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Nanohaloarqueas

Las nanohaloarchaea son un clado de arqueas diminutas con genomas pequeños y capacidades metabólicas limitadas, pertenecientes a las arqueas DPANN . Son ubicuas en hábitats hipersalinos , que comparten con las haloarchaea extremadamente halófilas .

Las nanohaloarchaea se identificaron por primera vez a partir de datos metagenómicos como una clase de arqueas halófilas no cultivadas compuestas por 6 clados [1] [2] y posteriormente se colocaron en el filo Nanohaloarchaeota dentro del superfilo Diapherotrites, Parvarchaeota, Aenigmarchaeota, Nanoarchaeota , Nanohaloarchaeota ( DPANN ) . [3] Sin embargo, la posición filogenética de las nanohaloarchaea aún es muy debatida, y se propone alternativamente como el linaje hermano de las haloarchaea o un miembro del superfilo DPANN. [4] [5] [6]

Desde entonces, el linaje se ha identificado en datos de una variedad de entornos hipersalinos, incluidos: el lago talasohalino australiano, [7] la salina española, [8] la salmuera de soda rusa, [9] la salina californiana, [10] la halita chilena, [11] y el sistema hidrotermal Dallol etíope . [12]

Taxonomía

La taxonomía actualmente aceptada se basa en la Lista de nombres procariotas con relevancia en la nomenclatura (LPSN) [13] y el Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI). [14]

