Especies de arqueón
Aeropyrum pernix es una especie de arquea extremófila del filo arqueal Thermoproteota . Es una especie obligatoriamente termófila . Los primeros ejemplares fueron aislados de sedimentos en el mar frente a las costas de Japón .
Descubrimiento
Aeropyrum pernix fue la primera arquea hipertermófila estrictamente aeróbica descubierta. Originalmente se aisló de sedimentos marinos calentados y agua de ventilación recolectada en 1996 de un respiradero solfatárico en la isla Kodakara-jima en Kyūshū , Japón . [1]
Estructura del genoma
Su genoma completo fue secuenciado en 1999 y tiene un tamaño de 1.669 kilobases, con 2.694 posibles genes detectados. [2] Se encontraron todos los genes en el ciclo del TCA excepto el de la α-cetoglutarato deshidrogenasa . En su lugar, se identificaron los genes que codifican las dos subunidades de la 2-oxoácido:ferredoxina oxidorreductasa.
Propiedades
Las células de Aeropyrum pernix tienen forma esférica y aproximadamente 1 μm de diámetro. La envoltura que rodea las células de Aeropyrum tiene unos 25 nm de ancho. El organismo crece a una temperatura entre 70 y 100 °C (óptima, 90 a 95 °C), a un pH de 5 a 9 (óptimo, pH 7) y a una salinidad del 1,8 al 7% (óptima, 3,5% de salinidad). El crecimiento de los organismos no se detecta a 68 o 102 °C. Por debajo del 1,5% de salinidad, las células se lisan por choque osmótico bajo. Las células de los organismos son sensibles al cloranfenicol e insensibles a la ampicilina , la vancomicina y la cicloserina . Crece bien sobre sustancias proteicas , con un tiempo de duplicación en estas condiciones de unos 200 minutos. [1] Esta especie carece de genes para la biosíntesis de nucleótidos de purina y, por lo tanto, depende de fuentes ambientales para satisfacer sus necesidades de purina. [3]
Referencias
- ^ ab Sako Y, Nomura N, Uchida A, et al. (1996). "Aeropyrum pernix gen. nov., sp. nov., una nueva arqueona hipertermófila aeróbica que crece a temperaturas de hasta 100 grados C". En t. J. Sistema. Bacteriol . 46 (4): 1070–7. doi : 10.1099/00207713-46-4-1070 . PMID 8863437.
- ^ Kawarabayasi Y, Hino Y, Horikawa H, et al. (1999). "Secuencia completa del genoma de un crenarchaeon hipertermófilo aeróbico, Aeropyrum pernix K1". Res. ADN . 6 (2): 83–101, 145–52. doi : 10.1093/dnares/6.2.83 . PMID 10382966.
- ^ Marrón, Anne M; Hoopes, Samantha L; Blanco, Robert H; Sarisky, Catherine A (14 de diciembre de 2011). "Biosíntesis de purinas en arqueas: variaciones sobre un tema". Biología Directa . 6 : 63. doi : 10.1186/1745-6150-6-63 . ISSN 1745-6150. PMC 3261824 . PMID 22168471.
Otras lecturas
- Bhuiya, Mohammad Wadud; Suryadi, Jimmy; Zhou, Zholi; Brown, Bernard Andrew II (5 de agosto de 2013). "Estructura de la proteína multifuncional Aeropyrum pernix L7Ae y conocimiento de su extrema termoestabilidad". Acta Crystallographica Sección F. 69 (parte 9): 979–988. doi :10.1107/S1744309113021799. PMC 3758144 . PMID 23989144.
- Daifuku, Takashi; Yoshida, Takashi; Takayuki, Kitamura; Kawaichi, Satoshi; Inoue, Takahiro; Nomura, Keigo; Yoshida, Yui; Kuno, Sotaro; Sako, Yoshihiko (19 de julio de 2013). "Variación de los elementos relacionados con virus dentro de los genomas sinténicos del hipertermófilo Archaeon Aeropyrum". Aplica. Reinar. Microbiol . 79 (19): 5891–8. Código Bib : 2013ApEnM..79.5891D. doi :10.1128/AEM.01089-13. PMC 3811351 . PMID 23872576.
- Lee, Pyung Cheon; Mijts, Benjamín N.; Petri, Ralf; Watts, Kevin T.; Schmidt-Dannert, Claudia (16 de junio de 2004). "Alteración de la especificidad del producto de Aeropyrum pernix farnesilgeranil difosfato sintasa (Fgs) por evolución dirigida". Diseño y selección de ingeniería de proteínas . 17 (11): 771–777. doi : 10.1093/proteína/gzh089 . PMID 15548566.
- Ota, Ajda; Gmajner, Dejan; Sentijurc, Marjeta; Ulrih, Natasa Poklar (13 de abril de 2012). "Efecto del pH del medio de crecimiento de Aeropyrum peering sobre las propiedades estructurales y la fluidez de los arqueosomas". Arqueas . 2012 : 9.doi : 10.1155 /2012/285152 . PMC 3384975 . PMID 22778670.
- Sakuraba, Haruhiko; Satoura, Takenori; Kawakam, Ryushi; Kim, Kwang; Kara, Yusuke; Yoneda, Kazunari; Ohshima, Toshihisa (16 de abril de 2012). "Estructura cristalina de una nueva L-prolina deshidrogenasa ligada a colorante del hipertermófilo Archaeon Aeropyrum Pernix". La Revista de Química Biológica . 287 (24): 20070-20080. doi : 10.1074/jbc.M111.319038 . PMC 3370190 . PMID 22511758.
enlaces externos
- Tipo de cepa de Aeropyrum pernix en BacDive - la metadatos de diversidad bacteriana
- Genoma KEGG: Aeropyrum pernix