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DPNA

DPANN es un superfilo de Archaea propuesto por primera vez en 2013. [2] Muchos miembros muestran signos novedosos de transferencia horizontal de genes desde otros dominios de la vida . [2] Se les conoce como nanoarqueas o arqueas ultrapequeñas debido a su tamaño más pequeño (nanometrico) en comparación con otras arqueas.

DPANN es un acrónimo formado por las iniciales de los primeros cinco grupos descubiertos, Diapherotrites , Parvarchaeota , Aenigmarchaeota , Nanoarchaeota y Nanohaloarchaeota . Posteriormente se descubrieron y propusieron dentro del superfilo DPANN Woesearchaeota y Pacearchaeota . [3] En 2017, otro filo Altiarchaeota se colocó en este superfilo. [4] La monofilia de DPANN aún no se considera establecida, debido a la alta tasa de mutación de los filos incluidos, lo que puede dar lugar al artefacto de la atracción de ramas largas (LBA) donde los linajes se agrupan basalmente o artificialmente en la base del árbol filogenético sin estar relacionados. [5] [6] Estos análisis en cambio sugieren que DPANN pertenece a Euryarchaeota o es polifilético ocupando varias posiciones dentro de Euryarchaeota. [5] [6] [7]

El DPANN agrupa diferentes filos con una variedad de distribución ambiental y metabolismo, que van desde formas simbióticas y termófilas como Nanoarchaeota , acidófilas como Parvarchaeota y no extremófilas como Aenigmarchaeota y Diapherotrites . DPANN también se detectó en aguas subterráneas ricas en nitratos , en la superficie del agua pero no debajo, lo que indica que estos taxones aún son bastante difíciles de localizar. [8]

Desde el reconocimiento del rango de reino por la ICNP , el nombre propuesto para este grupo es reino Nanobdellati . [9]

Características

Se caracterizan por ser de pequeño tamaño en comparación con otras arqueas (tamaño nanométrico) y en consonancia con su pequeño genoma , tienen capacidades catabólicas limitadas pero suficientes para llevar una vida libre, aunque se piensa que muchas son episimbiontes que dependen de una asociación simbiótica o parasitaria con otros organismos. Muchas de sus características son similares o análogas a las de las bacterias ultrapequeñas (grupo CPR). [3]

Las capacidades metabólicas limitadas son un producto del pequeño genoma y se reflejan en el hecho de que muchos carecen de vías biosintéticas centrales para nucleótidos , aminoácidos y lípidos ; de ahí la mayoría de las arqueas DPANN, como las arqueas ARMAN , que dependen de otros microbios para satisfacer sus necesidades biológicas. Pero aquellos que tienen el potencial de vivir libremente son heterótrofos fermentativos y aeróbicos . [3]

Son en su mayoría anaeróbicos y no han sido cultivados. Viven en ambientes extremos como termófilos, hiperacidofílicos, hiperhalofílicos o resistentes a los metales; o también en el ambiente templado de sedimentos marinos y lacustres . Rara vez se encuentran en el suelo o en mar abierto. [3]

Clasificación

Filogenia

Taxonomía

La taxonomía actualmente aceptada se basa en la Lista de nombres procariotas con relevancia en la nomenclatura (LPSN) [23] y el Centro Nacional para la Información Biotecnológica (NCBI). [24]

Superfilo "DPANN" Rinke et al. 2013 (= reino propuesto Nanobdellati Rinke, Schwientek, Sczyrba, Ivanova, Anderson, Cheng, Darling, Malfatti, Swan, Gies, Dodsworth, Hedlund, Tsiamis, Sievert, Liu, Eisen, Hallam, Kyrpides, Stepanauskas, Rubin, Hugenholtz y Woyke 2024 [28] )

Véase también

Referencias

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  2. ^ ab Rinke C, Schwientek P, Sczyrba A, Ivanova NN, Anderson IJ, Cheng JF, Darling A, Malfatti S, Swan BK, Gies EA, Dodsworth JA, Hedlund BP, Tsiamis G, Sievert SM, Liu WT, Eisen JA, Hallam SJ, Kyrpides NC, Stepanauskas R, Rubin EM, Hugenholtz P, Woyke T (julio de 2013). "Información sobre la filogenia y el potencial de codificación de la materia oscura microbiana" (PDF) . Nature . 499 (7459): 431–437. Bibcode :2013Natur.499..431R. doi : 10.1038/nature12352 . PMID  23851394. S2CID  4394530.
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