Corrección del filo "Nanohaloarchaeota" . Rinke et al. 2013

Referencias

  1. ^ Narasingarao; et al. (2011). "El ensamblaje metagenómico de novo revela un linaje importante y abundante de arqueas en comunidades microbianas hipersalinas". ISME J . 6 (1): 81–93. doi :10.1038/ismej.2011.78. PMC  3246234 . PMID  21716304.
  2. ^ Ghai, Rohit; Lejla Pašić; Ana Beatriz Fernandez; Ana-Belen Martin-Cuadrado; et al. (10 de octubre de 2011). "Nuevos grupos microbianos abundantes en ambientes acuáticos hipersalinos". Scientific Reports . 1 : 135. Bibcode :2011NatSR...1E.135G. doi :10.1038/srep00135. PMC 3216616 . PMID  22355652. 
  3. ^ Rinke C, Schwientek P, Sczyrba A, Ivanova NN, Anderson IJ, Cheng JF, Darling A, Malfatti S, Swan BK, Gies EA, Dodsworth JA, Hedlund BP, Tsiamis G, Sievert SM, Liu WT, Eisen JA, Hallam SJ, Kyrpides NC, Stepanauskas R, Rubin EM, Hugenholtz P, Woyke T (25 de julio de 2013). "Información sobre la filogenia y el potencial de codificación de la materia oscura microbiana". Nature . 499, 431–437 (2013) (7459): 431–437. Bibcode :2013Natur.499..431R. doi : 10.1038/nature12352 . hdl : 10453/27467 . Número de modelo:  PMID23851394.{{cite journal}}: CS1 maint: varios nombres: lista de autores ( enlace )
  4. ^ Petitjean, C.; Deschamps, P.; López-García, P.; Moreira, D. (2014). "El enraizamiento del dominio Archaea mediante análisis filogenómico apoya la fundación del nuevo reino Proteoarchaeota". Genome Biol. Evol . 7 (1): 191–204. doi :10.1093/gbe/evu274. PMC 4316627 . PMID  25527841. 
  5. ^ Cavalier-Smith, Thomas; Chao, Ema E-Yung (2020). "Árboles proteicos ribosomales multidominio y el origen planctobacteriano de neomura (eucariotas, arqueobacterias)". Protoplasma . 257 (3): 621–753. doi :10.1007/s00709-019-01442-7. PMC 7203096 . PMID  31900730. 
  6. ^ Monique Aouad, Najwa Taïb, Anne Oudart, Michel Lecocq, Manolo Gouy, Céline Brochier-Armanet (21 de abril de 2018). "Las arqueas halófilas extremas derivan de dos linajes distintos de metanógeno Clase II" (PDF) . Filogenética molecular y evolución . 2018 (27). Elsevier: 46–54. doi :10.1016/j.ympev.2018.04.011. PMID  29684598. S2CID  25111200.{{cite journal}}: CS1 maint: varios nombres: lista de autores ( enlace )
  7. ^ Karen Andrade, Jörn Logemann, Karla B Heidelberg, Joanne B Emerson, Luis R Comolli, Laura A Hug, Alexander J Probst, Angus Keillar, Brian C Thomas, Christopher S Miller, Eric E Allen, John W Moreau, Jochen J Brocks y Jillian F Banfield (28 de abril de 2015). "Los análisis metagenómicos y lipídicos revelan un ciclo diario en un ecosistema microbiano hipersalino". ISME J . ISME J 9, 2697–2711 (2015) (12): 2697–2711. doi : 10.1038/ismej.2015.66 . PMC 4817636 . PMID  25918833. {{cite journal}}: CS1 maint: varios nombres: lista de autores ( enlace )
  8. ^ Rohit Ghai, Lejla Pašić, Ana Beatriz Fernández, Ana-Belen Martin-Cuadrado, Carolina Megumi Mizuno, Katherine D. McMahon, R. Thane Papke, Ramunas Stepanauskas, Beltran Rodriguez-Brito, Forest Rohwer, Cristina Sánchez-Porro, Antonio Ventosa & Francisco Rodríguez-Valera (31 de octubre de 2011). "Nuevos grupos microbianos abundantes en ambientes acuáticos hipersalinos". Informes científicos . 1 (Sci Rep 1, 135 (2011)): 135. Bibcode : 2011NatSR...1E.135G. doi : 10.1038/srep00135 . PMC 3216616 . PMID  22355652. {{cite journal}}: CS1 maint: varios nombres: lista de autores ( enlace )
  9. ^ Vavourakis Charlotte D., Ghai Rohit, Rodriguez-Valera Francisco, Sorokin Dimitry Y., Tringe Susannah G., Hugenholtz Philip, Muyzer Gerard (25 de febrero de 2016). "Perspectivas metagenómicas sobre la diversidad no cultivada y la fisiología de los microbios en cuatro salmueras hipersalinas de lagos de soda". Frontiers in Microbiology . 7 : 211. doi : 10.3389/fmicb.2016.00211 . PMC 4766312 . PMID  26941731. {{cite journal}}: CS1 maint: varios nombres: lista de autores ( enlace )
  10. ^ Olga Zhaxybayeva 1 , Ramunas Stepanauskas, Nikhil Ram Mohan, R Thane Papke (29 de enero de 2013). "Análisis de clasificación celular de entornos hipersalinos separados geográficamente". Extremófilos . 17, 2 (2013) (2): 265–275. doi :10.1007/s00792-013-0514-z. PMID  23358730. S2CID  5933801 . Consultado el 2 de marzo de 2021 .{{cite journal}}: CS1 maint: nombres múltiples: lista de autores ( enlace ) CS1 maint: nombres numéricos: lista de autores ( enlace )
  11. ^ Alexander Crits‐Christoph Diego R. Gelsinger Bing Ma Jacek Wierzchos Jacques Ravel Alfonso Davila M. Cristina Casero Jocelyne DiRuggiero (21 de marzo de 2016). "Interacciones funcionales de arqueas, bacterias y virus en una comunidad endolítica hipersalina". Microbiología ambiental . 18 (2016 v.18 no.6): 2064–2077. doi :10.1111/1462-2920.13259. PMID  26914534 . Consultado el 2 de marzo de 2021 .
  12. ^ Gómez, Felipe; Cavalazzi, Bárbara; Rodríguez, Nuria; Amils, Ricardo; Ori, Gian Gabriele; Olsson-Francis, Karen; Escudero, Cristina; Martínez, José M.; Miruts, Hagos (27 de mayo de 2019). "Microorganismos ultrapequeños en las condiciones poliextremas del volcán Dallol, norte de Afar, Etiopía". Informes científicos . 9 (1): 7907. Código bibliográfico : 2019NatSR...9.7907G. doi :10.1038/s41598-019-44440-8. ISSN  2045-2322. PMC 6536532 . PMID  31133675. 
  13. ^ JP Euzéby. "Filo "Candidatus Nanohaloarchaeota"". Lista de nombres procariotas con posición en la nomenclatura (LPSN) . Consultado el 17 de noviembre de 2011 .
  14. ^ Sayers; et al. "Nanohaloarchaea". Base de datos de taxonomía del Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI) . Consultado el 5 de junio de 2011 .
  15. ^ "GTDB release 08-RS214". Base de datos de taxonomía del genoma . Consultado el 6 de diciembre de 2021 .
  16. ^ "ar53_r214.sp_label". Base de datos de taxonomía del genoma . Consultado el 10 de mayo de 2023 .
  17. ^ "Historia del taxón". Base de datos de taxonomía del genoma . Consultado el 6 de diciembre de 2021 .
  18. ^ La Cono; et al. (2020). "La simbiosis entre nanohaloarchaeon y haloarchaeon se basa en la utilización de diferentes polisacáridos". Proc Natl Acad Sci USA . 117 (33): 20223–20234. Bibcode :2020PNAS..11720223L. doi : 10.1073/pnas.2007232117 . PMC 7443923 . PMID  32759215. 

Lectura adicional


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