El marco de lectura abierto 58 del cromosoma 16 , o C16orf58 , también conocido como FLJ13638 , es una proteína que en los seres humanos está codificada por el gen C16orf58 . [5] El gen en sí tiene una longitud de 18.892 pb, con un ARNm de 2.760 pb y una secuencia proteica de 468 aminoácidos . Hay un dominio conservado de origen desconocido, DUF647. Todavía no se ha determinado ninguna función para este gen, pero se predice que reside en el retículo endoplasmático en el citoplasma . [6]
El C16orf58 tiene una conservación muy interesante, ya que tiene ortólogos que se remontan a plantas y hongos . Sin embargo, no se ha encontrado en reptiles , aves o anfibios . La siguiente tabla muestra algunos, pero no todos, los ortólogos que se encontraron utilizando BLAST. [7]
Aunque aún se desconoce su función, se ha demostrado que C16orf58 interactúa con tres proteínas diferentes:
Aunque hay varios sitios que darán predicciones sobre la estructura de la proteína, C16orf58 aún no tiene una estructura conocida. Dicho esto, hay al menos un dominio transmembrana , si no más. Dentro de la estructura de la proteína hay varias áreas extendidas con aminoácidos sin carga, estos podrían ser posibles dominios transmembrana o núcleos hidrofóbicos . [6] A continuación se muestra la carga de cada uno de los aminoácidos en la secuencia de la proteína, + para positivo, - para negativo y 0 para sin carga. Tenga en cuenta que los grandes segmentos de aminoácidos sin carga aparecen en negrita. Estos tramos de aminoácidos sin carga se conservan a través de ortólogos distantes.
1 00—000-00 000-00000- 0+00+000-0 0000-0000+ 00000+0000 +0-0+-00-0 61 0000000000 0000000000 000 -0000-0 000000- 000 0000000000 0000000000 121 0000 +00000 0000000+-0 00000+0000 00+00+0-00 +000-0 00-00000-0 181 0000000000 000000000 + 0000000000 +00000000+ +0000-000+ -000- 00000 241 0000000000 0000000000 0000000000 000000 +00+ 0000-0 00-0 +0+000+000 301 0+0-00-000 00+0- 00000 0000000000 0000 +00000 0-00000-00 0-000000-0 361 0000000000 0+000+000+ 0000000000 000-00000- 0—0+0+0+0 00++-00000 421 +-00-00-00 00+00+000- 000+0-+000 -00-0+0000 000-++00