stringtranslate.com

Variante theta del SARS-CoV-2

La variante theta , también conocida como linaje P.3 , [a] es una de las variantes del SARS-CoV-2 , el virus que causa la COVID-19 . La variante se identificó por primera vez en Filipinas el 18 de febrero de 2021, cuando se detectaron dos mutaciones preocupantes en Visayas centrales . [1] Se detectó en Japón el 12 de marzo de 2021, cuando un viajero procedente de Filipinas llegó al Aeropuerto Internacional de Narita en Tokio . [2]

Se diferencia de las que se descubrieron por primera vez en el Reino Unido, Sudáfrica y Brasil, y se cree que plantea una amenaza similar. La variante es más resistente a los anticuerpos neutralizantes , incluidos los obtenidos mediante la vacunación, como parecen ser las variantes sudafricana y brasileña. [3]

Según el esquema de nombres simplificado propuesto por la Organización Mundial de la Salud , P.3 ha sido etiquetada como variante Theta y se consideró una variante de interés (VOI), pero no una variante de preocupación . [4]

A partir de julio de 2021, la OMS ya no considera a Theta como una variante de interés. [4]

Clasificación

Nombramiento

El 17 de marzo de 2021, Public Health England (PHE) denominó a Lineage P.3 VUI-21MAR-02 . [5]

El 1 de junio de 2021, la Organización Mundial de la Salud (OMS) nombró al linaje P.3 como variante Theta. [6]

Mutaciones

Se observó un total de 14 reemplazos de aminoácidos en todas las muestras (etiquetadas en rojo a continuación), incluidas siete mutaciones de la proteína de la espiga . Entre las mutaciones de la proteína de la espiga, cuatro se han asociado previamente con linajes de preocupación (es decir, E484K, N501Y, D614G y P681H), mientras que se observaron tres reemplazos adicionales hacia la región C-terminal de la proteína (es decir, E1092K, H1101Y y V1176F). También se encontró un solo reemplazo de aminoácido en el extremo N de ORF8 (es decir, K2Q) en todas las muestras. Se observaron otras tres mutaciones en 32 de las 33 muestras (etiquetadas en verde ) incluida una deleción de tres aminoácidos en las posiciones de la proteína de la espiga 141 a 143. Por último, también se detectaron cinco mutaciones sinónimas (etiquetadas en gris ) en todos los casos. [8]

Historia

El 18 de febrero de 2021, el Departamento de Salud de Filipinas confirmó la detección de dos mutaciones de COVID-19 en Visayas Centrales después de que se enviaran muestras de pacientes para que se les realizara una secuenciación genómica. Las mutaciones fueron posteriormente denominadas E484K y N501Y, que se detectaron en 37 de las 50 muestras, y ambas mutaciones coexistían en 29 de ellas. No había nombres oficiales para las variantes y aún no se había identificado la secuencia completa. [1]

El 12 de marzo de 2021, Japón detectó la variante en un viajero procedente de Filipinas. [2]

El 13 de marzo de 2021, el Departamento de Salud confirmó que las mutaciones constituían una nueva variante, que se denominó linaje P.3. Ese mismo día, también confirmó su primer caso de linaje P.1 en el país. Aunque los linajes P.1 y P.3 provienen del mismo linaje B.1.1.28, el departamento dijo que aún no se ha determinado el impacto del linaje P.3 en la eficacia y transmisibilidad de la vacuna. [10]

El 17 de marzo de 2021, el Reino Unido confirmó sus dos primeros casos, que Public Health England (PHE) denominó VUI-21MAR-02. [11]

El 30 de abril de 2021, Malasia detectó 8 casos del linaje P.3 en Sarawak . [12]

Estadística

Véase también

Notas

  1. ^ Otros nombres incluyen:
    VUI-21MAR-02
    Linaje B.1.1.28.3
    Variante filipina
  2. ^ Casos en Hong Kong .

