Un gen anidado es un gen cuya secuencia codificante completa se encuentra dentro de los límites (entre el codón de inicio y el codón de terminación ) de un gen externo más grande. La secuencia codificante de un gen anidado difiere en gran medida de la secuencia codificante de su gen huésped externo. Por lo general, los genes anidados y sus genes huéspedes codifican proteínas funcionalmente no relacionadas y tienen diferentes patrones de expresión en un organismo.
Hay dos categorías de genes anidados:
Un gen intrónico anidado se encuentra dentro de la región intrónica no codificante de un gen más grande y se presenta con relativa frecuencia, especialmente en los intrones de los metazoos y los eucariotas superiores . Debido a que solo el ADN eucariota contiene regiones intrónicas, este tipo de gen no se presenta en bacterias o arqueas . [1]
El genoma humano contiene una proporción relativamente alta de genes intrónicos anidados. Se prevé que contenga al menos 158 genes intrónicos anidados funcionales, con 212 pseudogenes adicionales y tres genes snoRNA anidados en regiones intrónicas. Estos genes parecen estar distribuidos aleatoriamente en todos los cromosomas , y la mayoría codifica proteínas que no están funcionalmente relacionadas con sus genes hospedadores. [2] [1]
Los genes anidados opuestos a las secuencias codificantes de sus genes hospedadores son muy raros y se han observado en procariotas y, más recientemente, en levaduras ( S. cerevisiae ) y en Tetrahymena thermophila . Estos genes anidados no intrónicos aún no se han identificado en los genomas de los metazoos . Al igual que con los genes anidados intrónicos, los genes anidados no intrónicos normalmente no comparten funciones ni patrones de expresión con sus genes hospedadores. [1]