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Rab (proteína G)

La familia de proteínas Rab es un miembro de la superfamilia Ras de proteínas G pequeñas . [1] Se han identificado aproximadamente 70 tipos de Rab en humanos . [2] Las proteínas Rab generalmente poseen un pliegue GTPasa , que consiste en una lámina beta de seis hebras flanqueada por cinco hélices alfa . [3] Las GTPasas Rab regulan muchos pasos del tráfico de membrana, incluida la formación de vesículas, el movimiento de vesículas a lo largo de las redes de actina y tubulina y la fusión de membranas. Estos procesos conforman la ruta a través de la cual las proteínas de la superficie celular se trafican desde el Golgi hasta la membrana plasmática y se reciclan. El reciclaje de proteínas de superficie devuelve proteínas a la superficie cuya función implica transportar otra proteína o sustancia dentro de la célula, como el receptor de transferrina, o sirve como medio para regular la cantidad de un cierto tipo de moléculas de proteína en la superficie.

Función

Los cuatro pasos del transporte de vesículas de proteína Rab (enumerados en el texto)

Las proteínas Rab son proteínas de membrana periféricas , ancladas a una membrana a través de un grupo lipídico unido covalentemente a un aminoácido. Específicamente, las Rab están ancladas a través de grupos prenil en dos cisteínas en el extremo C. Las proteínas de escolta de Rab (REP) entregan Rab recién sintetizado y prenilado a su membrana de destino uniéndose a los grupos prenil hidrofóbicos e insolubles y transportando Rab a través del citoplasma. Los grupos prenil lipídicos pueden luego insertarse en la membrana, anclando Rab en la cara citoplasmática de una vesícula o la membrana plasmática. Debido a que las proteínas Rab están ancladas a la membrana a través de una región C-terminal flexible, se las puede considerar como un "globo en una cuerda".

Las Rab cambian entre dos conformaciones, una forma inactiva unida a GDP (guanosina difosfato) y una forma activa unida a GTP (guanosina trifosfato). Un factor de intercambio de nucleótidos de guanina (GEF) cataliza la conversión de la forma unida a GDP a la forma unida a GTP, activando así las Rab. La hidrólisis inherente de GTP de las Rab puede ser mejorada por una proteína activadora de GTPasa (GAP) que conduce a la inactivación de las Rab. Las REP llevan solo la forma unida a GDP de las Rab, y los efectores de Rab, proteínas con las que interactúa Rab y a través de las cuales funciona, solo se unen a la forma unida a GTP de las Rab. Los efectores de Rab son muy heterogéneos y cada isoforma de Rab tiene muchos efectores a través de los cuales lleva a cabo múltiples funciones. La unión específica del efector a la proteína Rab permite que la proteína Rab sea efectiva y, a la inversa, el cambio de conformación de la proteína Rab al estado inactivo conduce a la disociación del efector de la proteína Rab. [4]

Las proteínas efectoras tienen una de cuatro funciones diferentes.

  1. Desbroce, selección y recubrimiento de carga
  2. Transporte de vesículas
  3. Desprendimiento y fijación de vesículas
  4. Fusión de vesículas [4]

Después de la fusión de la membrana y la disociación del efector, la Rab se recicla de nuevo a su membrana de origen. Un inhibidor de la disociación del GDP (GDI) se une a los grupos prenil de la forma inactiva de la Rab unida al GDP, inhibe el intercambio de GDP por GTP (que reactivaría la Rab) y lleva la Rab a su membrana original.

Importancia clínica

Las proteínas Rab y sus funciones son esenciales para el correcto funcionamiento de los orgánulos y, como tal, cuando se introduce cualquier desviación en el ciclo de la proteína Rab, se producen estados de enfermedad fisiológica. [5]

Coroideremia

La coroideremia es causada por una mutación de pérdida de función en el gen CHM que codifica la proteína de escolta Rab (REP-1). Tanto REP-1 como REP-2 (una proteína similar a REP-1) ayudan con la prenilación y el transporte de las proteínas Rab. [6] Se ha descubierto que Rab27 depende preferentemente de REP-1 para la prenilación, lo que podría ser la causa subyacente de la coroideremia. [7]

Discapacidad intelectual

Se ha demostrado que las mutaciones en el gen GDI1 , que codifica un inhibidor de la disociación del nucleótido de guanosina, conducen a una discapacidad intelectual no específica ligada al cromosoma X. En un estudio realizado en ratones, los portadores de una deleción del gen GDI1 han mostrado marcadas anomalías en la formación de la memoria a corto plazo y los patrones de interacción social. Se observa que los patrones sociales y de comportamiento exhibidos en ratones que son portadores de la proteína GDI1 son similares a los observados en humanos con la misma deleción. Se ha demostrado a través de extractos cerebrales de los ratones mutantes que la pérdida del gen GDI1 conduce a la acumulación de las proteínas Rab4 y Rab5, inhibiendo así su función. [4]

Cáncer/carcinogénesis

La evidencia muestra que la sobreexpresión de las GTPasas Rab tiene una relación sorprendente con la carcinogénesis , como en el cáncer de próstata. [8] [9] Hay muchos mecanismos por los cuales se ha demostrado que la disfunción de la proteína Rab causa cáncer. Por nombrar algunos, la expresión elevada de la proteína oncogénica Rab1, junto con las proteínas Rab1A, promueven el crecimiento de tumores, a menudo con un mal pronóstico. La sobreexpresión de Rab23 se ha relacionado con el cáncer gástrico . Además de causar cáncer directamente, la desregulación de las proteínas Rab también se ha relacionado con la progresión de tumores ya existentes y contribuye a su malignidad. [5]