Referencias

  1. ^ ab News, CNN Filipinas (18 de febrero de 2021). "El DOH confirma nuevas mutaciones de COVID-19 en Visayas centrales". Archivado desde el original el 26 de noviembre de 2021. Consultado el 2 de mayo de 2021 . {{cite news}}: |last=tiene nombre genérico ( ayuda )
  2. ^ ab News, Kyodo (12 de marzo de 2021). «Se encontró una nueva variante del coronavirus en un viajero de Filipinas: Japón» . Consultado el 2 de mayo de 2021 . {{cite news}}: |last=tiene nombre genérico ( ayuda )
  3. ^ Noticias, Japan Times (12 de marzo de 2021). «Las autoridades japonesas descubren una nueva variante del coronavirus en un viajero procedente de Filipinas». Archivado desde el original el 4 de mayo de 2021. Consultado el 2 de mayo de 2021 . {{cite news}}: |last=tiene nombre genérico ( ayuda )
  4. ^ ab "Seguimiento de las variantes del SARS-CoV-2". who.int . Organización Mundial de la Salud.
  5. ^ "Variantes: distribución de datos de casos". gov.uk . Servicio digital del gobierno .
  6. ^ "Seguimiento de las variantes del SARS-CoV-2". 1 de junio de 2021 . Consultado el 1 de junio de 2021 .
  7. ^ "Variantes de Spike: variante Theta, también conocida como B.1.128". covdb.stanford.edu . Base de datos de resistencia y antivirales del coronavirus de la Universidad de Stanford . 1 de julio de 2021 . Consultado el 5 de julio de 2021 .
  8. ^ Centro, Philippine Genome. "Boletín PGC SARS-CoV-2 n.º 7: Detección y caracterización de un nuevo linaje P.3 del SARS-CoV-2, con mutaciones de la proteína de pico E484K, N501Y, P681H y deleción de LGV 141-143, a partir de muestras secuenciadas a través del programa intensificado de biovigilancia UP-PGC, UP-NIH y DOH". Philippine Genome Center .
  9. ^ ab "Informe de linaje P.3". outbreak.info .
  10. ^ Noticias, ABS-CBN (13 de marzo de 2021). "El DOH confirma la nueva variante de COVID-19 detectada por primera vez en Filipinas, primer caso de la variante de Brasil" . Consultado el 2 de mayo de 2021 . {{cite news}}: |last=tiene nombre genérico ( ayuda )
  11. ^ Noticias, Rappler (17 de marzo de 2021). «Inglaterra informa de 2 casos de una nueva variante de COVID-19 encontrada en Filipinas» . Consultado el 2 de mayo de 2021 . {{cite news}}: |last=tiene nombre genérico ( ayuda )
  12. ^ "Covid-19: Sarawak detecta variante reportada en Filipinas". 30 de abril de 2021. Consultado el 30 de abril de 2021 .
  13. ^ "Linajes de PANGO". cov-lineages.org . Archivado desde el original el 2021-05-05 . Consultado el 2021-05-02 .
  14. ^ "Panel de control de COVID-19 de Regeneron". covid19dashboard.regeneron.com . Consultado el 27 de agosto de 2021 .
  15. ^ Lopez, Virgil (29 de septiembre de 2021). "El DOH detecta 339 casos adicionales de la variante Delta". GMA News . Consultado el 1 de octubre de 2021 .
  16. ^ Pei Pei, Goh (8 de julio de 2021). "Variante Delta detectada en Sarawak" . Consultado el 13 de julio de 2021. Dijo que en el caso de la variante Theta, se habían detectado seis casos en Kuching y siete en Kota Samarahan .
  17. ^ "Variantes: distribución de los datos de casos, 13 de agosto de 2021". 13 de agosto de 2021 . Consultado el 13 de agosto de 2021 .
  18. ^ "Variantes en los Países Bajos". rivm.nl . Consultado el 16 de julio de 2021 .

Enlaces externos