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Espectroscopia de coherencia cuántica única heteronuclear

El experimento de coherencia cuántica única heteronuclear o de correlación cuántica única heteronuclear , normalmente abreviado como HSQC , se utiliza con frecuencia en espectroscopia de RMN de moléculas orgánicas y es de particular importancia en el campo de la RMN de proteínas . El experimento fue descrito por primera vez por Geoffrey Bodenhausen y DJ Ruben en 1980. [1] El espectro resultante es bidimensional (2D) con un eje para el protón ( 1 H) y el otro para un heteronúcleo (un núcleo atómico distinto de un protón). ), que suele ser 13 C o 15 N . El espectro contiene un pico para cada protón único unido al heteronúcleo que se está considerando. El HSQC 2D también se puede combinar con otros experimentos de RMN de dimensiones superiores, como NOESY-HSQC o TOCSY-HSQC.

Esquema general

El experimento HSQC es un experimento de RMN 2D altamente sensible y se describió por primera vez en un sistema de 1 H — 15 N, pero también es aplicable a otros núcleos como 1 H— 13 C y 1 H— 31 P. El esquema básico de este El experimento implica la transferencia de magnetización del protón al segundo núcleo, que puede ser 15 N, 13 C o 31 P, mediante un paso INEPT (núcleos insensibles mejorados por transferencia de polarización). Después de un retraso de tiempo ( t 1 ), la magnetización se transfiere de nuevo al protón mediante un paso retro-INEPT y luego se registra la señal. En HSQC, se registra una serie de experimentos en los que se incrementa el retardo de tiempo t 1 . La señal de 1 H se detecta en la dimensión medida directamente en cada experimento, mientras que el desplazamiento químico de 15 N o 13 C se registra en la dimensión indirecta que se forma a partir de la serie de experimentos.

HSQC en proteína RMN

1 H— 15 N HSQC

Esquema de polarización HSQC 1 H – 15 N para una proteína/aminoácido.
Espectro HSQC 1 H – 15 N de un fragmento de una proteína NleG3-2 marcada isotópicamente. Cada pico en el espectro representa un par de NH enlazado, con sus dos coordenadas correspondientes a los desplazamientos químicos de cada uno de los átomos de H y N. [2]

El experimento 15 N HSQC es uno de los experimentos registrados con más frecuencia en RMN de proteínas. El experimento HSQC se puede realizar utilizando la abundancia natural del isótopo 15 N , pero normalmente para la RMN de proteínas se utilizan proteínas marcadas isotópicamente. Estas proteínas marcadas normalmente se producen expresando la proteína en células cultivadas en medios marcados con 15 N.

Cada residuo de la proteína , con excepción de la prolina , tiene un protón de amida unido a un nitrógeno en el enlace peptídico . El HSQC proporciona la correlación entre el protón de nitrógeno y amida, y cada amida produce un pico en los espectros de HSQC. Por lo tanto, cada residuo (excepto la prolina) puede producir un pico observable en los espectros, aunque en la práctica no siempre se ven todos los picos debido a una serie de factores. Normalmente, el residuo N-terminal (que tiene un grupo NH 3 + unido) no es fácilmente observable debido al intercambio con el disolvente. [3] Además de las resonancias de amida de la columna vertebral, las cadenas laterales con protones unidos a nitrógeno también producirán picos.

En un espectro HSQC típico, los picos de NH 2 de las cadenas laterales de asparagina y glutamina aparecen como dobletes en la esquina superior derecha, y puede aparecer un pico más pequeño encima de cada pico debido al intercambio de deuterio del D 2 O normalmente añadido a un Muestra de RMN, lo que da a estos picos de cadena lateral una apariencia distintiva. Los picos de amina de cadena lateral del triptófano generalmente se desplazan hacia abajo y aparecen cerca de la esquina inferior izquierda. Los picos de amida principal de la glicina normalmente aparecen cerca de la parte superior del espectro.

El HSQC 15 N es normalmente el primer espectro heteronuclear adquirido para la asignación de resonancias donde cada pico de amida se asigna a un residuo particular en la proteína. Si la proteína está plegada, los picos suelen estar bien dispersos y se pueden distinguir la mayoría de los picos individuales. Si hay un gran grupo de picos muy superpuestos alrededor de la mitad del espectro, eso indicaría la presencia de elementos no estructurados significativos en la proteína. En los casos en los que existe una superposición importante de resonancias, la asignación de resonancias en los espectros puede resultar difícil. La asignación del espectro HSQC requiere otros experimentos, idealmente utilizando experimentos de resonancia triple con proteínas marcadas con 15 N y 13 C, que proporcionan conectividades secuenciales entre residuos para que las resonancias puedan vincularse a residuos particulares y asignarse secuencialmente. La asignación del espectro es esencial para una interpretación significativa de experimentos de RMN más avanzados, como la determinación de estructuras y el análisis de relajación .