Enfermedad de Parkinson

Las mutaciones de la proteína Rab39b se han relacionado con la discapacidad intelectual ligada al cromosoma X y también con una forma rara de la enfermedad de Parkinson . [10]

Tipos de proteínas Rab

Hasta el momento se han identificado aproximadamente 70 Rabs diferentes en humanos. [2] La mayoría de ellos están involucrados en el tráfico de vesículas. Su complejidad se puede entender si se piensa en ellos como etiquetas de dirección para el tráfico de vesículas, que definen la identidad y la ruta de las vesículas. Entre paréntesis se muestran los nombres equivalentes en los organismos modelo Saccharomyces cerevisiae [11] y Aspergillus nidulans . [12]

Otras proteínas Rab

Referencias

  1. ^ Stenmark H, Olkkonen VM (2001). "La familia Rab GTPasa". Genome Biology . 2 (5): REVIEWS3007. doi : 10.1186/gb-2001-2-5-reviews3007 . PMC  138937 . PMID  11387043.
  2. ^ ab Seto, Shintaro; Tsujimura, Kunio; Horii, Toshinobu; Koide, Yukio (1 de enero de 2014), Hayat, MA (ed.), "Capítulo 10: Supervivencia micobacteriana en macrófagos alveolares como resultado de la inhibición de la formación de autofagosomas por la coronina-1a", Autofagia: cáncer, otras patologías, inflamación, inmunidad, infección y envejecimiento , Ámsterdam: Academic Press, págs. 161-170, doi :10.1016/b978-0-12-405877-4.00010-x, ISBN 978-0-12-405877-4, consultado el 19 de noviembre de 2020
  3. ^ Hutagalung AH, Novick PJ (enero de 2011). "El papel de las GTPasas Rab en el tráfico de membranas y la fisiología celular". Physiological Reviews . 91 (1): 119–49. doi :10.1152/physrev.00059.2009. PMC 3710122 . PMID  21248164. 
  4. ^ abc Seabra MC, Mules EH, Hume AN ​​(enero de 2002). "GTPasas de Rab, tráfico intracelular y enfermedad". Tendencias en medicina molecular . 8 (1): 23–30. doi :10.1016/s1471-4914(01)02227-4. PMID  11796263.
  5. ^ ab Tzeng HT, Wang YC (octubre de 2016). "Tráfico de vesículas mediado por Rab en el cáncer". Revista de Ciencias Biomédicas . 23 (1): 70. doi : 10.1186/s12929-016-0287-7 . PMC 5053131 . PMID  27716280. 
  6. ^ Cremers FP, Armstrong SA, Seabra MC, Brown MS, Goldstein JL (enero de 1994). "REP-2, una proteína de escolta de Rab codificada por el gen similar a la coroideremia". The Journal of Biological Chemistry . 269 (3): 2111–7. doi : 10.1016/S0021-9258(17)42142-9 . PMID  8294464.
  7. ^ Seabra MC, Ho YK, Anant JS (13 de octubre de 1995). "Geranilgeranilación deficiente de Ram/Rab27 en coroideremia". The Journal of Biological Chemistry . 270 (41): 24420–24427. doi : 10.1074/jbc.270.41.24420 . PMID  7592656.
  8. ^ Johnson IR, Parkinson-Lawrence EJ, Shandala T, Weigert R, Butler LM, Brooks DA (diciembre de 2014). "La biogénesis endosómica alterada en el cáncer de próstata tiene potencial como biomarcador". Molecular Cancer Research . 12 (12): 1851–62. doi :10.1158/1541-7786.MCR-14-0074. PMC 4757910 . PMID  25080433. 
  9. ^ Johnson IR, Parkinson-Lawrence EJ, Keegan H, Spillane CD, Barry-O'Crowley J, Watson WR, et al. (noviembre de 2015). "Expresión génica endosómica: ¿un nuevo indicador para el pronóstico de pacientes con cáncer de próstata?". Oncotarget . 6 (35): 37919–29. doi :10.18632/oncotarget.6114. PMC 4741974 . PMID  26473288. 
  10. ^ Lesage S, Bras J, Cormier-Dequaire F, Condroyer C, Nicolas A, Darwent L, Guerreiro R, Majounie E, Federoff M, Heutink P, Wood NW, Gasser T, Hardy J, Tison F, Singleton A, Brice A (junio de 2015). "Las mutaciones de pérdida de función en RAB39B se asocian con la enfermedad de Parkinson de aparición temprana típica". Neurología. Genética . 1 (1): e9. doi :10.1212/NXG.0000000000000009. PMC 4821081. PMID  27066548 . 
  11. ^ "Base de datos del genoma de Saccharomyces (SGD)". Yeast Genome Org . Universidad de Stanford.
  12. ^ "Base de datos del genoma del Aspergillus (AspGD)". Universidad de Stanford.
  13. ^ Kessler D, Gruen GC, Heider D, Morgner J, Reis H, Schmid KW, Jendrossek V (2012). "La acción de las pequeñas GTPasas Rab11 y Rab25 en el tráfico de vesículas durante la migración celular". Fisiología celular y bioquímica . 29 (5–6): 647–56. doi : 10.1159/000295249 . PMID  22613965.

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