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Nanoarqueotas

Nanoarchaeota (del griego, "enano o diminuto antiguo") es un filo propuesto ( Candidatus Nanoarchaeota) en el dominio Archaea [1] que actualmente tiene un solo representante, Nanoarchaeum equitans , que fue descubierto en un respiradero hidrotermal submarino y descrito por primera vez en 2002. [2]

Taxonomía

Los miembros de Nanoarchaeota están asociados con diferentes organismos hospedadores y condiciones ambientales. [3] A pesar de su pequeño tamaño, un genoma reducido y una respiración limitada, los miembros de Nanoarchaeota tienen características metabólicas inusuales. Por ejemplo, N. equitans tiene un sistema de comunicación intercelular complejo y altamente desarrollado. [4]

La filogenia de Nanoarchaeota está anclada en su único representante cultivado, Nanoarchaeum equitans , que se agrupa en un grupo evolutivo separado de otras arqueas, [5] [6] que han sido reclasificadas recientemente. Análisis posteriores han demostrado que N. equitans divergió temprano en la evolución de Archaea, como lo indica la secuencia de ARNr 16S . Esto sugiere que ocupan una posición de ramificación profunda dentro de este grupo. [7]

La taxonomía actualmente aceptada se basa en la Lista de nombres procariotas con relevancia en la nomenclatura (LPSN) [8] y el Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI). [9]

Nanoarqueo equitans

Características

Las células de N. equitans son esféricas con un diámetro de aproximadamente 400 nm , [2] y tienen una secuencia de ADN muy corta y compacta con todo el genoma conteniendo sólo 490.885 pares de bases . [6] Aunque tienen el código genético para llevar a cabo el procesamiento y la reparación, no pueden llevar a cabo ciertos procesos biosintéticos y metabólicos como la síntesis de lípidos, aminoácidos, cofactores o nucleótidos . [6] Debido a su maquinaria limitada, es un parásito obligado, el único conocido en las Archaea. [6] Debido a sus secuencias inusuales de ARNr ss, son difíciles de detectar utilizando métodos estándar de reacción en cadena de la polimerasa . [21] Las células de N. equitans contienen una capa S normal con simetría séxtuple con una constante reticular de 15 nm. [21]

Estructura del genoma

Las nanoarqueotas se caracterizan por células pequeñas de entre 100 y 400 nm de diámetro y genomas altamente aerodinámicos de 0,491-0,606 Mbp. [22] Los genomas de las nanoarqueotas descritas muestran diferentes grados de reducción, lo que es compatible con un estilo de vida dependiente del huésped. [23] Ciertas nanoarqueotas aún tienen genes para los sistemas CRISPR-Cas , los flagelos arqueológicos y la vía de la gluconeogénesis . [24]

Hábitat

Los nanoarqueotas son simbiontes obligados que crecen unidos a un huésped arqueológico conocido como Ignicoccus . [25] Tanto las fuentes termales terrestres como los respiraderos hidrotermales submarinos han producido aislados en el género Nanoarchaeum . [26] Sin embargo, existe evidencia de que los nanoarqueotas residen en una variedad de hábitats fuera de los respiraderos termales marinos. [3]   Se ha descubierto que la evidencia genética de los miembros de Nanoarchaeota es omnipresente en las fuentes termales terrestres y los hábitats hipersalinos mesófilos utilizando cebadores creados con base en la secuencia del gen 16S rRNA de Nanoarchaeum equitans . [3] Además, el descubrimiento de secuencias ribosómicas en muestras de agua de la zona fótica tomadas lejos de los respiraderos hidrotermales plantea la posibilidad de que Nanoarchaeota sea un grupo ubicuo y diversificado de Archaea que puede vivir en hábitats con una variedad de temperaturas y entornos geoquímicos. [3]

Metabolismo

Aunque se desconoce gran parte del metabolismo de los miembros de Nanoarchaeota, su huésped es un autótrofo que crece con azufre elemental como aceptor de electrones y H 2 como donante de electrones . [26] La mayoría de los procesos metabólicos reconocidos, como la creación de monómeros como aminoácidos, nucleótidos y coenzimas , carecen de genes reconocibles en este organismo. [26]

Véase también

Referencias

  1. ^ Véase la página web del NCBI sobre Nanoarchaeota. Datos extraídos de los "Recursos de taxonomía del NCBI". Centro Nacional de Información Biotecnológica . Consultado el 19 de marzo de 2007 .
  2. ^ abcd Huber, Harald; Hohn, Michael J.; Rachel, Reinhard; Fuchs, Tanja; Wimmer, Verena C.; Stetter, Karl O. (mayo de 2002). "Un nuevo filo de Archaea representado por un simbionte hipertermofílico de tamaño nanométrico". Nature . 417 (6884): 63–67. Bibcode :2002Natur.417...63H. doi :10.1038/417063a. ISSN  1476-4687. PMID  11986665. S2CID  4395094.
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Lectura adicional

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