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Haplogrupo D-CTS3946

El haplogrupo D , también conocido como D-CTS3946 , es un haplogrupo del cromosoma Y. Al igual que su pariente lejano, el haplogrupo E-M96 , D-CTS3946 tiene el polimorfismo de evento único YAP+ , que define a su progenitor, el haplogrupo DE . D-CTS3946 tiene dos ramas basales, D1 y D2 . D1 y D2 se encuentran principalmente en Asia oriental , con baja frecuencia en Asia central y el sudeste asiático , y con muy baja frecuencia en África occidental y Asia occidental .

Orígenes

Propuesta de migración del haplogrupo D según Haber et al. (2019)

El haplogrupo D era anteriormente el nombre del linaje D-M174 . Existen diversas propuestas con respecto al origen del haplogrupo DE , el progenitor de D, y algunas sugieren un origen africano [2] y otras un origen asiático. [3] Pero se suponía, y en general se supone, que D-M174 es de origen asiático y se encuentra exclusivamente en Asia.

Haber et al. (2019) identificaron un haplogrupo, denominado "D0", en tres nigerianos. Definido por el SNP A5580.2, el haplogrupo "D0" está fuera de M174, pero pertenece al linaje D, comparte 7 SNP con él D-M174 de los que carece E, y se determinó que divergió temprano de la rama D (cerca de la división D/E). Haber et al. (2019) consideraron varias posibilidades, incluido un origen africano y un origen asiático para el haplogrupo, pero en parte debido al enraizamiento profundo del haplogrupo "D0", así como a los tiempos de divergencia temprana calculados recientemente para él y su haplogrupo padre, DE, los autores concluyen a favor de un origen africano para D0 y DE, así como para el ancestro común (ahora conocido como D-CTS3946 o "D") de D0 y D-M174. Según Haber et al. (2019), D0 es una rama del linaje DE cerca de la división D/E pero en la rama D, divergiendo hace unos 71.000 años. Los autores encuentran tiempos de divergencia para DE*, E y D0, todos probablemente dentro de un período de unos 76.000-71.000 años atrás, y una fecha probable para la salida de los ancestros de los euroasiáticos modernos de África (y la consiguiente mezcla con neandertales) más tarde, alrededor de hace 50.300-59.400 años, lo que, según sostienen, también respalda un origen africano para esos haplogrupos. [1] Por lo tanto, se propone que D-CTS3946 se extendió tanto dentro como fuera de África: con una rama que divergió en D0 en África, y otra rama que salió de África finalmente divergió en D-M174 (es decir, con la mutación M174 que surgió más tarde del D-CTS3946 que se había extendido a Asia).

Hallast et al. (2020), sobre haplogrupos antiguos y modernos utilizando un análisis filogenético de las secuencias de los haplogrupos C, D y FT, incluidos linajes de raíces profundas muy raros (como D0/D2 muestreados por Haber et al. 2019), sostiene, teniendo en cuenta el "raro D0 de raíces profundas", que las divisiones iniciales dentro del haplogrupo CT (antepasado de DE) ocurrieron en África. También sostienen que los análisis filogeográficos de los cromosomas Y no africanos antiguos y actuales, todos apuntan al este/sudeste asiático como el origen hace 55.000-50.000 años de todos los linajes masculinos no africanos supervivientes conocidos (aparte de los migrantes recientes) poco después de una migración inicial hace 70-55.000 años desde África del haplogrupo basal D y otros linajes y basales. Los autores sostienen que estos linajes se expandieron rápidamente por Eurasia, se diversificaron más tarde en el sudeste asiático y luego se expandieron hacia el oeste hace unos 55-50.000 años, reemplazando a otros linajes locales dentro de Eurasia, y concluyen que el haplogrupo D (como D-M174) experimentó luego expansiones rápidas dentro de las poblaciones euroasiáticas orientales y consta de 5 ramas diferentes que se formaron hace unos 45.000 años. Encuentran que estos haplogrupos actualmente tienen su mayor diversidad en Eurasia oriental (este/sudeste asiático). Se encontró que las poblaciones tibetano-birmanas del este y sudeste asiático tenían la mayor cantidad de diversidad. [4]

Distribución

Frecuencia del haplogrupo D del gen Y

Otras tres muestras de D2 también fueron encontradas (también en 2019) por FTDNA: dos en Al Wajh en la costa oeste de Arabia Saudita [5] [6] y otra en un sirio (él es D2b-FT51782). [7] [5] También se encontró una muestra de D2b-FT51782 en al-Qirbi de Bayda [8] en Yemen que resultó estar varios miles de años relacionada con la del sirio. [7] Hay otra persona (apellido desconocido) en la vecina Gobernación de Shabwah con TMRCA hace 1700 años con la primera. [9] En 2020, Michael Sager de FTDNA anunció que se había encontrado otra muestra en un afroamericano [10] y una en otro afroamericano. [10] [11] Las muestras encontradas en el descendiente sirio y en uno de los afroamericanos son hasta la fecha las muestras más basales de D2. [10] [5] [6] [11] La otra muestra afroamericana comparte una rama con los tres nigerianos. [10] La evidencia reciente (como también propusieron Haber et al.) sugiere que D2 es un haplogrupo altamente divergente cerca de la división DE pero en la rama D y que carece de la mutación M174 que poseen los otros linajes D conocidos (que pertenecen a su hermano D-M174). [5]

Subclados

D1

El haplogrupo D1 es un subclado del haplogrupo D-CTS3946.

