito dos variantes de transcripción empalmadas alternativamente que codifican diferentes isoformas. Los exones de este gen están intercalados con exones del gen C21orf41, que se transcribe en la misma orientación que este gen pero no parece codificar una proteína. [5]
Interacciones
Se ha demostrado que GRIK1 interactúa con DLG4 , [6] PICK1 [6] y SDCBP . [6]
Edición de ARN
Tipo
La edición de ARN de A a I es catalizada por una familia de adenosina desaminasas que actúan sobre el ARN ( ADAR ) que reconocen específicamente las adenosinas dentro de las regiones bicatenarias de los pre-ARNm y las desaminan en inosina. Las inosinas son reconocidas como guanosina por la maquinaria de traducción de las células. Hay tres miembros de la familia ADAR ADAR 1-3, siendo ADAR1 y ADAR2 los únicos miembros enzimáticamente activos. Se cree que ADAR3 tiene un papel regulador en el cerebro. ADAR1 y ADAR2 se expresan ampliamente en los tejidos, mientras que ADAR3 se restringe al cerebro. Las regiones bicatenarias del ARN se forman por apareamiento de bases entre residuos en la región cercana al sitio de edición, con residuos generalmente en un intrón vecino, pero puede ser una secuencia exónica. La región que se aparea con la región de edición se conoce como secuencia complementaria de edición (ECS). Los ADAR interactúan directamente con el sustrato dsRNA a través de sus dominios de unión de ARN bicatenario. Si se produce un sitio de edición dentro de una secuencia codificante, el resultado podría ser un cambio de codón. Esto puede conducir a la traducción de una isoforma de proteína debido a un cambio en su estructura proteica primaria. Por lo tanto, la edición también puede alterar la función de la proteína. La edición de A a I ocurre en secuencias de ARN no codificantes como intrones, regiones no traducidas (UTR), LINE, SINE (especialmente repeticiones Alu). Se cree que la función de la edición de A a I en estas regiones implica la creación de sitios de empalme y la retención de ARN en el núcleo, entre otros.
Ubicación
El pre-ARNm de GluR-5 se edita en una posición en el sitio Q/R ubicado en la región de membrana 2 (M2). Hay un cambio de codón como resultado de la edición. El cambio de codón es (CAG) glutamina (Q) a (CGG) una arginina (R). [7]
Al igual que GluR-6, el ECS se encuentra aproximadamente 2000 nucleótidos aguas abajo del sitio de edición. [8]
Regulación
La edición del sitio Q/R está regulada por el desarrollo y el tejido. La edición en la médula espinal, el cuerpo calloso y el cerebelo es del 50 %, mientras que la edición en el tálamo, la amígdala y el hipocampo es de aproximadamente el 70 %.
Consecuencias
Estructura
La edición da como resultado un cambio de aminoácido en el segundo dominio de membrana del receptor.
Función
El sitio de edición se encuentra dentro del segundo dominio intracelular. Se cree que la edición afecta la permeabilidad del receptor al CA2+. Se cree que la edición del sitio Q/R reduce la permeabilidad del canal al Ca2+ [7].
La edición de ARN del sitio Q/R puede inhibir el canal por ácidos grasos de membrana como el ácido araquidónico y el ácido docosahexaenoico [9]. En el caso de los receptores de kainato con solo isoformas editadas, estos ácidos grasos los inhiben fuertemente. Sin embargo, la inclusión de solo una subunidad no editada es suficiente para detener esta inhibición. [9]
Véase también
Referencias
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Lectura adicional
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Enlaces externos
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