Los productos químicos marcados con el isótopo 15 N son relativamente económicos y el HSQC 15 N es un experimento sensible mediante el cual se puede adquirir un espectro en un tiempo relativamente corto; por lo tanto, el HSQC 15 N se utiliza a menudo para seleccionar candidatos para determinar su idoneidad para la determinación de la estructura mediante RMN. , así como la optimización de las condiciones de la muestra. El proceso de determinación de la estructura, que requiere mucho tiempo, generalmente no se lleva a cabo hasta que se pueda obtener un buen espectro HSQC. El experimento HSQC también es útil para detectar la interfaz de unión en la interacción proteína-proteína, así como las interacciones con ligandos como los fármacos. Al comparar el HSQC de la proteína libre con la unida al ligando, se pueden observar cambios en los cambios químicos de algunos picos, y es probable que estos picos se encuentren en la superficie de unión donde la unión perturbó sus cambios químicos. [4] El 15 N HSQC también se puede utilizar en análisis de relajación en los estudios de dinámica molecular de proteínas, la determinación de la constante de ionización y otros estudios.

1 H— 13 C HSQC

Este experimento proporciona correlaciones entre un carbono y sus protones unidos. La versión de tiempo constante (CT) de 1 H— 13 C HSQC se utiliza normalmente porque evita el problema de la división de la señal debido a los acoplamientos homonucleares de 13 C— 13 C J que reducen la resolución espectral. [5] El "tiempo constante" se refiere al período de evolución completo entre los dos pasos de INEPT que se mantiene constante en este experimento. Si este período de evolución se establece como el inverso de la constante de acoplamiento J , entonces el signo de la magnetización de aquellos carbonos con un número impar de carbonos alifáticos unidos será opuesto al de aquellos con un número par. Por ejemplo, si el C β de la leucina aparece como un pico positivo (2 carbonos alifáticos unidos), entonces el C γ (3 carbonos alifáticos unidos) y el C α (1 carbono alifático unidos) aparecerían negativos.

HSQC en RMN de lípidos

1 H— 31 P HSQC

El uso de 1 H— 31 P HSQC es relativamente poco común en lipidómica; sin embargo, el uso de 31 P en lipidómica se remonta a la década de 1990. [6] El uso de esta técnica es limitado con respecto a la espectrometría de masas debido a que requiere un tamaño de muestra mucho mayor; sin embargo, la combinación de 1 H — 31 P HSQC con espectrometría de masas se considera un enfoque completo de la lipidómica y las técnicas para ' La espectroscopia dual está cada vez más disponible. [7]

Ver también

Referencias

  1. ^ Bodenhausen, G.; Rubén, DJ (1980). "RMN de nitrógeno-15 de abundancia natural mediante espectroscopia heteronuclear mejorada". Letras de Física Química . 69 (1): 185–189. Código Bib : 1980CPL....69..185B. doi :10.1016/0009-2614(80)80041-8. S2CID  96730420.
  2. ^ Wu, contenedor; Skarina, Tatiana, Yee, Adelinda, Jobin, Marie-Claude, DiLeo, Rosa, Semesi, Anthony, Fares, Christophe, Lemak, Alexander, Coombes, Brian K., Arrowsmith, Cheryl H., Singer, Alexander U., Savchenko, Alexei, Stebbins, C. Erec (junio de 2010). "Los efectores NleG tipo 3 de Escherichia coli enterohemorrágica son ligasas de ubiquitina U-Box E3". Más patógenos . 6 (6): e1000960. doi : 10.1371/journal.ppat.1000960 . PMC 2891834 . PMID  20585566. {{cite journal}}: Mantenimiento CS1: varios nombres: lista de autores ( enlace )
  3. ^ Steven M. Pascal (2008). Manual de RMN: un enfoque basado en HSQC con animaciones vectoriales. Publicaciones IM LLP. págs. 29-31. ISBN 978-1901019087.
  4. ^ Williamson, Mike P. (1 de agosto de 2013). "Uso de la perturbación por desplazamiento químico para caracterizar la unión del ligando". Avances en espectroscopia de resonancia magnética nuclear . 73 : 1–16. doi :10.1016/j.pnmrs.2013.02.001. ISSN  0079-6565. PMID  23962882.
  5. ^ Geerten W. Vuister; Anuncio Bax (1992). "Mejora de la resolución y edición espectral de proteínas enriquecidas uniformemente con 13C mediante desacoplamiento homonuclear de 13C de banda ancha" (PDF) . Revista de Resonancia Magnética . 98 (2): 428–435. Código Bib : 1992JMagR..98..428V. doi :10.1016/0022-2364(92)90144-v.
  6. ^ Bosco, M.; Culeddu, N.; Toffanin, R.; Pollesello, P. (1997). "Sistemas de disolventes orgánicos para el análisis de resonancia magnética nuclear 31P de fosfolípidos de lecitina: aplicaciones a experimentos de coherencia cuántica múltiple heteronuclear detectada con gradiente bidimensional mejorado". Bioquímica Analítica . 245 (1): 38–47. doi :10.1006/abio.1996.9907. PMID  9025966.
  7. ^ Furse, Samuel; Fernández-Twinn, Denise; Jenkins, Benjamín; Manso, Claire L.; Williams, Huw E.; Smith, Gordon CS; Charnock-Jones, D. Stephen; Ozanne Susan, E.; Koulman, Albert (2020). "Una plataforma de alto rendimiento para el análisis lipidómico detallado de una variedad de tejidos humanos y de ratón". Química Analítica y Bioanalítica . 412 (12): 2851–2862. doi : 10.1007/s00216-020-02511-0 . PMC 7196091 . PMID  32144454. 

Referencias generales

enlaces externos