D2

El haplogrupo D2 es un subclado del Paleolítico superior del haplogrupo D-CTS3946. D0 ha sido renombrado D2 y D-M174 ha sido renombrado D1 debido a este descubrimiento. [5] [6]

Árboles filogenéticos

ISOGG (versión: 14.151). [12]

Referencias

  1. ^ abc Haber M, Jones AL, Connell BA, Arciero E, Yang H, Thomas MG, et al. (agosto de 2019). "Un haplogrupo del cromosoma Y africano D0 poco común y de raíces profundas y sus implicaciones para la expansión de los humanos modernos fuera de África". Genética . 212 (4): 1421–1428. doi : 10.1534/genetics.119.302368 . PMC 6707464 . PMID  31196864. 
  2. ^ Underhill PA, Kivisild T (2007). "Uso del cromosoma Y y la estructura de la población de ADN mitocondrial para rastrear las migraciones humanas". Revisión anual de genética . 41 : 539–64. doi :10.1146/annurev.genet.41.110306.130407. PMID  18076332.
  3. ^ Cabrera VM (2017). "Los portadores de linajes básicos del macrohaplogrupo L3 del ADN mitocondrial migraron de regreso a África desde Asia hace unos 70.000 años". bioRxiv 10.1101/233502 . 
  4. ^ Hallast P, Agdzhoyan A, Balanovsky O, Xue Y, Tyler-Smith C (febrero de 2021). "Un origen en el sudeste asiático para los cromosomas Y humanos no africanos actuales". Genética humana . 140 (2): 299–307. doi :10.1007/s00439-020-02204-9. PMC 7864842 . PMID  32666166. Teniendo en cuenta un linaje D0 africano poco común y el marco temporal resumido anteriormente, hemos argumentado (Haber et al. 2019) que es probable que las divisiones iniciales dentro de CT hayan ocurrido en África antes de la salida, y que tres linajes, C, D y FT, fueron llevados a cabo por los antepasados ​​de los no africanos actuales. Cada uno de estos tres linajes se expandió posteriormente: C y D moderadamente, y FT masivamente". También (de antes en el estudio): "Los genomas de los humanos actuales fuera de África se originaron casi en su totalidad a partir de una única migración de salida hace ~ 50.000-70.000 años, seguida de una mezcla con los neandertales contribuyendo ~ 2% de todos los no africanos. Sin embargo, los detalles de esta migración inicial siguen siendo poco conocidos porque no hay análisis de ADN antiguo disponibles de este período de tiempo clave, y la interpretación de los datos autosómicos actuales es complicada debido a los movimientos/reestructuraciones de la población posteriores. Sin embargo, un locus conserva información específica masculina de este período temprano: el cromosoma Y, donde se ha construido una filogenia calibrada detallada. Tres linajes Y actuales fueron transportados por la migración inicial: el raro haplogrupo D, el moderadamente raro C y el muy común linaje FT que ahora domina la mayoría de las poblaciones no africanas.  Este artículo incorpora texto de esta fuente, que está disponible bajo la licencia CC BY 4.0.
  5. ^ abcde Estes, Roberta (21 de junio de 2019). "¡Nuevos y emocionantes descubrimientos sobre el haplogrupo D del ADN Y!". DNAeXplained – Genealogía genética . Consultado el 6 de julio de 2019 .
  6. ^ abc "Imagen".
  7. ^ ab "FamilyTreeDNA – Proyecto Haplogrupo Y-ADN D".
  8. ^ "Árbol D Y".
  9. ^ "D-Y330435 YTree". Archivado desde el original el 1 de mayo de 2023.
  10. ^ abcd Sager, Michael (febrero de 2020). El árbol de la humanidad de FTDNA (Mike Sager).
  11. ^ ab Estes, Roberta (10 de diciembre de 2020). "Nuevos descubrimientos arrojan luz sobre la teoría de la salida de África y más allá". DNAeXplained – Genealogía genética .
  12. ^ ab Haplogrupo D del ADN-Y y sus subclados – 2019
  13. ^ abc Hammer MF, Karafet TM, Park H et al. (2006). "Orígenes duales de los japoneses: puntos en común para los cromosomas Y de los cazadores-recolectores y los agricultores". J. Hum. Genet. 51 (1): 47–58. doi:10.1007/s10038-005-0322-0. PMID  16328082.
  14. ^ "D YTree". www.yfull.com . Consultado el 3 de septiembre de 2019 .
  15. ^ Haplogrupo D del ADN-Y y sus subclados – 2014